82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4500 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4500  hypothetical protein  100 
 
 
282 aa  576  1.0000000000000001e-163  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00701907 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2170  hypothetical protein  54.48 
 
 
289 aa  318  7.999999999999999e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.260059  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2324  hypothetical protein  54.12 
 
 
289 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.102651  decreased coverage  0.000172466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5919  hypothetical protein  49.46 
 
 
284 aa  283  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239178  normal  0.0316841 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2444  protein of unknown function DUF75  49.47 
 
 
288 aa  282  4.0000000000000003e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1855  hypothetical protein  49.65 
 
 
284 aa  281  1e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.982924 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2630  hypothetical protein  48.92 
 
 
282 aa  277  2e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1173  hypothetical protein  47.48 
 
 
283 aa  266  2e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22220  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  46.24 
 
 
290 aa  265  5e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165906  normal  0.737687 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2670  protein of unknown function DUF75  46.4 
 
 
286 aa  260  2e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.361609  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4890  hypothetical protein  49.1 
 
 
280 aa  260  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.469947  normal  0.0846818 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2210  protein of unknown function DUF75  48.38 
 
 
298 aa  260  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2143  protein of unknown function DUF75  46.83 
 
 
301 aa  255  6e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0211773  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2785  protein of unknown function DUF75  47.45 
 
 
286 aa  255  7e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000787132  hitchhiker  0.0000705422 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3475  hypothetical protein  45.39 
 
 
296 aa  255  7e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2290  protein of unknown function DUF75  48.06 
 
 
286 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00121228  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3212  hypothetical protein  46.1 
 
 
296 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.550185  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2640  hypothetical protein  49.82 
 
 
280 aa  253  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.512604  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3150  hypothetical protein  46.1 
 
 
296 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0142521  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1826  hypothetical protein  46.76 
 
 
281 aa  253  3e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0638514  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2169  hypothetical protein  45.72 
 
 
301 aa  251  8.000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0362139  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3162  hypothetical protein  46.1 
 
 
296 aa  251  8.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3052  hypothetical protein  45.21 
 
 
292 aa  251  1e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1842  protein of unknown function DUF75  47.37 
 
 
294 aa  247  1e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.316011  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1548  protein of unknown function DUF75  45.35 
 
 
279 aa  246  3e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.831749  normal  0.218022 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1912  protein of unknown function DUF75  44.24 
 
 
301 aa  244  8e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000183665 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2009  protein of unknown function DUF75  45.05 
 
 
285 aa  241  1e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.547664  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5826  protein of unknown function DUF75  43.53 
 
 
297 aa  238  8e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22756  normal  0.126375 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2246  protein of unknown function DUF75  44.91 
 
 
283 aa  238  1e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.640776  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12157  hypothetical protein  43.94 
 
 
292 aa  236  2e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00120164  normal  0.853503 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20950  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  44.91 
 
 
306 aa  236  4e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.344012  normal  0.641113 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13900  ATP-grasp superfamily enzyme  46.72 
 
 
286 aa  235  6e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.331595  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1480  protein of unknown function DUF75  43.73 
 
 
283 aa  231  1e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5396  protein of unknown function DUF75  44.25 
 
 
302 aa  227  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.380305  normal  0.382515 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1196  protein of unknown function DUF75  40.82 
 
 
296 aa  209  4e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00179103  normal  0.0638399 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16230  Protein of unknown function DUF75  39.33 
 
 
269 aa  206  3e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.186088  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1077  hypothetical protein  35.11 
 
 
299 aa  192  5e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.370003  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11820  ATP-grasp superfamily enzyme  38.52 
 
 
316 aa  182  4.0000000000000006e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0485047  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0888  protein of unknown function DUF75  32.3 
 
 
311 aa  181  8.000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1837  protein of unknown function DUF75  33.58 
 
 
284 aa  140  3e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0447  hypothetical protein  28.94 
 
 
277 aa  137  1e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000016468  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1825  protein of unknown function DUF75  30.36 
 
 
311 aa  115  8.999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3951  hypothetical protein  28.28 
 
 
330 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.731534 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2446  hypothetical protein  28.21 
 
 
329 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.211453 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2852  hypothetical protein  26.64 
 
 
311 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2173  hypothetical protein  27.53 
 
 
334 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2162  hypothetical protein  27.53 
 
 
334 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.530975  hitchhiker  0.00210211 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2219  hypothetical protein  27.53 
 
 
334 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.849197  normal  0.221625 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3209  hypothetical protein  25.55 
 
 
312 aa  100  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2232  protein of unknown function DUF75  26.74 
 
 
342 aa  99.8  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.553046  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0926  hypothetical protein  25.61 
 
 
313 aa  99.4  6e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1509  protein of unknown function DUF75  28.32 
 
 
311 aa  99  8e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0466221  normal  0.187119 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12728  hypothetical protein  26.87 
 
 
324 aa  98.6  9e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1614  hypothetical protein  27.18 
 
 
312 aa  98.2  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00125325  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15610  Protein of unknown function DUF75  28.41 
 
 
353 aa  97.1  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14850  ATP-grasp superfamily enzyme  27.64 
 
 
307 aa  96.7  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6868  hypothetical protein  25.17 
 
 
302 aa  96.3  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455453  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1737  hypothetical protein  28.07 
 
 
306 aa  95.5  9e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.226503  normal  0.890937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5648  protein of unknown function DUF75  24.38 
 
 
307 aa  94.7  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961809  normal  0.424673 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1608  protein of unknown function DUF75  27.53 
 
 
312 aa  94.7  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000205047 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5325  protein of unknown function DUF75  27.97 
 
 
298 aa  94  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1722  hypothetical protein  27.11 
 
 
306 aa  92.8  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.901753  decreased coverage  0.000637714 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3749  hypothetical protein  23.93 
 
 
301 aa  92  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0709366  normal  0.107675 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0028  hypothetical protein  27.97 
 
 
310 aa  92  9e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4966  protein of unknown function DUF75  24.91 
 
 
304 aa  90.5  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2127  protein of unknown function DUF75  27.67 
 
 
316 aa  90.5  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5208  hypothetical protein  27.02 
 
 
307 aa  90.5  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00169383  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2326  hypothetical protein  24.2 
 
 
301 aa  89  9e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677789  normal  0.402322 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1579  protein of unknown function DUF75  27.86 
 
 
314 aa  86.3  6e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.255791  normal  0.548098 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10660  Protein of unknown function DUF75  27.53 
 
 
325 aa  85.9  6e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.120435  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1658  protein of unknown function DUF75  25.6 
 
 
304 aa  85.1  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525262  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1247  hypothetical protein  27.21 
 
 
312 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0984474 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2427  protein of unknown function DUF75  25.89 
 
 
315 aa  83.2  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175054  normal  0.221308 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16730  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  24.11 
 
 
348 aa  81.3  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.448913 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22940  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  25.52 
 
 
312 aa  78.6  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.15902 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1266  protein of unknown function DUF75  25.72 
 
 
312 aa  77.8  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.825703  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0798  protein of unknown function DUF75  23.37 
 
 
319 aa  73.9  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13300  Protein of unknown function DUF75  22.91 
 
 
318 aa  72.4  0.000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00661171  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1060  protein of unknown function DUF75  22.66 
 
 
310 aa  58.9  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.419014  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0525  hypothetical protein  21.91 
 
 
276 aa  54.7  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.902286  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0501  hypothetical protein  21.51 
 
 
276 aa  49.3  0.00007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.686369  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_466  hypothetical protein  21.51 
 
 
276 aa  48.9  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.841701  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>