22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0799 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0799  hypothetical protein  100 
 
 
268 aa  552  1e-156  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.515819  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_786  hypothetical protein  85.39 
 
 
278 aa  457  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0915  hypothetical protein  79.4 
 
 
268 aa  421  1e-117  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.111337  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2246  protein of unknown function DUF75  26.29 
 
 
283 aa  57  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.640776  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1480  protein of unknown function DUF75  24.37 
 
 
283 aa  55.8  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1077  hypothetical protein  22.22 
 
 
299 aa  48.9  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.370003  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2785  protein of unknown function DUF75  19.37 
 
 
286 aa  48.9  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000787132  hitchhiker  0.0000705422 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5396  protein of unknown function DUF75  22.81 
 
 
302 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.380305  normal  0.382515 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0888  protein of unknown function DUF75  23.95 
 
 
311 aa  48.5  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_466  hypothetical protein  22.86 
 
 
276 aa  47.8  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.841701  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0525  hypothetical protein  22.57 
 
 
276 aa  46.6  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.902286  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0447  hypothetical protein  23.64 
 
 
277 aa  45.8  0.0006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000016468  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2670  protein of unknown function DUF75  21.24 
 
 
286 aa  45.8  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.361609  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2009  protein of unknown function DUF75  26.61 
 
 
285 aa  45.4  0.0009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.547664  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0916  hypothetical protein  25 
 
 
302 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.470991  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1196  protein of unknown function DUF75  20.74 
 
 
296 aa  44.3  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00179103  normal  0.0638399 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4890  hypothetical protein  20.94 
 
 
280 aa  43.5  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.469947  normal  0.0846818 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1855  hypothetical protein  22.94 
 
 
284 aa  43.9  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.982924 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2143  protein of unknown function DUF75  19.05 
 
 
301 aa  43.1  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0211773  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2210  protein of unknown function DUF75  22.42 
 
 
298 aa  42.7  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2640  hypothetical protein  20.42 
 
 
280 aa  42.4  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.512604  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0501  hypothetical protein  21.24 
 
 
276 aa  42  0.01  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.686369  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>