87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1077 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1077  hypothetical protein  100 
 
 		 299 aa  593  1e-168  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.370003  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5826  protein of unknown function DUF75  51.19 
 
 		 297 aa  281  9e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22756  normal  0.126375 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22220  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  45.49 
 
 		 290 aa  249  3e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165906  normal  0.737687 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2143  protein of unknown function DUF75  42.76 
 
 		 301 aa  237  2e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0211773  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5919  hypothetical protein  44.48 
 
 		 284 aa  235  9e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239178  normal  0.0316841 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2210  protein of unknown function DUF75  42.96 
 
 		 298 aa  232  5e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2444  protein of unknown function DUF75  43.11 
 
 		 288 aa  231  1e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1173  hypothetical protein  44.76 
 
 		 283 aa  231  2e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3052  hypothetical protein  42.61 
 
 		 292 aa  229  3e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12157  hypothetical protein  42.46 
 
 		 292 aa  229  5e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00120164  normal  0.853503 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1826  hypothetical protein  44.56 
 
 		 281 aa  229  6e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0638514  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3475  hypothetical protein  42.61 
 
 		 296 aa  228  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2670  protein of unknown function DUF75  42.96 
 
 		 286 aa  228  1e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.361609  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2324  hypothetical protein  42.25 
 
 		 289 aa  227  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.102651  decreased coverage  0.000172466 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2785  protein of unknown function DUF75  42.86 
 
 		 286 aa  226  3e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000787132  hitchhiker  0.0000705422 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2630  hypothetical protein  41.16 
 
 		 282 aa  226  3e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1548  protein of unknown function DUF75  42.05 
 
 		 279 aa  225  6e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.831749  normal  0.218022 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2170  hypothetical protein  41.55 
 
 		 289 aa  225  7e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.260059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3212  hypothetical protein  42.96 
 
 		 296 aa  225  8e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.550185  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3162  hypothetical protein  42.96 
 
 		 296 aa  225  8e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3150  hypothetical protein  42.96 
 
 		 296 aa  225  8e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0142521  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1855  hypothetical protein  43.39 
 
 		 284 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.982924 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2169  hypothetical protein  39.86 
 
 		 301 aa  216  5e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0362139  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1912  protein of unknown function DUF75  40.07 
 
 		 301 aa  211  1e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000183665 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4890  hypothetical protein  43.36 
 
 		 280 aa  211  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.469947  normal  0.0846818 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0888  protein of unknown function DUF75  39.18 
 
 		 311 aa  211  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20950  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  39.5 
 
 		 306 aa  209  6e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.344012  normal  0.641113 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2009  protein of unknown function DUF75  42.45 
 
 		 285 aa  208  1e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.547664  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2246  protein of unknown function DUF75  40.29 
 
 		 283 aa  207  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.640776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1480  protein of unknown function DUF75  43.01 
 
 		 283 aa  206  3e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1842  protein of unknown function DUF75  41.79 
 
 		 294 aa  206  4e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.316011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2640  hypothetical protein  42.76 
 
 		 280 aa  204  2e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.512604  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1196  protein of unknown function DUF75  39.15 
 
 		 296 aa  199  5e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00179103  normal  0.0638399 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2290  protein of unknown function DUF75  42.18 
 
 		 286 aa  194  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00121228  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13900  ATP-grasp superfamily enzyme  39.44 
 
 		 286 aa  194  2e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.331595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4500  hypothetical protein  35.11 
 
 		 282 aa  192  6e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00701907 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5396  protein of unknown function DUF75  39.44 
 
 		 302 aa  192  7e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.380305  normal  0.382515 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11820  ATP-grasp superfamily enzyme  41.87 
 
 		 316 aa  182  5.0000000000000004e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0485047  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16230  Protein of unknown function DUF75  35.92 
 
 		 269 aa  170  2e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.186088  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0447  hypothetical protein  32.73 
 
 		 277 aa  170  3e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000016468  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1837  protein of unknown function DUF75  34.77 
 
 		 284 aa  147  3e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2232  protein of unknown function DUF75  32.07 
 
 		 342 aa  135  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.553046  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1825  protein of unknown function DUF75  32.53 
 
 		 311 aa  132  7.999999999999999e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2219  hypothetical protein  32.53 
 
 		 334 aa  128  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.849197  normal  0.221625 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2162  hypothetical protein  32.53 
 
 		 334 aa  128  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.530975  hitchhiker  0.00210211 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2173  hypothetical protein  32.53 
 
 		 334 aa  128  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1509  protein of unknown function DUF75  31.83 
 
 		 311 aa  128  9.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0466221  normal  0.187119 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2127  protein of unknown function DUF75  34.51 
 
 		 316 aa  124  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1247  hypothetical protein  31.85 
 
 		 312 aa  124  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0984474 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0028  hypothetical protein  29.79 
 
 		 310 aa  123  4e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1722  hypothetical protein  31.49 
 
 		 306 aa  122  7e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.901753  decreased coverage  0.000637714 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2427  protein of unknown function DUF75  31.99 
 
 		 315 aa  122  7e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175054  normal  0.221308 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3951  hypothetical protein  30.03 
 
 		 330 aa  122  7e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.731534 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1737  hypothetical protein  31.49 
 
 		 306 aa  121  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.226503  normal  0.890937 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2446  hypothetical protein  29.86 
 
 		 329 aa  120  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211453 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1608  protein of unknown function DUF75  27.95 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000205047 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5208  hypothetical protein  31.62 
 
 		 307 aa  113  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00169383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5325  protein of unknown function DUF75  29.97 
 
 		 298 aa  112  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12728  hypothetical protein  31.91 
 
 		 324 aa  112  6e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2326  hypothetical protein  28.14 
 
 		 301 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677789  normal  0.402322 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15610  Protein of unknown function DUF75  29.3 
 
 		 353 aa  109  5e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6868  hypothetical protein  28.33 
 
 		 302 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16730  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  27.21 
 
 		 348 aa  107  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.448913 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1614  hypothetical protein  27.49 
 
 		 312 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00125325  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1658  protein of unknown function DUF75  26.46 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525262  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22940  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  28.01 
 
 		 312 aa  107  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.15902 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1579  protein of unknown function DUF75  29.27 
 
 		 314 aa  107  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.255791  normal  0.548098 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13300  Protein of unknown function DUF75  28.62 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00661171  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4966  protein of unknown function DUF75  27.4 
 
 		 304 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1266  protein of unknown function DUF75  28.07 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.825703  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14850  ATP-grasp superfamily enzyme  28.12 
 
 		 307 aa  101  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2852  hypothetical protein  29.18 
 
 		 311 aa  100  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0926  hypothetical protein  28.52 
 
 		 313 aa  100  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3749  hypothetical protein  27.3 
 
 		 301 aa  99.8  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0709366  normal  0.107675 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1060  protein of unknown function DUF75  27.66 
 
 		 310 aa  98.2  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.419014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10660  Protein of unknown function DUF75  29.33 
 
 		 325 aa  95.5  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.120435  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5648  protein of unknown function DUF75  26.06 
 
 		 307 aa  95.5  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961809  normal  0.424673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3209  hypothetical protein  24.64 
 
 		 312 aa  92.8  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0798  protein of unknown function DUF75  27.34 
 
 		 319 aa  91.3  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_466  hypothetical protein  26.69 
 
 		 276 aa  78.6  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.841701  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0525  hypothetical protein  26.69 
 
 		 276 aa  78.2  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.902286  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0501  hypothetical protein  26.29 
 
 		 276 aa  74.7  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.686369  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0916  hypothetical protein  22.29 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.470991  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0800  hypothetical protein  20.06 
 
 		 302 aa  62.4  0.000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_787  hypothetical protein  19.75 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0799  hypothetical protein  22.22 
 
 		 268 aa  48.9  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.515819  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2792  protein of unknown function DUF75  27.31 
 
 		 250 aa  44.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.147305  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>