67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3209 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3209  hypothetical protein  100 
 
 		 312 aa  642    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5826  protein of unknown function DUF75  28.93 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22756  normal  0.126375 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2785  protein of unknown function DUF75  26.81 
 
 		 286 aa  103  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000787132  hitchhiker  0.0000705422 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4500  hypothetical protein  25.55 
 
 		 282 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00701907 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2210  protein of unknown function DUF75  27.27 
 
 		 298 aa  97.8  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1173  hypothetical protein  27.27 
 
 		 283 aa  97.4  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22220  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  27.42 
 
 		 290 aa  95.9  8e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165906  normal  0.737687 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2169  hypothetical protein  27.15 
 
 		 301 aa  94.4  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0362139  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1548  protein of unknown function DUF75  25.09 
 
 		 279 aa  93.6  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.831749  normal  0.218022 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1077  hypothetical protein  24.64 
 
 		 299 aa  92.8  7e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.370003  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13900  ATP-grasp superfamily enzyme  27.68 
 
 		 286 aa  90.1  4e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.331595  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2246  protein of unknown function DUF75  27.07 
 
 		 283 aa  90.1  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.640776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5919  hypothetical protein  25.46 
 
 		 284 aa  90.1  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239178  normal  0.0316841 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12157  hypothetical protein  27.5 
 
 		 292 aa  89.4  7e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00120164  normal  0.853503 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20950  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  26.89 
 
 		 306 aa  88.6  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.344012  normal  0.641113 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3052  hypothetical protein  26.37 
 
 		 292 aa  89  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1912  protein of unknown function DUF75  26.3 
 
 		 301 aa  87.8  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000183665 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2170  hypothetical protein  24.72 
 
 		 289 aa  87  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.260059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3475  hypothetical protein  26.37 
 
 		 296 aa  86.3  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2630  hypothetical protein  25.36 
 
 		 282 aa  85.9  8e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2324  hypothetical protein  24.35 
 
 		 289 aa  84.3  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.102651  decreased coverage  0.000172466 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16230  Protein of unknown function DUF75  22.51 
 
 		 269 aa  84  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.186088  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1855  hypothetical protein  25 
 
 		 284 aa  82.4  0.000000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.982924 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2444  protein of unknown function DUF75  25.27 
 
 		 288 aa  82.4  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3150  hypothetical protein  26.01 
 
 		 296 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0142521  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5396  protein of unknown function DUF75  25.95 
 
 		 302 aa  82  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.380305  normal  0.382515 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3212  hypothetical protein  26.01 
 
 		 296 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.550185  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2143  protein of unknown function DUF75  25.55 
 
 		 301 aa  82.4  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0211773  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3162  hypothetical protein  26.01 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1842  protein of unknown function DUF75  25 
 
 		 294 aa  80.5  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.316011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2670  protein of unknown function DUF75  25 
 
 		 286 aa  79.3  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.361609  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2009  protein of unknown function DUF75  23.77 
 
 		 285 aa  79  0.00000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.547664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2640  hypothetical protein  26.94 
 
 		 280 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.512604  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4890  hypothetical protein  26.1 
 
 		 280 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.469947  normal  0.0846818 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1480  protein of unknown function DUF75  24.72 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1196  protein of unknown function DUF75  24.91 
 
 		 296 aa  75.5  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00179103  normal  0.0638399 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1826  hypothetical protein  22.71 
 
 		 281 aa  75.1  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0638514  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11820  ATP-grasp superfamily enzyme  24.15 
 
 		 316 aa  71.2  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0485047  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2290  protein of unknown function DUF75  23.7 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00121228  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1509  protein of unknown function DUF75  24.9 
 
 		 311 aa  70.5  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0466221  normal  0.187119 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1837  protein of unknown function DUF75  27.87 
 
 		 284 aa  69.7  0.00000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0888  protein of unknown function DUF75  20.21 
 
 		 311 aa  67  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0447  hypothetical protein  20.8 
 
 		 277 aa  57  0.0000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000016468  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2232  protein of unknown function DUF75  22.56 
 
 		 342 aa  56.6  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.553046  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5325  protein of unknown function DUF75  22.31 
 
 		 298 aa  55.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4966  protein of unknown function DUF75  21.57 
 
 		 304 aa  53.5  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13300  Protein of unknown function DUF75  20.24 
 
 		 318 aa  51.6  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00661171  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1608  protein of unknown function DUF75  22.56 
 
 		 312 aa  51.2  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000205047 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1658  protein of unknown function DUF75  21.54 
 
 		 304 aa  50.1  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525262  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0028  hypothetical protein  29.06 
 
 		 310 aa  50.1  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3951  hypothetical protein  26.02 
 
 		 330 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.731534 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15610  Protein of unknown function DUF75  24.26 
 
 		 353 aa  47  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1825  protein of unknown function DUF75  21.21 
 
 		 311 aa  46.6  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1722  hypothetical protein  25.41 
 
 		 306 aa  46.6  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.901753  decreased coverage  0.000637714 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0926  hypothetical protein  26.5 
 
 		 313 aa  46.2  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1737  hypothetical protein  27.72 
 
 		 306 aa  46.2  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.226503  normal  0.890937 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2446  hypothetical protein  21.09 
 
 		 329 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211453 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5208  hypothetical protein  24.58 
 
 		 307 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00169383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2219  hypothetical protein  22.98 
 
 		 334 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.849197  normal  0.221625 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2173  hypothetical protein  22.98 
 
 		 334 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1614  hypothetical protein  25.83 
 
 		 312 aa  44.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00125325  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1247  hypothetical protein  24.81 
 
 		 312 aa  45.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0984474 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16730  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  24.27 
 
 		 348 aa  44.3  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.448913 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2162  hypothetical protein  22.98 
 
 		 334 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.530975  hitchhiker  0.00210211 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2852  hypothetical protein  21.25 
 
 		 311 aa  43.5  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6868  hypothetical protein  23.75 
 
 		 302 aa  43.5  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455453  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2326  hypothetical protein  21.6 
 
 		 301 aa  42.4  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677789  normal  0.402322 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>