More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0080 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0080  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
916 aa  1843    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.861573 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1732  serine/threonine protein kinase  30.27 
 
 
1065 aa  137  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.893925  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  40.62 
 
 
1856 aa  126  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2849  tyrosine protein kinase  40.38 
 
 
975 aa  126  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.272735  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  37.97 
 
 
1262 aa  122  3.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0575  serine/threonine-protein kinase  36.54 
 
 
934 aa  119  3e-25  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6667  serine/threonine protein kinase  42.47 
 
 
651 aa  119  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6045  serine/threonine protein kinase  43.67 
 
 
842 aa  117  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1711  serine/threonine protein kinase  39.02 
 
 
1043 aa  115  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.610631  normal  0.122083 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4130  serine/threonine protein kinase  29.57 
 
 
1005 aa  113  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0127288 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  36.96 
 
 
1626 aa  108  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4235  serine/threonine protein kinase  37.58 
 
 
381 aa  108  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4122  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  27.41 
 
 
1126 aa  108  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289873  decreased coverage  0.00939921 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1504  serine/threonine protein kinase  29.88 
 
 
1057 aa  107  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000141055 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  37.64 
 
 
880 aa  107  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  37.23 
 
 
1607 aa  107  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.78 
 
 
1398 aa  103  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0372  serine/threonine protein kinase  39.24 
 
 
1032 aa  103  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.904942 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  40.12 
 
 
1598 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  37.89 
 
 
1583 aa  103  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1422  serine/threonine protein kinase  36.7 
 
 
1046 aa  103  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3475  serine/threonine protein kinase  34.5 
 
 
425 aa  101  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0338486  normal  0.247852 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0134  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.65 
 
 
700 aa  101  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0666  protein kinase  38.71 
 
 
889 aa  101  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.415154 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  36.59 
 
 
1609 aa  100  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  38.36 
 
 
615 aa  100  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0088  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.81 
 
 
520 aa  100  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  36.11 
 
 
863 aa  99.8  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5246  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.06 
 
 
613 aa  100  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438769  hitchhiker  0.0079464 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0072  protein kinase  38.12 
 
 
661 aa  100  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4436  serine/threonine protein kinase  36.46 
 
 
691 aa  99  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0627175  normal  0.401092 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1272  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  36.08 
 
 
1190 aa  99  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000159501 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  38.18 
 
 
618 aa  99  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0087  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.81 
 
 
645 aa  98.2  6e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00875  serine/threonine protein kinase PpkA  35.8 
 
 
1032 aa  97.4  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.038169  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0928  serine/threonine protein kinase  29.38 
 
 
761 aa  96.3  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000612403  hitchhiker  1.21149e-16 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2313  protein kinase  32.04 
 
 
1018 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000403487 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3066  serine/threonine protein kinase  38.24 
 
 
598 aa  95.9  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370725  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0023  serine/threonine protein kinase  33.74 
 
 
746 aa  95.9  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3232  protein kinase  40.74 
 
 
623 aa  96.3  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0027  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.3 
 
 
664 aa  95.1  5e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3450  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  36.05 
 
 
1076 aa  95.1  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.88473  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3624  serine/threonine protein kinase  35.33 
 
 
552 aa  95.1  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.401978  decreased coverage  0.000211559 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00750  probable pknB serine-threonine protein kinase  36.42 
 
 
758 aa  95.5  5e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0038  serine/threonine protein kinase  37.42 
 
 
700 aa  95.1  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4000  Serine/threonine protein kinase-related protein  34.1 
 
 
587 aa  94.7  8e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6182  serine/threonine protein kinase  28.37 
 
 
1314 aa  94  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0261102 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1092  serine/threonine protein kinase  33.72 
 
 
969 aa  93.6  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.16 
 
 
647 aa  93.6  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.93 
 
 
1684 aa  94  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0026  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.36 
 
 
601 aa  93.6  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0020  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.02 
 
 
648 aa  94  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016475 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0145  serine/threonine protein kinase PpkA  35.23 
 
 
1032 aa  94  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  34.97 
 
 
612 aa  93.2  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0053  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.15 
 
 
603 aa  93.6  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3532  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  36.05 
 
 
1072 aa  93.2  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397828  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0995  protein kinase  35.67 
 
 
586 aa  93.6  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396652  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2845  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  33.97 
 
 
562 aa  92.4  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.985984  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0022  protein kinase  37.04 
 
 
597 aa  92.4  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0170  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.16 
 
 
681 aa  92.8  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.504438 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3570  serine/threonine protein kinase  29.56 
 
 
1479 aa  92.8  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0837409 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2578  serine/threonine protein kinase  34.87 
 
 
985 aa  92  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.790371  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3106  Serine/threonine protein kinase-related protein  35.76 
 
 
518 aa  92  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.828958  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3600  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.47 
 
 
1072 aa  92.4  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4174  serine/threonine protein kinase  34.71 
 
 
990 aa  92.4  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.957673  normal  0.29957 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1479  serine/threonine protein kinase  29.13 
 
 
571 aa  92  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.336782 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.62 
 
 
676 aa  92  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0030  kinase domain protein  34.83 
 
 
667 aa  92  5e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0571  serine/threonine protein kinase  34.88 
 
 
965 aa  91.7  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.616948 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  35.12 
 
 
642 aa  92  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1191  serine/threonine protein kinase  33.72 
 
 
969 aa  91.7  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0547  serine/threonine protein kinase  34.43 
 
 
678 aa  91.7  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  32.72 
 
 
666 aa  91.3  7e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2219  serine/threonine protein kinase  29.94 
 
 
862 aa  91.3  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.318627  normal  0.271916 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3370  Serine/threonine protein kinase-related protein  33.33 
 
 
1183 aa  91.3  7e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.16 
 
 
1267 aa  91.3  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.19 
 
 
1617 aa  91.3  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1383  serine/threonine protein kinase  35.06 
 
 
690 aa  91.3  8e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.149944  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.91 
 
 
1547 aa  91.3  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1729  serine/threonine protein kinase  33.76 
 
 
301 aa  90.9  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.372145  normal  0.952904 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0048  protein kinase  35.15 
 
 
609 aa  90.9  9e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0037  serine/threonine protein kinase  33.96 
 
 
750 aa  90.9  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1225  serine/threonine protein kinase  34.3 
 
 
897 aa  90.5  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal  0.0133766 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0018  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.92 
 
 
693 aa  90.9  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1337  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  33.66 
 
 
646 aa  90.5  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314134 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2907  serine/threonine protein kinase  36.97 
 
 
414 aa  89.7  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2939  serine/threonine protein kinase  34.62 
 
 
445 aa  89.7  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2951  protein kinase  36.97 
 
 
414 aa  89.7  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.426406  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0667  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.81 
 
 
652 aa  90.1  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0537547  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3315  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36 
 
 
661 aa  90.1  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2534  serine/threonine protein kinase  34.15 
 
 
530 aa  90.1  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.928543  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  33.73 
 
 
776 aa  89.4  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4458  serine/threonine protein kinase  37.2 
 
 
573 aa  89  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.776532  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0015  serine/threonine protein kinase  33.5 
 
 
624 aa  89.4  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.230646  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0023  serine/threonine protein kinase  33.5 
 
 
624 aa  89.4  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133871 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5082  protein kinase  34.72 
 
 
298 aa  89.4  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0015  serine/threonine protein kinase  33.5 
 
 
624 aa  89.4  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.243084 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0063  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.01 
 
 
594 aa  89.4  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5797  serine/threonine protein kinase  28.04 
 
 
707 aa  89.4  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0020  serine/threonine protein kinase  31.31 
 
 
632 aa  89  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>