78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_10660 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_10660  Protein of unknown function DUF75  100 
 
 
325 aa  645    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.120435  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5648  protein of unknown function DUF75  40.31 
 
 
307 aa  223  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961809  normal  0.424673 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2232  protein of unknown function DUF75  41.97 
 
 
342 aa  223  3e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.553046  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1579  protein of unknown function DUF75  42.11 
 
 
314 aa  216  4e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.255791  normal  0.548098 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3951  hypothetical protein  42.28 
 
 
330 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.731534 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2427  protein of unknown function DUF75  40.5 
 
 
315 aa  213  2.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175054  normal  0.221308 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2173  hypothetical protein  40.4 
 
 
334 aa  212  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2162  hypothetical protein  40.4 
 
 
334 aa  212  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.530975  hitchhiker  0.00210211 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2219  hypothetical protein  40.4 
 
 
334 aa  212  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.849197  normal  0.221625 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2852  hypothetical protein  42.04 
 
 
311 aa  210  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2446  hypothetical protein  40.66 
 
 
329 aa  209  7e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.211453 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5208  hypothetical protein  40.69 
 
 
307 aa  207  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00169383  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12728  hypothetical protein  41.25 
 
 
324 aa  204  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14850  ATP-grasp superfamily enzyme  37.9 
 
 
307 aa  201  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1247  hypothetical protein  40.91 
 
 
312 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0984474 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6868  hypothetical protein  38.17 
 
 
302 aa  200  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455453  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1722  hypothetical protein  40.18 
 
 
306 aa  199  5e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.901753  decreased coverage  0.000637714 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0028  hypothetical protein  38.7 
 
 
310 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22940  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  38.41 
 
 
312 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.15902 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1737  hypothetical protein  40.49 
 
 
306 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.226503  normal  0.890937 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1266  protein of unknown function DUF75  40.79 
 
 
312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.825703  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4966  protein of unknown function DUF75  38 
 
 
304 aa  197  3e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3749  hypothetical protein  38.1 
 
 
301 aa  196  4.0000000000000005e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0709366  normal  0.107675 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1658  protein of unknown function DUF75  39.37 
 
 
304 aa  193  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525262  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5325  protein of unknown function DUF75  38.8 
 
 
298 aa  191  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1509  protein of unknown function DUF75  37.27 
 
 
311 aa  185  8e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0466221  normal  0.187119 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2326  hypothetical protein  34.17 
 
 
301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677789  normal  0.402322 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0926  hypothetical protein  37 
 
 
313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2127  protein of unknown function DUF75  39.27 
 
 
316 aa  177  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1825  protein of unknown function DUF75  35.1 
 
 
311 aa  176  5e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1614  hypothetical protein  36.22 
 
 
312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00125325  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0798  protein of unknown function DUF75  35.91 
 
 
319 aa  172  5e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1608  protein of unknown function DUF75  34.28 
 
 
312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000205047 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13300  Protein of unknown function DUF75  33.67 
 
 
318 aa  162  6e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00661171  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16730  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  31.9 
 
 
348 aa  155  6e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.448913 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1060  protein of unknown function DUF75  33.97 
 
 
310 aa  155  7e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.419014  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15610  Protein of unknown function DUF75  29.56 
 
 
353 aa  124  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5826  protein of unknown function DUF75  30.38 
 
 
297 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22756  normal  0.126375 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1826  hypothetical protein  30.13 
 
 
281 aa  100  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0638514  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2210  protein of unknown function DUF75  28.52 
 
 
298 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1855  hypothetical protein  29.19 
 
 
284 aa  99.8  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.982924 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2670  protein of unknown function DUF75  27.61 
 
 
286 aa  98.2  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.361609  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5919  hypothetical protein  28.62 
 
 
284 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239178  normal  0.0316841 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1077  hypothetical protein  29.33 
 
 
299 aa  95.5  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.370003  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2143  protein of unknown function DUF75  27.03 
 
 
301 aa  92.4  9e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0211773  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2785  protein of unknown function DUF75  26.67 
 
 
286 aa  92.4  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000787132  hitchhiker  0.0000705422 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3475  hypothetical protein  26.39 
 
 
296 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22220  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  26.85 
 
 
290 aa  90.1  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165906  normal  0.737687 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1842  protein of unknown function DUF75  26.9 
 
 
294 aa  89.7  6e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.316011  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2324  hypothetical protein  25.76 
 
 
289 aa  89.4  8e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.102651  decreased coverage  0.000172466 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1480  protein of unknown function DUF75  28.09 
 
 
283 aa  88.2  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2009  protein of unknown function DUF75  26.73 
 
 
285 aa  87.8  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.547664  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2170  hypothetical protein  25.42 
 
 
289 aa  88.2  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.260059  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3052  hypothetical protein  25.69 
 
 
292 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3212  hypothetical protein  26.52 
 
 
296 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.550185  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3150  hypothetical protein  26.52 
 
 
296 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0142521  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2444  protein of unknown function DUF75  26.44 
 
 
288 aa  87  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12157  hypothetical protein  25.61 
 
 
292 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00120164  normal  0.853503 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4500  hypothetical protein  27.53 
 
 
282 aa  85.9  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00701907 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2290  protein of unknown function DUF75  29.57 
 
 
286 aa  84.3  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00121228  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3162  hypothetical protein  26.14 
 
 
296 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1548  protein of unknown function DUF75  29.7 
 
 
279 aa  83.6  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.831749  normal  0.218022 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1912  protein of unknown function DUF75  25.52 
 
 
301 aa  81.6  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000183665 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16230  Protein of unknown function DUF75  24.91 
 
 
269 aa  80.9  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.186088  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2246  protein of unknown function DUF75  25.42 
 
 
283 aa  80.5  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.640776  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5396  protein of unknown function DUF75  26.62 
 
 
302 aa  80.9  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.380305  normal  0.382515 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2169  hypothetical protein  25.17 
 
 
301 aa  80.1  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0362139  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0888  protein of unknown function DUF75  23.96 
 
 
311 aa  79.3  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2630  hypothetical protein  26.17 
 
 
282 aa  79.7  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20950  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  26.5 
 
 
306 aa  77.4  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.344012  normal  0.641113 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1173  hypothetical protein  26.16 
 
 
283 aa  73.6  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4890  hypothetical protein  27.34 
 
 
280 aa  72.8  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.469947  normal  0.0846818 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1837  protein of unknown function DUF75  29.07 
 
 
284 aa  72.4  0.000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1196  protein of unknown function DUF75  26.16 
 
 
296 aa  70.9  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00179103  normal  0.0638399 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11820  ATP-grasp superfamily enzyme  25.79 
 
 
316 aa  67  0.0000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0485047  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2640  hypothetical protein  24.71 
 
 
280 aa  66.2  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.512604  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0447  hypothetical protein  22 
 
 
277 aa  64.7  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000016468  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13900  ATP-grasp superfamily enzyme  23.74 
 
 
286 aa  59.3  0.00000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.331595  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>