83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1196 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1196  protein of unknown function DUF75  100 
 
 
296 aa  593  1e-168  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00179103  normal  0.0638399 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2009  protein of unknown function DUF75  55.56 
 
 
285 aa  306  3e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.547664  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20950  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  51.82 
 
 
306 aa  300  2e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.344012  normal  0.641113 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2246  protein of unknown function DUF75  55.02 
 
 
283 aa  298  5e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.640776  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1480  protein of unknown function DUF75  52.77 
 
 
283 aa  291  1e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1912  protein of unknown function DUF75  52.24 
 
 
301 aa  288  6e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000183665 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2169  hypothetical protein  52.24 
 
 
301 aa  288  6e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0362139  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1855  hypothetical protein  49.44 
 
 
284 aa  268  8e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.982924 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2630  hypothetical protein  51.12 
 
 
282 aa  268  8e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5919  hypothetical protein  47.94 
 
 
284 aa  268  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239178  normal  0.0316841 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1173  hypothetical protein  50.18 
 
 
283 aa  263  2e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1842  protein of unknown function DUF75  49.06 
 
 
294 aa  260  2e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.316011  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4890  hypothetical protein  49.44 
 
 
280 aa  258  6e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.469947  normal  0.0846818 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3475  hypothetical protein  46.35 
 
 
296 aa  253  3e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3052  hypothetical protein  45.45 
 
 
292 aa  253  3e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1826  hypothetical protein  48.3 
 
 
281 aa  251  7e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0638514  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3150  hypothetical protein  45.62 
 
 
296 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0142521  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3212  hypothetical protein  45.62 
 
 
296 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.550185  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3162  hypothetical protein  45.62 
 
 
296 aa  250  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2640  hypothetical protein  49.44 
 
 
280 aa  249  3e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.512604  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2670  protein of unknown function DUF75  46.64 
 
 
286 aa  249  4e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.361609  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2290  protein of unknown function DUF75  49.82 
 
 
286 aa  248  9e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00121228  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2444  protein of unknown function DUF75  46.49 
 
 
288 aa  248  1e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22220  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  47.92 
 
 
290 aa  243  1.9999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165906  normal  0.737687 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2210  protein of unknown function DUF75  46.79 
 
 
298 aa  241  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2785  protein of unknown function DUF75  46.15 
 
 
286 aa  237  2e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000787132  hitchhiker  0.0000705422 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2143  protein of unknown function DUF75  43.7 
 
 
301 aa  236  3e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0211773  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1548  protein of unknown function DUF75  45.35 
 
 
279 aa  235  5.0000000000000005e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.831749  normal  0.218022 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12157  hypothetical protein  44.32 
 
 
292 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00120164  normal  0.853503 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2170  hypothetical protein  44.61 
 
 
289 aa  231  8.000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.260059  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13900  ATP-grasp superfamily enzyme  45.69 
 
 
286 aa  231  1e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.331595  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5396  protein of unknown function DUF75  44.89 
 
 
302 aa  231  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.380305  normal  0.382515 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2324  hypothetical protein  44.61 
 
 
289 aa  229  3e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.102651  decreased coverage  0.000172466 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11820  ATP-grasp superfamily enzyme  44.68 
 
 
316 aa  228  1e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0485047  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16230  Protein of unknown function DUF75  43.23 
 
 
269 aa  217  2e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.186088  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4500  hypothetical protein  40.82 
 
 
282 aa  209  4e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00701907 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5826  protein of unknown function DUF75  42.65 
 
 
297 aa  209  6e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22756  normal  0.126375 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1077  hypothetical protein  39.15 
 
 
299 aa  199  5e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.370003  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0888  protein of unknown function DUF75  37.24 
 
 
311 aa  187  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0447  hypothetical protein  31.87 
 
 
277 aa  158  8e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000016468  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1837  protein of unknown function DUF75  33.09 
 
 
284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1825  protein of unknown function DUF75  27.27 
 
 
311 aa  100  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1509  protein of unknown function DUF75  29.3 
 
 
311 aa  92.4  9e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0466221  normal  0.187119 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2852  hypothetical protein  26.55 
 
 
311 aa  91.3  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3951  hypothetical protein  25.35 
 
 
330 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.731534 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2446  hypothetical protein  24.73 
 
 
329 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.211453 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2219  hypothetical protein  23.59 
 
 
334 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.849197  normal  0.221625 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2173  hypothetical protein  23.59 
 
 
334 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2162  hypothetical protein  23.59 
 
 
334 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.530975  hitchhiker  0.00210211 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2427  protein of unknown function DUF75  28.17 
 
 
315 aa  82.4  0.000000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175054  normal  0.221308 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16730  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  25.36 
 
 
348 aa  82  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.448913 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5648  protein of unknown function DUF75  22.66 
 
 
307 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961809  normal  0.424673 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2232  protein of unknown function DUF75  24.28 
 
 
342 aa  80.1  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.553046  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3749  hypothetical protein  21.66 
 
 
301 aa  79  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0709366  normal  0.107675 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15610  Protein of unknown function DUF75  24.07 
 
 
353 aa  77.8  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4966  protein of unknown function DUF75  22.65 
 
 
304 aa  77.8  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2127  protein of unknown function DUF75  25.98 
 
 
316 aa  77.4  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3209  hypothetical protein  24.91 
 
 
312 aa  75.5  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6868  hypothetical protein  25.09 
 
 
302 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455453  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12728  hypothetical protein  23.86 
 
 
324 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22940  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  25.18 
 
 
312 aa  73.9  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.15902 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14850  ATP-grasp superfamily enzyme  22.61 
 
 
307 aa  73.2  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1579  protein of unknown function DUF75  25.76 
 
 
314 aa  72.4  0.000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.255791  normal  0.548098 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0926  hypothetical protein  22.22 
 
 
313 aa  70.9  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10660  Protein of unknown function DUF75  26.16 
 
 
325 aa  70.9  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.120435  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0028  hypothetical protein  25.36 
 
 
310 aa  69.7  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2326  hypothetical protein  22.46 
 
 
301 aa  69.3  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677789  normal  0.402322 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1266  protein of unknown function DUF75  22.86 
 
 
312 aa  68.9  0.00000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.825703  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5325  protein of unknown function DUF75  24.19 
 
 
298 aa  68.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13300  Protein of unknown function DUF75  24.79 
 
 
318 aa  64.3  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00661171  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1614  hypothetical protein  21.58 
 
 
312 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00125325  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1247  hypothetical protein  23.42 
 
 
312 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0984474 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5208  hypothetical protein  26.32 
 
 
307 aa  62.8  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00169383  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1722  hypothetical protein  24.73 
 
 
306 aa  62.4  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.901753  decreased coverage  0.000637714 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1060  protein of unknown function DUF75  23.88 
 
 
310 aa  61.6  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.419014  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1737  hypothetical protein  24 
 
 
306 aa  58.9  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.226503  normal  0.890937 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1658  protein of unknown function DUF75  21.01 
 
 
304 aa  57.4  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525262  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1608  protein of unknown function DUF75  20.25 
 
 
312 aa  55.8  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000205047 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0798  protein of unknown function DUF75  21.58 
 
 
319 aa  55.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0800  hypothetical protein  20.31 
 
 
302 aa  45.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0916  hypothetical protein  19.44 
 
 
302 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.470991  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0799  hypothetical protein  20.74 
 
 
268 aa  44.3  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.515819  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_787  hypothetical protein  21.09 
 
 
302 aa  44.7  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>