146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1398 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1398  arginyl-tRNA-protein transferase  100 
 
 		 236 aa  485  1e-136  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1714  arginyl-tRNA-protein transferase  51.75 
 
 		 239 aa  216  2e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484439 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3588  arginyl-tRNA-protein transferase  44.54 
 
 		 235 aa  208  5e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3351  hypothetical protein  44.1 
 
 		 235 aa  204  7e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.190221  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4006  arginyl-tRNA-protein transferase  45.89 
 
 		 235 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315442 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1827  arginyl-tRNA-protein transferase  45.45 
 
 		 235 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.856379  normal  0.0364428 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30260  arginyl-tRNA-protein transferase  45.92 
 
 		 235 aa  202  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3410  arginyl-tRNA-protein transferase  45.89 
 
 		 235 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.317388 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2589  arginyl-tRNA-protein transferase  45.92 
 
 		 235 aa  202  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.205058  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3611  arginyl-tRNA-protein transferase  45.45 
 
 		 235 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.85938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3181  arginyl-tRNA-protein transferase  43.23 
 
 		 235 aa  201  8e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.248167  normal  0.0460167 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28250  arginyl-tRNA-protein transferase  45.85 
 
 		 252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2391  arginyl-tRNA-protein transferase  43.67 
 
 		 235 aa  192  5e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0694877 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1690  arginyl-tRNA-protein transferase  39.3 
 
 		 236 aa  191  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.672767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1109  arginyl-tRNA-protein transferase  45.92 
 
 		 251 aa  189  2.9999999999999997e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157369  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1791  arginyl-tRNA-protein transferase  45 
 
 		 233 aa  189  4e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0019  arginyl-tRNA-protein transferase  42.79 
 
 		 247 aa  189  4e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2597  arginyl-tRNA-protein transferase  41.94 
 
 		 238 aa  184  8e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00148691  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0648  arginyl-tRNA-protein transferase  47.14 
 
 		 238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2438  arginyl-tRNA-protein transferase  44.25 
 
 		 247 aa  180  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1724  arginyl-tRNA-protein transferase  41.26 
 
 		 253 aa  179  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.290117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0334  arginyl-tRNA-protein transferase  45.34 
 
 		 254 aa  179  4e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0236431  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1755  arginyl-tRNA-protein transferase  39.91 
 
 		 237 aa  179  4e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0304  arginyl-tRNA-protein transferase  45.34 
 
 		 254 aa  178  7e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0181876  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1663  arginyl-tRNA-protein transferase  38.52 
 
 		 279 aa  176  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0145011 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04859  arginyl-tRNA-protein transferase  46.32 
 
 		 251 aa  176  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.791729  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1195  arginyl-tRNA-protein transferase  40.53 
 
 		 247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4697  arginyl-tRNA-protein transferase  38.98 
 
 		 276 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.165949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1456  arginyl-tRNA-protein transferase  38.49 
 
 		 276 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.691361  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2042  arginyl-tRNA-protein transferase  39.66 
 
 		 240 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000226368  normal  0.32871 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1477  arginyl-tRNA-protein transferase  39.06 
 
 		 276 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.718047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2348  arginyl-tRNA-protein transferase  41.23 
 
 		 253 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1075  arginyl-tRNA-protein transferase  38.49 
 
 		 276 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1555  arginyl-tRNA-protein transferase  38.49 
 
 		 276 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1531  arginyl-tRNA-protein transferase  38.49 
 
 		 276 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1677  arginyl-tRNA-protein transferase  38.49 
 
 		 276 aa  172  5e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.278409 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0181  Arginyltransferase  43.84 
 
 		 246 aa  171  7.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2506  arginyl-tRNA-protein transferase  36.73 
 
 		 279 aa  170  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.60461 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1731  arginyl-tRNA-protein transferase  38.2 
 
 		 273 aa  170  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.226677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1214  arginyl-tRNA-protein transferase  39.06 
 
 		 262 aa  169  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0519713 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2592  arginyl-tRNA-protein transferase  40.35 
 
 		 242 aa  169  3e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.214767  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1318  arginyl-tRNA-protein transferase  38.4 
 
 		 266 aa  169  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2510  arginyl-tRNA-protein transferase  37.66 
 
 		 276 aa  167  9e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0990136  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2530  arginyl-tRNA-protein transferase  37.71 
 
 		 241 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000125656  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2325  arginyl-tRNA-protein transferase  38.5 
 
 		 254 aa  165  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.117095  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1468  arginyl-tRNA-protein transferase  40.18 
 
 		 256 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.874672  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1568  arginyl-tRNA-protein transferase  39.74 
 
 		 234 aa  164  8e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000198847  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1252  arginyl-tRNA-protein transferase  37.24 
 
 		 276 aa  164  9e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1979  arginyl-tRNA-protein transferase  37.24 
 
 		 276 aa  164  9e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1735  arginyl-tRNA-protein transferase  37.24 
 
 		 276 aa  164  9e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0393  arginyl-tRNA-protein transferase  37.24 
 
 		 276 aa  164  9e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.639576  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1810  arginyl-tRNA-protein transferase  37.24 
 
 		 276 aa  164  9e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.663288  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1826  arginyl-tRNA-protein transferase  37.24 
 
 		 276 aa  164  9e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0769  arginyl-tRNA-protein transferase  37.24 
 
 		 276 aa  164  9e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.107158  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2372  arginyl-tRNA-protein transferase  39.64 
 
 		 231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0011943  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1979  arginyl-tRNA-protein transferase  37.71 
 
 		 247 aa  162  3e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0083576 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4859  arginyl-tRNA-protein transferase  39.65 
 
 		 249 aa  162  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2377  arginyl-tRNA-protein transferase  39.38 
 
 		 249 aa  162  6e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2054  arginyl-tRNA-protein transferase  37.55 
 
 		 237 aa  160  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000273717  normal  0.355745 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1836  arginyl-tRNA-protein transferase  34.76 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000137975  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0425  Arginyltransferase  40.72 
 
 		 236 aa  159  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557109  hitchhiker  0.00000000502727 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0249  arginine-tRNA--protein transferase  40.72 
 
 		 236 aa  159  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1787  arginyl-tRNA-protein transferase  39.57 
 
 		 246 aa  159  3e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1987  arginyl-tRNA-protein transferase  39.57 
 
 		 246 aa  159  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13709  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1616  arginyl-tRNA-protein transferase  37.61 
 
 		 257 aa  157  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0617  arginyl-tRNA-protein transferase  40.36 
 
 		 281 aa  157  1e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.224071 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0931  arginyl-tRNA-protein transferase  38.1 
 
 		 248 aa  155  4e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0193494  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1075  arginyl-tRNA-protein transferase  38.1 
 
 		 248 aa  155  4e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.646097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1337  arginyl-tRNA-protein transferase  38.79 
 
 		 233 aa  155  5.0000000000000005e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0223511  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1931  arginyl-tRNA-protein transferase  36.32 
 
 		 255 aa  154  9e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14051  normal  0.0172021 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1603  arginyl-tRNA-protein transferase  36.32 
 
 		 254 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.117832  normal  0.3797 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2697  arginyl-tRNA-protein transferase  36.32 
 
 		 236 aa  153  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000253337  normal  0.128903 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3105  arginyl-tRNA-protein transferase  39.07 
 
 		 245 aa  153  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.526442  normal  0.279686 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0237  arginyl-tRNA-protein transferase  40.09 
 
 		 262 aa  153  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2225  arginyl-tRNA-protein transferase  36.97 
 
 		 235 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000635584  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2252  arginyl-tRNA-protein transferase  33.75 
 
 		 239 aa  151  7e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000157492  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2470  arginyl-tRNA-protein transferase  35.9 
 
 		 236 aa  151  7e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000771659  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1755  arginyl-tRNA-protein transferase  37.5 
 
 		 238 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000858101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1650  arginyl-tRNA-protein transferase  36.97 
 
 		 238 aa  151  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1079  arginyl-tRNA-protein transferase  36.49 
 
 		 252 aa  150  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.474847  normal  0.305047 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0742  arginyl-tRNA-protein transferase  35.87 
 
 		 248 aa  150  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2583  arginyl-tRNA-protein transferase  35.9 
 
 		 236 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000870424  normal  0.0975132 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2624  arginyl-tRNA-protein transferase  38.39 
 
 		 238 aa  149  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0882  arginyl-tRNA-protein transferase  38.29 
 
 		 274 aa  150  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.883111  normal  0.212402 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1881  arginyl-tRNA-protein transferase  35.9 
 
 		 236 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000197497  hitchhiker  0.000837728 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2463  arginyl-tRNA-protein transferase  35.9 
 
 		 236 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000249099  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1082  arginyl-tRNA-protein transferase  36.21 
 
 		 285 aa  148  9e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.188934  normal  0.420596 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2639  arginyl-tRNA-protein transferase  38.79 
 
 		 280 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.286005  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1204  arginyl-tRNA-protein transferase  39.9 
 
 		 257 aa  146  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1725  arginyl-tRNA-protein transferase  36.55 
 
 		 238 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000702749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1296  arginyl-tRNA-protein transferase  38.96 
 
 		 280 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1175  arginyl-tRNA-protein transferase  38.96 
 
 		 280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2883  arginyl-tRNA-protein transferase  39.65 
 
 		 241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167037 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01569  arginyl-tRNA-protein transferase  39.11 
 
 		 233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3351  arginyl-tRNA-protein transferase  38.25 
 
 		 260 aa  145  7.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.470069  normal  0.662203 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1903  arginyl-tRNA-protein transferase  38.36 
 
 		 286 aa  144  8.000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.72885 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3623  arginyl-tRNA-protein transferase  40.44 
 
 		 251 aa  144  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1888  arginyl-tRNA-protein transferase  33.77 
 
 		 236 aa  144  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000499329  hitchhiker  0.000014618 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003954  arginine-tRNA-protein transferase  37.5 
 
 		 233 aa  144  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000149764  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4292  arginyl-tRNA-protein transferase  37.18 
 
 		 249 aa  144  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>