27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0610 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0610  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  433  1e-121  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0471148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2571  hypothetical protein  53.52 
 
 		 208 aa  218  7e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.35222 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2974  hypothetical protein  47.42 
 
 		 217 aa  191  6e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.598698  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2097  hypothetical protein  44.66 
 
 		 210 aa  171  5.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0633  hypothetical protein  46.46 
 
 		 221 aa  171  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.831356  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1992  hypothetical protein  30.73 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.770462  normal  0.123925 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2639  Uracil-DNA glycosylase superfamily  29.74 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3342  Uracil-DNA glycosylase superfamily  26.5 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.747141  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0318  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  28.72 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.100378  normal  0.0408737 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1578  Uracil-DNA glycosylase-like protein  27.54 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0183  Uracil-DNA glycosylase superfamily  26.94 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.589955  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0248  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  25 
 
 		 192 aa  52.4  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.548408  normal  0.366992 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0736  putative uracil-DNA glycosylase  27.86 
 
 		 224 aa  46.6  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3631  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  28.24 
 
 		 226 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2864  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  30.3 
 
 		 223 aa  45.4  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.48935  normal  0.109916 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3689  Uracil-DNA glycosylase superfamily protein  28.24 
 
 		 226 aa  45.1  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3772  Uracil-DNA glycosylase superfamily  28.24 
 
 		 226 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.817518  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1551  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  27.81 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2258  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  27.81 
 
 		 242 aa  43.9  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2236  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  29.77 
 
 		 282 aa  43.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2965  Uracil-DNA glycosylase superfamily  26 
 
 		 224 aa  42.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2632  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  26.67 
 
 		 226 aa  42.4  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.122532  normal  0.188311 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0720  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  30 
 
 		 217 aa  42  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.455468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2605  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  26.49 
 
 		 200 aa  42  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0477634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11285  hypothetical protein  26.27 
 
 		 299 aa  42  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4459  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  30 
 
 		 284 aa  41.6  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2644  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  26.67 
 
 		 225 aa  41.6  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0136839  hitchhiker  0.00783391 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>