86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2246 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2246  protein of unknown function DUF75  100 
 
 
283 aa  563  1e-160  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.640776  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2009  protein of unknown function DUF75  69.4 
 
 
285 aa  375  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.547664  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20950  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  62.18 
 
 
306 aa  351  1e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.344012  normal  0.641113 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1480  protein of unknown function DUF75  63.94 
 
 
283 aa  343  2e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1842  protein of unknown function DUF75  61.45 
 
 
294 aa  320  1.9999999999999998e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.316011  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5919  hypothetical protein  56.88 
 
 
284 aa  318  7.999999999999999e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239178  normal  0.0316841 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2630  hypothetical protein  55.96 
 
 
282 aa  315  7e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2169  hypothetical protein  58.49 
 
 
301 aa  313  9.999999999999999e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0362139  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1912  protein of unknown function DUF75  57.36 
 
 
301 aa  312  4.999999999999999e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000183665 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1173  hypothetical protein  55.19 
 
 
283 aa  307  1.0000000000000001e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1855  hypothetical protein  55.22 
 
 
284 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.982924 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1196  protein of unknown function DUF75  55.02 
 
 
296 aa  298  5e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00179103  normal  0.0638399 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1548  protein of unknown function DUF75  55.22 
 
 
279 aa  293  2e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.831749  normal  0.218022 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1826  hypothetical protein  56.3 
 
 
281 aa  291  1e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0638514  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2290  protein of unknown function DUF75  55.79 
 
 
286 aa  290  2e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00121228  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2670  protein of unknown function DUF75  52.4 
 
 
286 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.361609  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2640  hypothetical protein  54.34 
 
 
280 aa  276  3e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.512604  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22220  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  51.82 
 
 
290 aa  275  7e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165906  normal  0.737687 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4890  hypothetical protein  52.83 
 
 
280 aa  275  7e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.469947  normal  0.0846818 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2444  protein of unknown function DUF75  50.9 
 
 
288 aa  273  2.0000000000000002e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2210  protein of unknown function DUF75  51.71 
 
 
298 aa  271  7e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5396  protein of unknown function DUF75  53.51 
 
 
302 aa  266  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.380305  normal  0.382515 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3052  hypothetical protein  49.26 
 
 
292 aa  265  5.999999999999999e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2143  protein of unknown function DUF75  49.45 
 
 
301 aa  265  8e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0211773  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3150  hypothetical protein  48.91 
 
 
296 aa  265  8.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0142521  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3212  hypothetical protein  48.91 
 
 
296 aa  265  8.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.550185  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2170  hypothetical protein  48.15 
 
 
289 aa  262  4e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.260059  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2785  protein of unknown function DUF75  50.36 
 
 
286 aa  262  4.999999999999999e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000787132  hitchhiker  0.0000705422 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3475  hypothetical protein  48.72 
 
 
296 aa  262  4.999999999999999e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3162  hypothetical protein  48.54 
 
 
296 aa  261  6.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13900  ATP-grasp superfamily enzyme  50.19 
 
 
286 aa  260  2e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.331595  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11820  ATP-grasp superfamily enzyme  48.75 
 
 
316 aa  258  6e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0485047  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2324  hypothetical protein  47.78 
 
 
289 aa  258  7e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.102651  decreased coverage  0.000172466 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12157  hypothetical protein  48.56 
 
 
292 aa  257  2e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00120164  normal  0.853503 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16230  Protein of unknown function DUF75  47.17 
 
 
269 aa  248  1e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.186088  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4500  hypothetical protein  44.91 
 
 
282 aa  238  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00701907 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5826  protein of unknown function DUF75  41.94 
 
 
297 aa  215  5e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22756  normal  0.126375 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1077  hypothetical protein  40.29 
 
 
299 aa  207  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.370003  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0888  protein of unknown function DUF75  37.99 
 
 
311 aa  185  8e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0447  hypothetical protein  31.25 
 
 
277 aa  157  2e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000016468  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1837  protein of unknown function DUF75  34.32 
 
 
284 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1825  protein of unknown function DUF75  28 
 
 
311 aa  101  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16730  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  26.67 
 
 
348 aa  97.4  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.448913 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1509  protein of unknown function DUF75  29.58 
 
 
311 aa  96.7  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0466221  normal  0.187119 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2232  protein of unknown function DUF75  25.99 
 
 
342 aa  95.1  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.553046  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2852  hypothetical protein  26.24 
 
 
311 aa  93.2  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3951  hypothetical protein  25.71 
 
 
330 aa  92  9e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.731534 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2162  hypothetical protein  24.01 
 
 
334 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.530975  hitchhiker  0.00210211 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2219  hypothetical protein  24.01 
 
 
334 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.849197  normal  0.221625 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2173  hypothetical protein  24.01 
 
 
334 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2427  protein of unknown function DUF75  27.27 
 
 
315 aa  90.9  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175054  normal  0.221308 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3209  hypothetical protein  27.07 
 
 
312 aa  90.1  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1247  hypothetical protein  30.33 
 
 
312 aa  89  9e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0984474 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14850  ATP-grasp superfamily enzyme  25.55 
 
 
307 aa  88.6  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5325  protein of unknown function DUF75  28.67 
 
 
298 aa  87  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2446  hypothetical protein  23.91 
 
 
329 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.211453 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2127  protein of unknown function DUF75  28.11 
 
 
316 aa  85.1  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12728  hypothetical protein  26.45 
 
 
324 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3749  hypothetical protein  22.91 
 
 
301 aa  85.5  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0709366  normal  0.107675 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0926  hypothetical protein  24.29 
 
 
313 aa  83.6  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4966  protein of unknown function DUF75  25.09 
 
 
304 aa  83.2  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22940  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  27.34 
 
 
312 aa  83.6  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.15902 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5208  hypothetical protein  27.18 
 
 
307 aa  82.8  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00169383  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13300  Protein of unknown function DUF75  26.86 
 
 
318 aa  82  0.000000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00661171  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15610  Protein of unknown function DUF75  25.53 
 
 
353 aa  81.6  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1579  protein of unknown function DUF75  27.3 
 
 
314 aa  81.6  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.255791  normal  0.548098 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6868  hypothetical protein  25.35 
 
 
302 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455453  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10660  Protein of unknown function DUF75  25.42 
 
 
325 aa  80.5  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.120435  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5648  protein of unknown function DUF75  21.48 
 
 
307 aa  79.3  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961809  normal  0.424673 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0028  hypothetical protein  25.76 
 
 
310 aa  79.3  0.00000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1722  hypothetical protein  26.23 
 
 
306 aa  78.2  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.901753  decreased coverage  0.000637714 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1737  hypothetical protein  26.23 
 
 
306 aa  75.1  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.226503  normal  0.890937 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1608  protein of unknown function DUF75  22.34 
 
 
312 aa  73.9  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000205047 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2326  hypothetical protein  22.74 
 
 
301 aa  72.4  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677789  normal  0.402322 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1614  hypothetical protein  21.99 
 
 
312 aa  71.2  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00125325  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1266  protein of unknown function DUF75  23.02 
 
 
312 aa  70.9  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.825703  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1658  protein of unknown function DUF75  25.78 
 
 
304 aa  69.7  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525262  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1060  protein of unknown function DUF75  23.3 
 
 
310 aa  65.1  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.419014  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_466  hypothetical protein  23.89 
 
 
276 aa  61.6  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.841701  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0525  hypothetical protein  23.89 
 
 
276 aa  60.5  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.902286  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0501  hypothetical protein  23.48 
 
 
276 aa  58.9  0.00000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.686369  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0799  hypothetical protein  26.29 
 
 
268 aa  57  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.515819  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0798  protein of unknown function DUF75  23.73 
 
 
319 aa  55.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_786  hypothetical protein  26.32 
 
 
278 aa  45.8  0.0009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_787  hypothetical protein  22.99 
 
 
302 aa  44.7  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0915  hypothetical protein  28.32 
 
 
268 aa  42.7  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.111337  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>