79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_15610 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_15610  Protein of unknown function DUF75  100 
 
 
353 aa  701    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16730  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  35.08 
 
 
348 aa  192  8e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.448913 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0028  hypothetical protein  36.36 
 
 
310 aa  183  3e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1825  protein of unknown function DUF75  34.02 
 
 
311 aa  180  4e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3951  hypothetical protein  33.22 
 
 
330 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.731534 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2427  protein of unknown function DUF75  35.86 
 
 
315 aa  177  3e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175054  normal  0.221308 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1509  protein of unknown function DUF75  36.13 
 
 
311 aa  176  7e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0466221  normal  0.187119 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1614  hypothetical protein  34.88 
 
 
312 aa  175  8e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00125325  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2173  hypothetical protein  34.06 
 
 
334 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2162  hypothetical protein  34.06 
 
 
334 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.530975  hitchhiker  0.00210211 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2219  hypothetical protein  34.06 
 
 
334 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.849197  normal  0.221625 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2326  hypothetical protein  35.55 
 
 
301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677789  normal  0.402322 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2446  hypothetical protein  33.33 
 
 
329 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.211453 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3749  hypothetical protein  36.21 
 
 
301 aa  172  7.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0709366  normal  0.107675 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1608  protein of unknown function DUF75  33.77 
 
 
312 aa  170  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000205047 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5648  protein of unknown function DUF75  35.14 
 
 
307 aa  169  7e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961809  normal  0.424673 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1658  protein of unknown function DUF75  36.46 
 
 
304 aa  168  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525262  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14850  ATP-grasp superfamily enzyme  34.31 
 
 
307 aa  167  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6868  hypothetical protein  34.92 
 
 
302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455453  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2232  protein of unknown function DUF75  31.77 
 
 
342 aa  164  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.553046  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2852  hypothetical protein  32.88 
 
 
311 aa  160  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1722  hypothetical protein  34.71 
 
 
306 aa  160  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.901753  decreased coverage  0.000637714 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1737  hypothetical protein  34.71 
 
 
306 aa  157  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.226503  normal  0.890937 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5325  protein of unknown function DUF75  33.45 
 
 
298 aa  156  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2127  protein of unknown function DUF75  36.84 
 
 
316 aa  155  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4966  protein of unknown function DUF75  31.74 
 
 
304 aa  155  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0926  hypothetical protein  32.05 
 
 
313 aa  154  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12728  hypothetical protein  35.61 
 
 
324 aa  152  7e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1579  protein of unknown function DUF75  31.89 
 
 
314 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.255791  normal  0.548098 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22940  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  32.57 
 
 
312 aa  145  8.000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.15902 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1266  protein of unknown function DUF75  32.61 
 
 
312 aa  145  9e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.825703  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1247  hypothetical protein  32.28 
 
 
312 aa  144  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0984474 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13300  Protein of unknown function DUF75  31.31 
 
 
318 aa  145  2e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00661171  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0798  protein of unknown function DUF75  31.74 
 
 
319 aa  144  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5208  hypothetical protein  30.34 
 
 
307 aa  138  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00169383  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10660  Protein of unknown function DUF75  29.56 
 
 
325 aa  124  3e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.120435  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1077  hypothetical protein  29.3 
 
 
299 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.370003  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2444  protein of unknown function DUF75  30.22 
 
 
288 aa  107  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1060  protein of unknown function DUF75  25.45 
 
 
310 aa  106  6e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.419014  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16230  Protein of unknown function DUF75  29.1 
 
 
269 aa  97.4  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.186088  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4500  hypothetical protein  28.41 
 
 
282 aa  96.7  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00701907 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1826  hypothetical protein  27.99 
 
 
281 aa  94.7  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0638514  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3475  hypothetical protein  26.99 
 
 
296 aa  92.8  8e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22220  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  26.52 
 
 
290 aa  92.4  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165906  normal  0.737687 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1480  protein of unknown function DUF75  29.29 
 
 
283 aa  91.3  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2324  hypothetical protein  28.19 
 
 
289 aa  90.9  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.102651  decreased coverage  0.000172466 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5826  protein of unknown function DUF75  24.31 
 
 
297 aa  90.5  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22756  normal  0.126375 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3162  hypothetical protein  26.3 
 
 
296 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3212  hypothetical protein  26.3 
 
 
296 aa  89.4  9e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.550185  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3150  hypothetical protein  26.3 
 
 
296 aa  89.4  9e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0142521  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2210  protein of unknown function DUF75  27.47 
 
 
298 aa  87.8  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2170  hypothetical protein  27.41 
 
 
289 aa  86.7  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.260059  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2143  protein of unknown function DUF75  28.62 
 
 
301 aa  84  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0211773  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3052  hypothetical protein  25.74 
 
 
292 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1548  protein of unknown function DUF75  26.69 
 
 
279 aa  83.2  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.831749  normal  0.218022 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12157  hypothetical protein  27.5 
 
 
292 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00120164  normal  0.853503 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0447  hypothetical protein  23.33 
 
 
277 aa  82.4  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000016468  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2246  protein of unknown function DUF75  25.53 
 
 
283 aa  81.3  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.640776  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0888  protein of unknown function DUF75  21.74 
 
 
311 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5919  hypothetical protein  26.67 
 
 
284 aa  79.7  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239178  normal  0.0316841 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1855  hypothetical protein  26.81 
 
 
284 aa  79  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.982924 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2009  protein of unknown function DUF75  27.27 
 
 
285 aa  78.6  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.547664  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2630  hypothetical protein  26.45 
 
 
282 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1196  protein of unknown function DUF75  24.07 
 
 
296 aa  77.4  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00179103  normal  0.0638399 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4890  hypothetical protein  27.71 
 
 
280 aa  73.2  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.469947  normal  0.0846818 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2290  protein of unknown function DUF75  27.01 
 
 
286 aa  70.9  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00121228  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2169  hypothetical protein  25.45 
 
 
301 aa  70.9  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0362139  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1912  protein of unknown function DUF75  25.18 
 
 
301 aa  70.1  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000183665 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20950  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  24.25 
 
 
306 aa  69.7  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.344012  normal  0.641113 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13900  ATP-grasp superfamily enzyme  26.92 
 
 
286 aa  68.9  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.331595  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2670  protein of unknown function DUF75  26.39 
 
 
286 aa  67.4  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.361609  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2785  protein of unknown function DUF75  25.54 
 
 
286 aa  67  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000787132  hitchhiker  0.0000705422 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5396  protein of unknown function DUF75  24.26 
 
 
302 aa  66.2  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.380305  normal  0.382515 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1837  protein of unknown function DUF75  23.7 
 
 
284 aa  65.1  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2640  hypothetical protein  27.13 
 
 
280 aa  64.3  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.512604  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1842  protein of unknown function DUF75  26.71 
 
 
294 aa  62.8  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.316011  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1173  hypothetical protein  25 
 
 
283 aa  57  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11820  ATP-grasp superfamily enzyme  23.4 
 
 
316 aa  50.8  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0485047  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3209  hypothetical protein  24.26 
 
 
312 aa  46.6  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>