78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1060 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1060  protein of unknown function DUF75  100 
 
 		 310 aa  628  1e-179  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.419014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22940  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  50.65 
 
 		 312 aa  305  7e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.15902 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1579  protein of unknown function DUF75  47.5 
 
 		 314 aa  251  9.000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.255791  normal  0.548098 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2427  protein of unknown function DUF75  48.55 
 
 		 315 aa  247  1e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175054  normal  0.221308 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1266  protein of unknown function DUF75  46.98 
 
 		 312 aa  245  6e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.825703  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0926  hypothetical protein  45.49 
 
 		 313 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4966  protein of unknown function DUF75  42.95 
 
 		 304 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6868  hypothetical protein  43.97 
 
 		 302 aa  232  6e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1658  protein of unknown function DUF75  43.66 
 
 		 304 aa  227  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525262  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1737  hypothetical protein  43.93 
 
 		 306 aa  224  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.226503  normal  0.890937 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5325  protein of unknown function DUF75  44.64 
 
 		 298 aa  224  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1722  hypothetical protein  43.93 
 
 		 306 aa  223  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.901753  decreased coverage  0.000637714 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3951  hypothetical protein  41.73 
 
 		 330 aa  223  4e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.731534 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0798  protein of unknown function DUF75  41.59 
 
 		 319 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5648  protein of unknown function DUF75  45.13 
 
 		 307 aa  222  7e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961809  normal  0.424673 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14850  ATP-grasp superfamily enzyme  41.61 
 
 		 307 aa  222  7e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2446  hypothetical protein  42.45 
 
 		 329 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211453 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2219  hypothetical protein  41.01 
 
 		 334 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.849197  normal  0.221625 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2162  hypothetical protein  41.01 
 
 		 334 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.530975  hitchhiker  0.00210211 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2173  hypothetical protein  41.01 
 
 		 334 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2326  hypothetical protein  40.43 
 
 		 301 aa  218  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677789  normal  0.402322 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0028  hypothetical protein  43.93 
 
 		 310 aa  218  1e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5208  hypothetical protein  40.2 
 
 		 307 aa  216  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00169383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2232  protein of unknown function DUF75  40.28 
 
 		 342 aa  215  9e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.553046  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1247  hypothetical protein  42.65 
 
 		 312 aa  212  7.999999999999999e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0984474 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3749  hypothetical protein  36.72 
 
 		 301 aa  207  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0709366  normal  0.107675 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1825  protein of unknown function DUF75  38.95 
 
 		 311 aa  204  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2852  hypothetical protein  39.64 
 
 		 311 aa  191  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1509  protein of unknown function DUF75  39.13 
 
 		 311 aa  191  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0466221  normal  0.187119 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2127  protein of unknown function DUF75  42 
 
 		 316 aa  190  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12728  hypothetical protein  40.57 
 
 		 324 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1608  protein of unknown function DUF75  37.63 
 
 		 312 aa  183  3e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000205047 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1614  hypothetical protein  36 
 
 		 312 aa  176  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00125325  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16730  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  35.04 
 
 		 348 aa  160  2e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.448913 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10660  Protein of unknown function DUF75  33.97 
 
 		 325 aa  155  6e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.120435  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13300  Protein of unknown function DUF75  33.33 
 
 		 318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00661171  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15610  Protein of unknown function DUF75  25.45 
 
 		 353 aa  107  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1077  hypothetical protein  27.66 
 
 		 299 aa  98.2  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.370003  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5826  protein of unknown function DUF75  28.67 
 
 		 297 aa  95.5  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22756  normal  0.126375 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5919  hypothetical protein  27.46 
 
 		 284 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239178  normal  0.0316841 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2785  protein of unknown function DUF75  26.88 
 
 		 286 aa  88.6  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000787132  hitchhiker  0.0000705422 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1826  hypothetical protein  28.67 
 
 		 281 aa  88.6  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0638514  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2210  protein of unknown function DUF75  27.4 
 
 		 298 aa  85.5  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2444  protein of unknown function DUF75  27.34 
 
 		 288 aa  85.1  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1855  hypothetical protein  25.18 
 
 		 284 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.982924 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2290  protein of unknown function DUF75  28.57 
 
 		 286 aa  80.9  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00121228  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3162  hypothetical protein  28.17 
 
 		 296 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3052  hypothetical protein  28.57 
 
 		 292 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2170  hypothetical protein  25.89 
 
 		 289 aa  79  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.260059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3150  hypothetical protein  27.92 
 
 		 296 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0142521  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2670  protein of unknown function DUF75  25.98 
 
 		 286 aa  78.6  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.361609  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3212  hypothetical protein  27.92 
 
 		 296 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.550185  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2143  protein of unknown function DUF75  26.41 
 
 		 301 aa  77.8  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0211773  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0888  protein of unknown function DUF75  26.42 
 
 		 311 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2324  hypothetical protein  25.45 
 
 		 289 aa  77  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.102651  decreased coverage  0.000172466 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3475  hypothetical protein  28.17 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5396  protein of unknown function DUF75  25.95 
 
 		 302 aa  74.7  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.380305  normal  0.382515 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12157  hypothetical protein  27.14 
 
 		 292 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00120164  normal  0.853503 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2640  hypothetical protein  26.35 
 
 		 280 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.512604  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22220  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  27.21 
 
 		 290 aa  72.4  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165906  normal  0.737687 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1173  hypothetical protein  28.62 
 
 		 283 aa  71.2  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2009  protein of unknown function DUF75  25.62 
 
 		 285 aa  71.6  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.547664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4890  hypothetical protein  26.53 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.469947  normal  0.0846818 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1837  protein of unknown function DUF75  26.97 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1548  protein of unknown function DUF75  26.83 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.831749  normal  0.218022 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1480  protein of unknown function DUF75  25.7 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1842  protein of unknown function DUF75  26.23 
 
 		 294 aa  67  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.316011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2630  hypothetical protein  24.21 
 
 		 282 aa  65.1  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16230  Protein of unknown function DUF75  25.28 
 
 		 269 aa  65.5  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.186088  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2246  protein of unknown function DUF75  23.3 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.640776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1196  protein of unknown function DUF75  23.88 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00179103  normal  0.0638399 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1912  protein of unknown function DUF75  23.78 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000183665 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0447  hypothetical protein  23.66 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000016468  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4500  hypothetical protein  22.66 
 
 		 282 aa  58.9  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00701907 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2169  hypothetical protein  23.08 
 
 		 301 aa  58.9  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0362139  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13900  ATP-grasp superfamily enzyme  23.21 
 
 		 286 aa  53.5  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.331595  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11820  ATP-grasp superfamily enzyme  24.42 
 
 		 316 aa  52  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0485047  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20950  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  24.51 
 
 		 306 aa  50.8  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.344012  normal  0.641113 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>