82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2170 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2170  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  585  1e-166  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.260059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2324  hypothetical protein  97.92 
 
 		 289 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.102651  decreased coverage  0.000172466 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2670  protein of unknown function DUF75  58.7 
 
 		 286 aa  346  2e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.361609  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5919  hypothetical protein  57.55 
 
 		 284 aa  335  3.9999999999999995e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239178  normal  0.0316841 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4890  hypothetical protein  58.42 
 
 		 280 aa  332  4e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.469947  normal  0.0846818 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1855  hypothetical protein  56.83 
 
 		 284 aa  330  2e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.982924 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2444  protein of unknown function DUF75  56.49 
 
 		 288 aa  330  2e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2143  protein of unknown function DUF75  56.69 
 
 		 301 aa  325  7e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0211773  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1173  hypothetical protein  55.76 
 
 		 283 aa  325  7e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22220  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  58.24 
 
 		 290 aa  323  2e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165906  normal  0.737687 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2640  hypothetical protein  58.42 
 
 		 280 aa  321  9.999999999999999e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.512604  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2785  protein of unknown function DUF75  55.86 
 
 		 286 aa  321  9.999999999999999e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000787132  hitchhiker  0.0000705422 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4500  hypothetical protein  54.48 
 
 		 282 aa  318  9e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00701907 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2210  protein of unknown function DUF75  56.88 
 
 		 298 aa  317  1e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3475  hypothetical protein  53.76 
 
 		 296 aa  312  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3052  hypothetical protein  53.76 
 
 		 292 aa  312  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2630  hypothetical protein  51.96 
 
 		 282 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3162  hypothetical protein  53.41 
 
 		 296 aa  308  9e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3212  hypothetical protein  53.41 
 
 		 296 aa  307  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.550185  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3150  hypothetical protein  53.41 
 
 		 296 aa  307  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0142521  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2290  protein of unknown function DUF75  56.18 
 
 		 286 aa  305  4.0000000000000004e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00121228  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12157  hypothetical protein  52.52 
 
 		 292 aa  290  2e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00120164  normal  0.853503 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1842  protein of unknown function DUF75  53.18 
 
 		 294 aa  288  1e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.316011  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2009  protein of unknown function DUF75  52.19 
 
 		 285 aa  285  5.999999999999999e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.547664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1826  hypothetical protein  50.53 
 
 		 281 aa  278  7e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0638514  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1548  protein of unknown function DUF75  49.81 
 
 		 279 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.831749  normal  0.218022 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5396  protein of unknown function DUF75  51.57 
 
 		 302 aa  270  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.380305  normal  0.382515 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1480  protein of unknown function DUF75  49.46 
 
 		 283 aa  266  2e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20950  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  47.55 
 
 		 306 aa  263  2e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.344012  normal  0.641113 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2246  protein of unknown function DUF75  48.15 
 
 		 283 aa  262  4e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.640776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1912  protein of unknown function DUF75  44.98 
 
 		 301 aa  254  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000183665 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2169  hypothetical protein  44.61 
 
 		 301 aa  253  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0362139  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13900  ATP-grasp superfamily enzyme  48.91 
 
 		 286 aa  253  2.0000000000000002e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.331595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5826  protein of unknown function DUF75  44.57 
 
 		 297 aa  244  9.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22756  normal  0.126375 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1196  protein of unknown function DUF75  44.61 
 
 		 296 aa  231  8.000000000000001e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00179103  normal  0.0638399 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1077  hypothetical protein  41.55 
 
 		 299 aa  225  7e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.370003  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16230  Protein of unknown function DUF75  42.54 
 
 		 269 aa  217  2e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.186088  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0888  protein of unknown function DUF75  36.9 
 
 		 311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11820  ATP-grasp superfamily enzyme  36.49 
 
 		 316 aa  173  2.9999999999999996e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0485047  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0447  hypothetical protein  32.97 
 
 		 277 aa  157  2e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000016468  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1837  protein of unknown function DUF75  34.33 
 
 		 284 aa  137  2e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1825  protein of unknown function DUF75  28.38 
 
 		 311 aa  115  7.999999999999999e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2446  hypothetical protein  27.46 
 
 		 329 aa  107  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211453 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3951  hypothetical protein  27.82 
 
 		 330 aa  104  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.731534 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5648  protein of unknown function DUF75  26.74 
 
 		 307 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961809  normal  0.424673 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2852  hypothetical protein  27.84 
 
 		 311 aa  99.8  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2219  hypothetical protein  25.35 
 
 		 334 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.849197  normal  0.221625 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2162  hypothetical protein  25.35 
 
 		 334 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.530975  hitchhiker  0.00210211 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2173  hypothetical protein  25.35 
 
 		 334 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0926  hypothetical protein  27.57 
 
 		 313 aa  96.3  6e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4966  protein of unknown function DUF75  27.8 
 
 		 304 aa  95.9  8e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14850  ATP-grasp superfamily enzyme  27.21 
 
 		 307 aa  95.1  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1247  hypothetical protein  28.87 
 
 		 312 aa  94  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0984474 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2232  protein of unknown function DUF75  29.41 
 
 		 342 aa  92.8  6e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.553046  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3749  hypothetical protein  25.52 
 
 		 301 aa  92.4  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0709366  normal  0.107675 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22940  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  27.53 
 
 		 312 aa  91.7  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.15902 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2326  hypothetical protein  27.37 
 
 		 301 aa  91.3  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677789  normal  0.402322 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5208  hypothetical protein  27.49 
 
 		 307 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00169383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1509  protein of unknown function DUF75  26.52 
 
 		 311 aa  90.5  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0466221  normal  0.187119 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16730  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  26.3 
 
 		 348 aa  89.7  5e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.448913 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1579  protein of unknown function DUF75  27.34 
 
 		 314 aa  89.4  7e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.255791  normal  0.548098 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12728  hypothetical protein  27.92 
 
 		 324 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1722  hypothetical protein  27.87 
 
 		 306 aa  88.2  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.901753  decreased coverage  0.000637714 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10660  Protein of unknown function DUF75  25.42 
 
 		 325 aa  88.2  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.120435  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3209  hypothetical protein  24.72 
 
 		 312 aa  87  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1737  hypothetical protein  27.97 
 
 		 306 aa  86.3  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.226503  normal  0.890937 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15610  Protein of unknown function DUF75  27.41 
 
 		 353 aa  86.7  5e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6868  hypothetical protein  25.26 
 
 		 302 aa  86.3  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455453  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13300  Protein of unknown function DUF75  24.66 
 
 		 318 aa  80.9  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00661171  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5325  protein of unknown function DUF75  25.89 
 
 		 298 aa  79.3  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1060  protein of unknown function DUF75  25.89 
 
 		 310 aa  79  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.419014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2427  protein of unknown function DUF75  26.3 
 
 		 315 aa  76.6  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175054  normal  0.221308 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2127  protein of unknown function DUF75  27.95 
 
 		 316 aa  75.9  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1608  protein of unknown function DUF75  23.08 
 
 		 312 aa  74.7  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000205047 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1614  hypothetical protein  22.8 
 
 		 312 aa  72.8  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00125325  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1658  protein of unknown function DUF75  25.67 
 
 		 304 aa  72.4  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525262  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0028  hypothetical protein  23.69 
 
 		 310 aa  72.4  0.000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1266  protein of unknown function DUF75  25.36 
 
 		 312 aa  69.7  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.825703  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0501  hypothetical protein  21.46 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.686369  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0525  hypothetical protein  21.07 
 
 		 276 aa  58.9  0.00000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.902286  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_466  hypothetical protein  21.07 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.841701  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0798  protein of unknown function DUF75  21.13 
 
 		 319 aa  50.1  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>