54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1058 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1058  hypothetical protein  100 
 
 
250 aa  503  1e-141  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0859  hypothetical protein  98 
 
 
250 aa  494  1e-139  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.776803  hitchhiker  0.00442614 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1797  hypothetical protein  95.2 
 
 
250 aa  483  1e-135  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0921  hypothetical protein  85.66 
 
 
251 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0226  hypothetical protein  68.63 
 
 
255 aa  337  9e-92  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1007  protein of unknown function DUF75  44.35 
 
 
250 aa  202  5e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2882  protein of unknown function DUF75  42.91 
 
 
251 aa  199  3e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.728218 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1565  3-isopropylmalate dehydratase  40.62 
 
 
256 aa  194  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0414  hypothetical protein  44.9 
 
 
255 aa  191  8e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.270771  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0959  protein of unknown function DUF75  43.62 
 
 
256 aa  191  1e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.405373  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1398  hypothetical protein  38.87 
 
 
261 aa  181  9.000000000000001e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.139952  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2052  hypothetical protein  42.13 
 
 
248 aa  178  5.999999999999999e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1126  hypothetical protein  41.28 
 
 
251 aa  178  9e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2792  protein of unknown function DUF75  41.08 
 
 
250 aa  178  9e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.147305  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1950  hypothetical protein  40.59 
 
 
252 aa  165  8e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.622804 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1297  hypothetical protein  37.96 
 
 
252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.607867 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0868  protein of unknown function DUF75  42.91 
 
 
258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1150  protein of unknown function DUF75  37.5 
 
 
251 aa  163  2.0000000000000002e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.13291  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2504  protein of unknown function DUF75  44.03 
 
 
255 aa  158  7e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0926  hypothetical protein  32 
 
 
248 aa  100  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0198  hypothetical protein  29.64 
 
 
257 aa  99  7e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0720  hypothetical protein  28.69 
 
 
234 aa  93.2  4e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0525  hypothetical protein  27.04 
 
 
276 aa  87.4  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.902286  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_466  hypothetical protein  25.75 
 
 
276 aa  84.7  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.841701  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0501  hypothetical protein  26.18 
 
 
276 aa  84.3  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.686369  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1086  3-isopropylmalate dehydratase  32 
 
 
248 aa  83.2  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0058  hypothetical protein  29.71 
 
 
244 aa  77.8  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0354366 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0692  protein of unknown function DUF75  28.97 
 
 
249 aa  75.9  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.343449 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2010  hypothetical protein  29.02 
 
 
237 aa  75.1  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0725  hypothetical protein  28.12 
 
 
226 aa  71.2  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1927  hypothetical protein  27.62 
 
 
242 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.655814  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1661  hypothetical protein  26.38 
 
 
253 aa  67.8  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.32781  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0357  hypothetical protein  22.03 
 
 
247 aa  65.5  0.0000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0800  hypothetical protein  23.01 
 
 
302 aa  65.5  0.0000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0721  hypothetical protein  24.68 
 
 
235 aa  65.1  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.538394  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1741  hypothetical protein  23.5 
 
 
235 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.300848  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0161  hypothetical protein  24.68 
 
 
235 aa  63.5  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.110174 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0076  hypothetical protein  25.32 
 
 
235 aa  63.5  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.656256  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0916  hypothetical protein  22.27 
 
 
302 aa  63.5  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.470991  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2829  protein of unknown function DUF75  26.13 
 
 
245 aa  63.2  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.626247  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0007  hypothetical protein  24.47 
 
 
236 aa  62  0.000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.121063  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0465  hypothetical protein  26 
 
 
245 aa  61.2  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0485311  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0667  protein of unknown function DUF75  21.74 
 
 
248 aa  61.6  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.440209  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0774  hypothetical protein  25.96 
 
 
253 aa  61.2  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.179453  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_787  hypothetical protein  22.73 
 
 
302 aa  60.8  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0342  protein of unknown function DUF75  20.92 
 
 
245 aa  56.6  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20950  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  22.98 
 
 
306 aa  53.9  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.344012  normal  0.641113 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3816  protein of unknown function DUF75  25.73 
 
 
253 aa  53.9  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0659933  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0790  protein of unknown function DUF75  25.38 
 
 
242 aa  53.9  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2034  protein of unknown function DUF75  22.84 
 
 
255 aa  52.8  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1902  protein of unknown function DUF75  22.98 
 
 
248 aa  51.2  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.180772  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1402  hypothetical protein  23.31 
 
 
267 aa  49.7  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1486  protein of unknown function DUF75  24.8 
 
 
246 aa  49.3  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.243377  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0583  hypothetical protein  25.12 
 
 
241 aa  48.5  0.00009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>