76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2000 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2000  hypothetical protein  100 
 
 
216 aa  429  1e-119  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0268912  normal  0.270063 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2278  hypothetical protein  48.92 
 
 
233 aa  185  4e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0608  hydrolase of the alpha/beta superfamily-like protein  50.9 
 
 
211 aa  179  2.9999999999999997e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1392  hypothetical protein  47.51 
 
 
185 aa  141  6e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.290982  normal  0.186379 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3265  hypothetical protein  27.69 
 
 
218 aa  60.8  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13000  hypothetical protein  29.79 
 
 
210 aa  59.7  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5012  hypothetical protein  31.25 
 
 
209 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563787  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2843  hypothetical protein  26.53 
 
 
215 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0732715  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3963  hypothetical protein  27.37 
 
 
215 aa  57.4  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0627  hypothetical protein  24.88 
 
 
240 aa  55.8  0.0000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.753164  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0412  hypothetical protein  25 
 
 
241 aa  55.1  0.0000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2740  hypothetical protein  25.76 
 
 
215 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.194803  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1289  hypothetical protein  26.84 
 
 
219 aa  54.3  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.506664  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3237  hypothetical protein  26.42 
 
 
222 aa  53.5  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1610  putative alpha/beta hydrolase domain protein  26.26 
 
 
229 aa  53.9  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0158907 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1962  hypothetical protein  23.43 
 
 
205 aa  53.5  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1093  hypothetical protein  26.56 
 
 
219 aa  54.3  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.408425 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2454  hypothetical protein  25.76 
 
 
215 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0929  hypothetical protein  24.37 
 
 
224 aa  53.5  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.172272  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4700  hypothetical protein  27.55 
 
 
209 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00659716  normal  0.0518536 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2996  hypothetical protein  25.76 
 
 
215 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0535528 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2030  hypothetical protein  27.78 
 
 
220 aa  53.1  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0050  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  28.21 
 
 
215 aa  53.1  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000985448  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0923  hypothetical protein  24.35 
 
 
224 aa  53.1  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.60534  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4471  hypothetical protein  25.63 
 
 
223 aa  53.1  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.71583 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0793  hydrolase  29.81 
 
 
218 aa  53.1  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.100096  normal  0.0734113 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0236  alpha/beta hydrolase  23.43 
 
 
205 aa  53.1  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1666  hypothetical protein  25.76 
 
 
215 aa  52.8  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.622986  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2258  hypothetical protein  23.98 
 
 
224 aa  52.4  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5111  hypothetical protein  25 
 
 
219 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.001249 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2587  hypothetical protein  28.41 
 
 
220 aa  52  0.000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2799  hydrolase  28.18 
 
 
218 aa  52  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0285215  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2330  hypothetical protein  30.19 
 
 
215 aa  52  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2838  hypothetical protein  26.19 
 
 
242 aa  51.6  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0121852  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2433  hypothetical protein  21.26 
 
 
225 aa  51.2  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0301699  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0310  hypothetical protein  28.82 
 
 
208 aa  51.2  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.910539  decreased coverage  0.00111956 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2714  hypothetical protein  28.32 
 
 
220 aa  50.8  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1470  hypothetical protein  23.77 
 
 
225 aa  51.2  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.473504  normal  0.0195157 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1239  hypothetical protein  25.45 
 
 
217 aa  50.4  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0096  hypothetical protein  25.25 
 
 
230 aa  50.8  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.596881  normal  0.945434 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2365  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  25.44 
 
 
241 aa  50.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0893  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  34.44 
 
 
210 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0706  hypothetical protein  22.73 
 
 
232 aa  49.3  0.00004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1310  hypothetical protein  29.81 
 
 
227 aa  49.3  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.305066  normal  0.638588 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1902  putative alpha/beta hydrolase protein  24.55 
 
 
225 aa  49.3  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149979 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2097  hypothetical protein  25.44 
 
 
219 aa  48.9  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.172355  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57680  hypothetical protein  30.64 
 
 
209 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3190  alpha/beta hydrolase family protein  32.04 
 
 
201 aa  49.3  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0444  hypothetical protein  25.44 
 
 
219 aa  48.9  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.082475  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2109  putative alpha/beta hydrolase protein  24.55 
 
 
225 aa  49.3  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0628011 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0692  hypothetical protein  23.5 
 
 
218 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.627981  normal  0.135174 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1634  putative alpha/beta hydrolase  25.93 
 
 
217 aa  48.5  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000174471 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3975  hypothetical protein  24.1 
 
 
218 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.827337 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4343  hypothetical protein  24.1 
 
 
218 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.519854  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1042  hypothetical protein  26.63 
 
 
227 aa  48.1  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.118835  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5850  hypothetical protein  24 
 
 
219 aa  48.5  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1783  hypothetical protein  22.45 
 
 
224 aa  47  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.025534  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4455  conserved hypothetical protein; putative alpha/beta hydrolase domain  23.59 
 
 
218 aa  47  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.136378  normal  0.0686952 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0452  hypothetical protein  25.15 
 
 
217 aa  47  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2367  hypothetical protein  24.55 
 
 
217 aa  47  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.560308  normal  0.32794 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2959  hypothetical protein  23.3 
 
 
219 aa  47.4  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.483607 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0892  hypothetical protein  24.26 
 
 
246 aa  46.2  0.0003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0203  hypothetical protein  29.06 
 
 
223 aa  46.6  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.478331  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0808  hypothetical protein  23.64 
 
 
235 aa  45.8  0.0005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.324402  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2585  hypothetical protein  23.64 
 
 
217 aa  44.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.133962  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4124  hypothetical protein  33.33 
 
 
211 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3842  hypothetical protein  26.42 
 
 
217 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4430  hypothetical protein  33.33 
 
 
209 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104862  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0917  hypothetical protein  28.33 
 
 
214 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.203911  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1407  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  24.86 
 
 
221 aa  42.7  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.192028 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3882  hypothetical protein  29.67 
 
 
218 aa  42  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1102  hypothetical protein  28 
 
 
222 aa  42  0.007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2040  Carboxymethylenebutenolidase  29.76 
 
 
292 aa  42  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.143956  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1194  hypothetical protein  28 
 
 
222 aa  42  0.007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.410883  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2433  Carboxymethylenebutenolidase  29.76 
 
 
292 aa  42  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2903  hypothetical protein  28.67 
 
 
212 aa  41.6  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>