143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3623 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3623  arginyl-tRNA-protein transferase  100 
 
 
251 aa  522  1e-147  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1787  arginyl-tRNA-protein transferase  82.11 
 
 
246 aa  424  1e-118  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1987  arginyl-tRNA-protein transferase  82.11 
 
 
246 aa  424  1e-118  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13709  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2325  arginyl-tRNA-protein transferase  76.61 
 
 
254 aa  400  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.117095  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3105  arginyl-tRNA-protein transferase  78.05 
 
 
245 aa  403  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.526442  normal  0.279686 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2377  arginyl-tRNA-protein transferase  75.41 
 
 
249 aa  389  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1724  arginyl-tRNA-protein transferase  75 
 
 
253 aa  385  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.290117  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1468  arginyl-tRNA-protein transferase  75.92 
 
 
256 aa  380  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.874672  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4859  arginyl-tRNA-protein transferase  72.98 
 
 
249 aa  372  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1979  arginyl-tRNA-protein transferase  71.54 
 
 
247 aa  368  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0083576 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2348  arginyl-tRNA-protein transferase  69.35 
 
 
253 aa  353  1e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1616  arginyl-tRNA-protein transferase  65.86 
 
 
257 aa  337  9e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1931  arginyl-tRNA-protein transferase  65.86 
 
 
255 aa  337  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14051  normal  0.0172021 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1603  arginyl-tRNA-protein transferase  65.46 
 
 
254 aa  336  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.117832  normal  0.3797 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4697  arginyl-tRNA-protein transferase  65.1 
 
 
276 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.165949  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1252  arginyl-tRNA-protein transferase  65.32 
 
 
276 aa  333  2e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1979  arginyl-tRNA-protein transferase  65.32 
 
 
276 aa  333  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1075  arginyl-tRNA-protein transferase  65.1 
 
 
276 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1555  arginyl-tRNA-protein transferase  65.1 
 
 
276 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1735  arginyl-tRNA-protein transferase  65.32 
 
 
276 aa  333  2e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0393  arginyl-tRNA-protein transferase  65.32 
 
 
276 aa  333  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.639576  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1810  arginyl-tRNA-protein transferase  65.32 
 
 
276 aa  333  2e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.663288  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1826  arginyl-tRNA-protein transferase  65.32 
 
 
276 aa  333  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0769  arginyl-tRNA-protein transferase  65.32 
 
 
276 aa  333  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.107158  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1531  arginyl-tRNA-protein transferase  65.1 
 
 
276 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1477  arginyl-tRNA-protein transferase  65.73 
 
 
276 aa  331  6e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.718047  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1663  arginyl-tRNA-protein transferase  64.31 
 
 
279 aa  331  6e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0145011 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1677  arginyl-tRNA-protein transferase  64.71 
 
 
276 aa  331  7.000000000000001e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.278409 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2510  arginyl-tRNA-protein transferase  65.32 
 
 
276 aa  331  8e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0990136  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1318  arginyl-tRNA-protein transferase  66.53 
 
 
266 aa  330  2e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2506  arginyl-tRNA-protein transferase  63.04 
 
 
279 aa  329  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.60461 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1456  arginyl-tRNA-protein transferase  65.32 
 
 
276 aa  330  2e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.691361  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1214  arginyl-tRNA-protein transferase  65.61 
 
 
262 aa  327  8e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0519713 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1731  arginyl-tRNA-protein transferase  64.29 
 
 
273 aa  327  8e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.226677  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1195  arginyl-tRNA-protein transferase  62.75 
 
 
247 aa  314  9.999999999999999e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1079  arginyl-tRNA-protein transferase  59.68 
 
 
252 aa  307  8e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.474847  normal  0.305047 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0742  arginyl-tRNA-protein transferase  58.54 
 
 
248 aa  300  1e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2592  arginyl-tRNA-protein transferase  61.98 
 
 
242 aa  297  1e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.214767  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2708  arginyl-tRNA-protein transferase  56.63 
 
 
251 aa  284  8e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2042  arginyl-tRNA-protein transferase  54.55 
 
 
240 aa  254  7e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000226368  normal  0.32871 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0931  arginyl-tRNA-protein transferase  48.98 
 
 
248 aa  241  9e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0193494  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1075  arginyl-tRNA-protein transferase  48.98 
 
 
248 aa  241  9e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.646097  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3588  arginyl-tRNA-protein transferase  48.1 
 
 
235 aa  207  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3181  arginyl-tRNA-protein transferase  47.68 
 
 
235 aa  206  4e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.248167  normal  0.0460167 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3351  hypothetical protein  47.26 
 
 
235 aa  204  9e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.190221  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28250  arginyl-tRNA-protein transferase  45.57 
 
 
252 aa  197  9e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1755  arginyl-tRNA-protein transferase  42.5 
 
 
237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2597  arginyl-tRNA-protein transferase  44.26 
 
 
238 aa  196  3e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00148691  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0648  arginyl-tRNA-protein transferase  46.61 
 
 
238 aa  196  3e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4006  arginyl-tRNA-protein transferase  44.3 
 
 
235 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315442 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2438  arginyl-tRNA-protein transferase  45.31 
 
 
247 aa  192  3e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1827  arginyl-tRNA-protein transferase  44.3 
 
 
235 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.856379  normal  0.0364428 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3611  arginyl-tRNA-protein transferase  44.3 
 
 
235 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.85938  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2391  arginyl-tRNA-protein transferase  43.46 
 
 
235 aa  191  8e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0694877 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2589  arginyl-tRNA-protein transferase  44.3 
 
 
235 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.205058  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3410  arginyl-tRNA-protein transferase  44.3 
 
 
235 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.317388 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2121  arginyl-tRNA-protein transferase  46.12 
 
 
244 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30260  arginyl-tRNA-protein transferase  43.88 
 
 
235 aa  188  8e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1204  arginyl-tRNA-protein transferase  43.8 
 
 
257 aa  187  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2986  arginyl-tRNA-protein transferase  42.74 
 
 
258 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.575869  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2621  arginyl-tRNA-protein transferase  42.74 
 
 
257 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2658  arginyl-tRNA-protein transferase  42.74 
 
 
257 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.458469  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1690  arginyl-tRNA-protein transferase  40 
 
 
236 aa  177  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.672767  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4292  arginyl-tRNA-protein transferase  41.83 
 
 
249 aa  176  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2649  arginyl-tRNA-protein transferase  42.74 
 
 
258 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.803585 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2883  arginyl-tRNA-protein transferase  43.88 
 
 
241 aa  176  4e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167037 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1109  arginyl-tRNA-protein transferase  41.32 
 
 
251 aa  175  7e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157369  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2242  arginyl-tRNA-protein transferase  41.25 
 
 
257 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.354347  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4657  arginyl-tRNA-protein transferase  41.08 
 
 
258 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1082  arginyl-tRNA-protein transferase  39.68 
 
 
285 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.188934  normal  0.420596 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3351  arginyl-tRNA-protein transferase  39.26 
 
 
260 aa  171  9e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.470069  normal  0.662203 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1911  arginyl-tRNA-protein transferase  40.83 
 
 
257 aa  171  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.582376  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1714  arginyl-tRNA-protein transferase  42.21 
 
 
239 aa  171  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.484439 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0237  arginyl-tRNA-protein transferase  40.95 
 
 
262 aa  171  1e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04859  arginyl-tRNA-protein transferase  42.08 
 
 
251 aa  170  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.791729  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0304  arginyl-tRNA-protein transferase  40.5 
 
 
254 aa  169  3e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0181876  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4241  arginyl-tRNA-protein transferase  41.7 
 
 
248 aa  169  4e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4761  arginyl-tRNA-protein transferase  41.7 
 
 
248 aa  169  5e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.767227  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4611  arginyl-tRNA-protein transferase  41.7 
 
 
248 aa  168  6e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.209476  normal  0.240432 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0425  Arginyltransferase  40 
 
 
236 aa  168  6e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557109  hitchhiker  0.00000000502727 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0249  arginine-tRNA--protein transferase  40 
 
 
236 aa  168  6e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0019  arginyl-tRNA-protein transferase  40 
 
 
247 aa  168  7e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5634  arginyl-tRNA-protein transferase  40.55 
 
 
251 aa  168  8e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.336417 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0334  arginyl-tRNA-protein transferase  40.68 
 
 
254 aa  167  1e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0236431  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1111  arginyl-tRNA-protein transferase  38.65 
 
 
258 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0181  Arginyltransferase  41.06 
 
 
246 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1260  arginyl-tRNA-protein transferase  37.85 
 
 
258 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.340737 
 
 
-
 
NC_004310  BR0755  arginyl-tRNA-protein transferase  40.08 
 
 
249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.576435  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0882  arginyl-tRNA-protein transferase  38.91 
 
 
274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.883111  normal  0.212402 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0750  arginyl-tRNA-protein transferase  40.08 
 
 
249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1175  arginyl-tRNA-protein transferase  40 
 
 
280 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2393  arginyl-tRNA-protein transferase  38.59 
 
 
266 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3062  arginyl-tRNA-protein transferase  39.92 
 
 
283 aa  163  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1127  arginyl-tRNA-protein transferase  40.08 
 
 
249 aa  162  6e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1791  arginyl-tRNA-protein transferase  40.43 
 
 
233 aa  160  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2538  arginyl-tRNA-protein transferase  38.87 
 
 
249 aa  159  5e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1601  arginyl-tRNA-protein transferase  39.04 
 
 
253 aa  158  7e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1296  arginyl-tRNA-protein transferase  39.17 
 
 
280 aa  158  8e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2168  arginyl-tRNA-protein transferase  38.27 
 
 
281 aa  158  9e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0971053  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2639  arginyl-tRNA-protein transferase  39.17 
 
 
280 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.286005  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>