55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1797 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1797  hypothetical protein  100 
 
 
250 aa  499  1e-140  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0859  hypothetical protein  95.6 
 
 
250 aa  486  1e-136  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.776803  hitchhiker  0.00442614 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1058  hypothetical protein  95.2 
 
 
250 aa  483  1e-135  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0921  hypothetical protein  86.06 
 
 
251 aa  436  1e-121  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0226  hypothetical protein  66.67 
 
 
255 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2882  protein of unknown function DUF75  43.75 
 
 
251 aa  201  9.999999999999999e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.728218 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1007  protein of unknown function DUF75  43.93 
 
 
250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1565  3-isopropylmalate dehydratase  40.5 
 
 
256 aa  195  7e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0414  hypothetical protein  44.49 
 
 
255 aa  192  6e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.270771  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0959  protein of unknown function DUF75  42.39 
 
 
256 aa  187  1e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.405373  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1398  hypothetical protein  39.27 
 
 
261 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.139952  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2052  hypothetical protein  40.87 
 
 
248 aa  181  1e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2792  protein of unknown function DUF75  40.8 
 
 
250 aa  180  2e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.147305  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1126  hypothetical protein  39.84 
 
 
251 aa  179  4e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1150  protein of unknown function DUF75  39.43 
 
 
251 aa  168  9e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.13291  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1297  hypothetical protein  37.96 
 
 
252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.607867 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1950  hypothetical protein  40.59 
 
 
252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.622804 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0868  protein of unknown function DUF75  42.91 
 
 
258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2504  protein of unknown function DUF75  43.44 
 
 
255 aa  156  2e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0926  hypothetical protein  32.44 
 
 
248 aa  101  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0198  hypothetical protein  29.57 
 
 
257 aa  99  6e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0525  hypothetical protein  27.59 
 
 
276 aa  90.5  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.902286  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0720  hypothetical protein  28.27 
 
 
234 aa  90.9  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0501  hypothetical protein  26.72 
 
 
276 aa  87.4  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.686369  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_466  hypothetical protein  26.29 
 
 
276 aa  87.8  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.841701  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1086  3-isopropylmalate dehydratase  30.8 
 
 
248 aa  84.3  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2010  hypothetical protein  27.95 
 
 
237 aa  75.9  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0692  protein of unknown function DUF75  28.17 
 
 
249 aa  73.9  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.343449 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0058  hypothetical protein  27.98 
 
 
244 aa  73.6  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0354366 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0725  hypothetical protein  27.23 
 
 
226 aa  70.5  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1927  hypothetical protein  25.83 
 
 
242 aa  69.3  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.655814  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0357  hypothetical protein  22.03 
 
 
247 aa  66.2  0.0000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0800  hypothetical protein  23.01 
 
 
302 aa  66.2  0.0000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_787  hypothetical protein  23.14 
 
 
302 aa  64.7  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2829  protein of unknown function DUF75  25.86 
 
 
245 aa  64.3  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.626247  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0916  hypothetical protein  22.69 
 
 
302 aa  64.3  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.470991  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1661  hypothetical protein  26.13 
 
 
253 aa  64.3  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.32781  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0465  hypothetical protein  26 
 
 
245 aa  63.2  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0485311  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0076  hypothetical protein  28.27 
 
 
235 aa  61.2  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.656256  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1741  hypothetical protein  23.85 
 
 
235 aa  61.2  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.300848  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0007  hypothetical protein  24.05 
 
 
236 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.121063  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0721  hypothetical protein  24.58 
 
 
235 aa  60.1  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.538394  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0774  hypothetical protein  26.15 
 
 
253 aa  58.9  0.00000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.179453  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0161  hypothetical protein  23.4 
 
 
235 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.110174 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0667  protein of unknown function DUF75  22.98 
 
 
248 aa  58.2  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.440209  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0342  protein of unknown function DUF75  23.01 
 
 
245 aa  57  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3816  protein of unknown function DUF75  26.21 
 
 
253 aa  55.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0659933  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0790  protein of unknown function DUF75  25 
 
 
242 aa  53.9  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1902  protein of unknown function DUF75  23.4 
 
 
248 aa  53.5  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.180772  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0583  hypothetical protein  26.07 
 
 
241 aa  52.4  0.000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20950  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  22.49 
 
 
306 aa  50.8  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.344012  normal  0.641113 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2034  protein of unknown function DUF75  22.41 
 
 
255 aa  49.3  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1402  hypothetical protein  23.08 
 
 
267 aa  46.2  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1486  protein of unknown function DUF75  23.39 
 
 
246 aa  45.4  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.243377  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2009  protein of unknown function DUF75  23.45 
 
 
285 aa  42.4  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.547664  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>