76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2097 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2097  hypothetical protein  100 
 
 
210 aa  429  1e-119  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0633  hypothetical protein  73.58 
 
 
221 aa  322  3e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.831356  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2571  hypothetical protein  48.76 
 
 
208 aa  182  3e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.35222 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0610  hypothetical protein  44.66 
 
 
215 aa  171  5e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0471148  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2974  hypothetical protein  41.06 
 
 
217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.598698  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1992  hypothetical protein  39.11 
 
 
211 aa  128  7.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.770462  normal  0.123925 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2639  Uracil-DNA glycosylase superfamily  36.84 
 
 
208 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0183  Uracil-DNA glycosylase superfamily  39.89 
 
 
210 aa  116  3e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.589955  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3342  Uracil-DNA glycosylase superfamily  36.96 
 
 
216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.747141  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1578  Uracil-DNA glycosylase-like protein  37.91 
 
 
220 aa  112  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0318  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  31.46 
 
 
193 aa  84.7  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.100378  normal  0.0408737 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0248  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  27.59 
 
 
192 aa  73.2  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.548408  normal  0.366992 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3700  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  33.04 
 
 
193 aa  62.8  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1599  Uracil-DNA glycosylase superfamily  32.8 
 
 
212 aa  60.1  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0720375  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0366  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  31.36 
 
 
217 aa  58.2  0.00000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3772  Uracil-DNA glycosylase superfamily  27.37 
 
 
226 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.817518  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1564  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  31.36 
 
 
228 aa  52.8  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.14365  hitchhiker  0.00784209 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2864  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  31.29 
 
 
223 aa  52.8  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.48935  normal  0.109916 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3689  Uracil-DNA glycosylase superfamily protein  31.62 
 
 
226 aa  52.4  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0736  putative uracil-DNA glycosylase  31.2 
 
 
224 aa  51.2  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3755  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  27.17 
 
 
186 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0169947  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0814  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  31.01 
 
 
231 aa  50.8  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2370  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  26.89 
 
 
245 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.114234  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1589  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  25.73 
 
 
205 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.316918  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0544  Uracil-DNA glycosylase superfamily  28.07 
 
 
219 aa  49.7  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1494  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  25.73 
 
 
295 aa  49.3  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.363091  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3164  Uracil-DNA glycosylase superfamily  26.4 
 
 
221 aa  48.9  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.368387  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3631  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  31.4 
 
 
226 aa  48.9  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1361  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  29.51 
 
 
214 aa  48.9  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1363  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  26.32 
 
 
341 aa  48.9  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0270  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  27.05 
 
 
249 aa  48.5  0.00007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5015  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  25.71 
 
 
380 aa  48.5  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.641312  normal  0.046521 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2276  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  27.97 
 
 
243 aa  47.8  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1580  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  25.44 
 
 
220 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0245048  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2003  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  25.44 
 
 
433 aa  47.4  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2082  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  25.44 
 
 
455 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.268517  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0703  hypothetical protein  26.72 
 
 
207 aa  47.4  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.109523 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2607  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  25.44 
 
 
468 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1912  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  23.49 
 
 
199 aa  47.4  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1908  hypothetical protein  28.45 
 
 
218 aa  47.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.443294  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1001  Uracil-DNA glycosylase superfamily  28.45 
 
 
228 aa  46.6  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00625229 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1234  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  25.44 
 
 
358 aa  47  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532559  normal  0.188562 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1355  uracil-DNA glycosylase  25.44 
 
 
455 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00548958  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3230  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  25.44 
 
 
455 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2519  uracil-DNA glycosylase  25.44 
 
 
455 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31218  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2463  uracil-DNA glycosylase  25.44 
 
 
455 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1921  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  28.45 
 
 
210 aa  46.6  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.21092 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2515  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.95 
 
 
231 aa  46.6  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2121  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  25.66 
 
 
271 aa  46.6  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1236  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  25.62 
 
 
220 aa  46.2  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.289271  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1397  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  26.5 
 
 
317 aa  46.6  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.60425 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1944  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  24.56 
 
 
345 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0414  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  25.66 
 
 
330 aa  46.2  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2075  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  24.56 
 
 
367 aa  46.2  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2605  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  23.57 
 
 
203 aa  45.4  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1551  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  29.86 
 
 
220 aa  45.1  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2605  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  27.94 
 
 
200 aa  45.1  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0477634  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5352  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  23.68 
 
 
336 aa  45.1  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0380  Uracil-DNA glycosylase superfamily  25.6 
 
 
232 aa  44.3  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.172992  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1656  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  25.44 
 
 
401 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00964982 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6034  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  23.68 
 
 
346 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0371104  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2043  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  23.68 
 
 
346 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.910745  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2481  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  25.44 
 
 
414 aa  44.3  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.256124  hitchhiker  0.000867118 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2062  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  23.68 
 
 
342 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.735685 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1369  putative DNA polymerase-related protein, bacteriophage-type  24.79 
 
 
292 aa  43.9  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.424674  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2152  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  27.43 
 
 
241 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11285  hypothetical protein  25.96 
 
 
299 aa  43.9  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0466  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  24.59 
 
 
264 aa  42.4  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.113584  hitchhiker  0.00887798 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5226  Uracil-DNA glycosylase superfamily  27.88 
 
 
244 aa  42.4  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18668  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5828  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  25.53 
 
 
209 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2255  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  25 
 
 
304 aa  42  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10497  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1722  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  30.85 
 
 
225 aa  42  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.598455  normal  0.212618 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2037  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  25.6 
 
 
215 aa  41.6  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.161308  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2644  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  25.83 
 
 
225 aa  41.6  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0136839  hitchhiker  0.00783391 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0682  Uracil-DNA glycosylase superfamily  30.93 
 
 
276 aa  41.2  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0263882  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11480  Uracil-DNA glycosylase  22.69 
 
 
210 aa  41.6  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353711  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>