79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1722 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1722  hypothetical protein  100 
 
 
306 aa  608  1e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.901753  decreased coverage  0.000637714 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1737  hypothetical protein  96.08 
 
 
306 aa  587  1e-166  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.226503  normal  0.890937 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1247  hypothetical protein  65.69 
 
 
312 aa  394  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0984474 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5208  hypothetical protein  63.25 
 
 
307 aa  380  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00169383  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0028  hypothetical protein  56.95 
 
 
310 aa  326  3e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6868  hypothetical protein  53.87 
 
 
302 aa  312  3.9999999999999997e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455453  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1658  protein of unknown function DUF75  55.48 
 
 
304 aa  309  4e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525262  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5325  protein of unknown function DUF75  54.88 
 
 
298 aa  302  4.0000000000000003e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14850  ATP-grasp superfamily enzyme  53.2 
 
 
307 aa  298  8e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2446  hypothetical protein  53.36 
 
 
329 aa  294  1e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.211453 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0926  hypothetical protein  53.31 
 
 
313 aa  293  3e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5648  protein of unknown function DUF75  52.48 
 
 
307 aa  292  5e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961809  normal  0.424673 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3951  hypothetical protein  53 
 
 
330 aa  292  6e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.731534 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4966  protein of unknown function DUF75  49.67 
 
 
304 aa  291  8e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1579  protein of unknown function DUF75  53.85 
 
 
314 aa  290  2e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.255791  normal  0.548098 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1509  protein of unknown function DUF75  51.43 
 
 
311 aa  288  1e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0466221  normal  0.187119 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2427  protein of unknown function DUF75  54.14 
 
 
315 aa  284  2.0000000000000002e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175054  normal  0.221308 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2219  hypothetical protein  49.01 
 
 
334 aa  281  7.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.849197  normal  0.221625 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2173  hypothetical protein  49.01 
 
 
334 aa  281  7.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2162  hypothetical protein  49.01 
 
 
334 aa  281  7.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.530975  hitchhiker  0.00210211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3749  hypothetical protein  49.83 
 
 
301 aa  279  4e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0709366  normal  0.107675 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12728  hypothetical protein  50.49 
 
 
324 aa  276  3e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2326  hypothetical protein  47.18 
 
 
301 aa  275  6e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677789  normal  0.402322 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1266  protein of unknown function DUF75  52.16 
 
 
312 aa  268  5.9999999999999995e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.825703  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0798  protein of unknown function DUF75  49 
 
 
319 aa  265  5e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2232  protein of unknown function DUF75  49.16 
 
 
342 aa  263  4e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.553046  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22940  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  47.39 
 
 
312 aa  262  6e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.15902 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2127  protein of unknown function DUF75  56.85 
 
 
316 aa  260  2e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1608  protein of unknown function DUF75  46.1 
 
 
312 aa  256  3e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000205047 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2852  hypothetical protein  45.1 
 
 
311 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1825  protein of unknown function DUF75  46.81 
 
 
311 aa  253  3e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1614  hypothetical protein  45.85 
 
 
312 aa  248  1e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00125325  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1060  protein of unknown function DUF75  43.93 
 
 
310 aa  223  2e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.419014  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16730  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  39.16 
 
 
348 aa  213  2.9999999999999995e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.448913 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10660  Protein of unknown function DUF75  40.18 
 
 
325 aa  199  3.9999999999999996e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.120435  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13300  Protein of unknown function DUF75  38.79 
 
 
318 aa  188  1e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00661171  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15610  Protein of unknown function DUF75  34.71 
 
 
353 aa  160  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1077  hypothetical protein  31.49 
 
 
299 aa  122  8e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.370003  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5919  hypothetical protein  30.72 
 
 
284 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239178  normal  0.0316841 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2444  protein of unknown function DUF75  31.1 
 
 
288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3052  hypothetical protein  29.17 
 
 
292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2210  protein of unknown function DUF75  29.97 
 
 
298 aa  113  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2143  protein of unknown function DUF75  31.2 
 
 
301 aa  113  5e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0211773  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3475  hypothetical protein  28.98 
 
 
296 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2785  protein of unknown function DUF75  28.52 
 
 
286 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000787132  hitchhiker  0.0000705422 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22220  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  29.45 
 
 
290 aa  110  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165906  normal  0.737687 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2670  protein of unknown function DUF75  29.73 
 
 
286 aa  109  7.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.361609  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12157  hypothetical protein  29.43 
 
 
292 aa  107  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00120164  normal  0.853503 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0888  protein of unknown function DUF75  26.4 
 
 
311 aa  106  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3212  hypothetical protein  28.92 
 
 
296 aa  106  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.550185  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3150  hypothetical protein  28.92 
 
 
296 aa  106  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0142521  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3162  hypothetical protein  28.92 
 
 
296 aa  106  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1855  hypothetical protein  29.25 
 
 
284 aa  104  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.982924 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5826  protein of unknown function DUF75  28.42 
 
 
297 aa  99.8  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22756  normal  0.126375 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1548  protein of unknown function DUF75  29.15 
 
 
279 aa  98.6  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.831749  normal  0.218022 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1826  hypothetical protein  29.64 
 
 
281 aa  99  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0638514  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2630  hypothetical protein  29.64 
 
 
282 aa  95.9  7e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2290  protein of unknown function DUF75  29.73 
 
 
286 aa  95.1  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00121228  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4500  hypothetical protein  27.11 
 
 
282 aa  92.8  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00701907 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2324  hypothetical protein  29.17 
 
 
289 aa  90.9  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.102651  decreased coverage  0.000172466 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16230  Protein of unknown function DUF75  28.52 
 
 
269 aa  90.1  4e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.186088  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5396  protein of unknown function DUF75  29.74 
 
 
302 aa  89.7  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.380305  normal  0.382515 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2170  hypothetical protein  27.87 
 
 
289 aa  88.2  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.260059  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1480  protein of unknown function DUF75  29.15 
 
 
283 aa  86.3  5e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1173  hypothetical protein  27.78 
 
 
283 aa  83.6  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2009  protein of unknown function DUF75  29.96 
 
 
285 aa  83.2  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.547664  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1837  protein of unknown function DUF75  29.55 
 
 
284 aa  82.4  0.000000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1842  protein of unknown function DUF75  28.05 
 
 
294 aa  81.6  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.316011  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2246  protein of unknown function DUF75  26.23 
 
 
283 aa  78.2  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.640776  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0447  hypothetical protein  23.19 
 
 
277 aa  72.8  0.000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000016468  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13900  ATP-grasp superfamily enzyme  25.36 
 
 
286 aa  72.8  0.000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.331595  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20950  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  24.8 
 
 
306 aa  71.2  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.344012  normal  0.641113 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2169  hypothetical protein  27.16 
 
 
301 aa  71.2  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0362139  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2640  hypothetical protein  26.42 
 
 
280 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.512604  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1912  protein of unknown function DUF75  25.69 
 
 
301 aa  67.8  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000183665 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4890  hypothetical protein  25 
 
 
280 aa  66.6  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.469947  normal  0.0846818 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11820  ATP-grasp superfamily enzyme  28.12 
 
 
316 aa  65.9  0.0000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0485047  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1196  protein of unknown function DUF75  24.73 
 
 
296 aa  62.4  0.000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00179103  normal  0.0638399 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3209  hypothetical protein  25.41 
 
 
312 aa  46.6  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>