147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1109 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_1109  arginyl-tRNA-protein transferase  100 
 
 
251 aa  513  1e-144  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157369  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04859  arginyl-tRNA-protein transferase  69.67 
 
 
251 aa  347  7e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.791729  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0304  arginyl-tRNA-protein transferase  61.22 
 
 
254 aa  317  1e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0181876  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0334  arginyl-tRNA-protein transferase  60.41 
 
 
254 aa  311  3.9999999999999997e-84  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0236431  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0019  arginyl-tRNA-protein transferase  50.85 
 
 
247 aa  224  1e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1690  arginyl-tRNA-protein transferase  42.8 
 
 
236 aa  223  3e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.672767  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2438  arginyl-tRNA-protein transferase  50.43 
 
 
247 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30260  arginyl-tRNA-protein transferase  46.75 
 
 
235 aa  209  4e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2589  arginyl-tRNA-protein transferase  46.75 
 
 
235 aa  209  5e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.205058  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3588  arginyl-tRNA-protein transferase  46.32 
 
 
235 aa  206  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3611  arginyl-tRNA-protein transferase  46.32 
 
 
235 aa  205  6e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.85938  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2597  arginyl-tRNA-protein transferase  44.98 
 
 
238 aa  202  5e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00148691  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3410  arginyl-tRNA-protein transferase  46.32 
 
 
235 aa  201  9e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.317388 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2391  arginyl-tRNA-protein transferase  45.45 
 
 
235 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0694877 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1677  arginyl-tRNA-protein transferase  44.92 
 
 
276 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.278409 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4006  arginyl-tRNA-protein transferase  45.45 
 
 
235 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315442 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3181  arginyl-tRNA-protein transferase  44.59 
 
 
235 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.248167  normal  0.0460167 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1827  arginyl-tRNA-protein transferase  45.45 
 
 
235 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.856379  normal  0.0364428 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3351  hypothetical protein  44.59 
 
 
235 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.190221  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1175  arginyl-tRNA-protein transferase  43.33 
 
 
280 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1075  arginyl-tRNA-protein transferase  43.7 
 
 
276 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28250  arginyl-tRNA-protein transferase  46.75 
 
 
252 aa  197  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1555  arginyl-tRNA-protein transferase  43.7 
 
 
276 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1531  arginyl-tRNA-protein transferase  43.7 
 
 
276 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4859  arginyl-tRNA-protein transferase  45.11 
 
 
249 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4697  arginyl-tRNA-protein transferase  44.12 
 
 
276 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.165949  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1979  arginyl-tRNA-protein transferase  42.92 
 
 
247 aa  194  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0083576 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1663  arginyl-tRNA-protein transferase  43.57 
 
 
279 aa  194  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0145011 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2348  arginyl-tRNA-protein transferase  42.49 
 
 
253 aa  193  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1477  arginyl-tRNA-protein transferase  42.86 
 
 
276 aa  193  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.718047  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1456  arginyl-tRNA-protein transferase  42.86 
 
 
276 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.691361  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1252  arginyl-tRNA-protein transferase  44.17 
 
 
276 aa  192  6e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1979  arginyl-tRNA-protein transferase  44.17 
 
 
276 aa  192  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2377  arginyl-tRNA-protein transferase  42.8 
 
 
249 aa  191  6e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1735  arginyl-tRNA-protein transferase  44.17 
 
 
276 aa  192  6e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0393  arginyl-tRNA-protein transferase  44.17 
 
 
276 aa  192  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.639576  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1296  arginyl-tRNA-protein transferase  42.5 
 
 
280 aa  192  6e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1810  arginyl-tRNA-protein transferase  44.17 
 
 
276 aa  192  6e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.663288  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1826  arginyl-tRNA-protein transferase  44.17 
 
 
276 aa  192  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0769  arginyl-tRNA-protein transferase  44.17 
 
 
276 aa  192  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.107158  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1787  arginyl-tRNA-protein transferase  43.16 
 
 
246 aa  191  7e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1987  arginyl-tRNA-protein transferase  43.16 
 
 
246 aa  191  7e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13709  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1755  arginyl-tRNA-protein transferase  41.77 
 
 
237 aa  191  8e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0181  Arginyltransferase  45.08 
 
 
246 aa  190  2e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2639  arginyl-tRNA-protein transferase  42.08 
 
 
280 aa  189  4e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.286005  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1318  arginyl-tRNA-protein transferase  40.93 
 
 
266 aa  189  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2510  arginyl-tRNA-protein transferase  43.1 
 
 
276 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0990136  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2042  arginyl-tRNA-protein transferase  42.55 
 
 
240 aa  187  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000226368  normal  0.32871 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1214  arginyl-tRNA-protein transferase  41.03 
 
 
262 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0519713 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2372  arginyl-tRNA-protein transferase  41.7 
 
 
231 aa  186  3e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0011943  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1724  arginyl-tRNA-protein transferase  42.42 
 
 
253 aa  186  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.290117  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2592  arginyl-tRNA-protein transferase  45.3 
 
 
242 aa  184  9e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.214767  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1616  arginyl-tRNA-protein transferase  40.68 
 
 
257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0648  arginyl-tRNA-protein transferase  44.02 
 
 
238 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1731  arginyl-tRNA-protein transferase  41.35 
 
 
273 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.226677  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2325  arginyl-tRNA-protein transferase  40.85 
 
 
254 aa  181  7e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.117095  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1931  arginyl-tRNA-protein transferase  39.83 
 
 
255 aa  181  7e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14051  normal  0.0172021 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1082  arginyl-tRNA-protein transferase  40 
 
 
285 aa  181  9.000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.188934  normal  0.420596 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1601  arginyl-tRNA-protein transferase  38.91 
 
 
253 aa  181  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1468  arginyl-tRNA-protein transferase  43.11 
 
 
256 aa  181  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.874672  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1603  arginyl-tRNA-protein transferase  39.83 
 
 
254 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.117832  normal  0.3797 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2242  arginyl-tRNA-protein transferase  40.42 
 
 
257 aa  180  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.354347  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3105  arginyl-tRNA-protein transferase  43.3 
 
 
245 aa  180  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.526442  normal  0.279686 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1791  arginyl-tRNA-protein transferase  46.49 
 
 
233 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0882  arginyl-tRNA-protein transferase  40.85 
 
 
274 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.883111  normal  0.212402 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1079  arginyl-tRNA-protein transferase  38.89 
 
 
252 aa  179  2.9999999999999997e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.474847  normal  0.305047 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0425  Arginyltransferase  41.95 
 
 
236 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557109  hitchhiker  0.00000000502727 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0249  arginine-tRNA--protein transferase  41.95 
 
 
236 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2506  arginyl-tRNA-protein transferase  39.92 
 
 
279 aa  177  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.60461 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0742  arginyl-tRNA-protein transferase  37.5 
 
 
248 aa  177  1e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4657  arginyl-tRNA-protein transferase  39.92 
 
 
258 aa  177  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0617  arginyl-tRNA-protein transferase  41.56 
 
 
281 aa  178  1e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.224071 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1101  arginyl-tRNA-protein transferase  40.43 
 
 
284 aa  177  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4292  arginyl-tRNA-protein transferase  41.42 
 
 
249 aa  177  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2393  arginyl-tRNA-protein transferase  38.72 
 
 
266 aa  174  9e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1911  arginyl-tRNA-protein transferase  40.42 
 
 
257 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.582376  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1195  arginyl-tRNA-protein transferase  40.69 
 
 
247 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1398  arginyl-tRNA-protein transferase  45.92 
 
 
236 aa  172  5e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1714  arginyl-tRNA-protein transferase  43.7 
 
 
239 aa  171  7.999999999999999e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.484439 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2764  arginyl-tRNA-protein transferase  37.66 
 
 
253 aa  171  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0812306  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2168  arginyl-tRNA-protein transferase  40.16 
 
 
281 aa  170  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0971053  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2649  arginyl-tRNA-protein transferase  39.83 
 
 
258 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.803585 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0342  arginyl-tRNA-protein transferase  39.15 
 
 
257 aa  167  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.287506  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2054  arginyl-tRNA-protein transferase  40.52 
 
 
237 aa  167  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000273717  normal  0.355745 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2121  arginyl-tRNA-protein transferase  39.57 
 
 
244 aa  167  1e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2986  arginyl-tRNA-protein transferase  38.59 
 
 
258 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.575869  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3623  arginyl-tRNA-protein transferase  41.15 
 
 
251 aa  166  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2883  arginyl-tRNA-protein transferase  41.28 
 
 
241 aa  166  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167037 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1111  arginyl-tRNA-protein transferase  37.24 
 
 
258 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0755  arginyl-tRNA-protein transferase  38.49 
 
 
249 aa  166  5e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.576435  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0750  arginyl-tRNA-protein transferase  38.49 
 
 
249 aa  166  5e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3351  arginyl-tRNA-protein transferase  40.25 
 
 
260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.470069  normal  0.662203 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1260  arginyl-tRNA-protein transferase  36.82 
 
 
258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.340737 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2225  arginyl-tRNA-protein transferase  38.6 
 
 
235 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000635584  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0931  arginyl-tRNA-protein transferase  35.71 
 
 
248 aa  163  3e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0193494  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1075  arginyl-tRNA-protein transferase  35.71 
 
 
248 aa  163  3e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.646097  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1204  arginyl-tRNA-protein transferase  37.14 
 
 
257 aa  162  6e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0810  arginyl-tRNA-protein transferase  36.48 
 
 
259 aa  162  7e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2621  arginyl-tRNA-protein transferase  37.76 
 
 
257 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2538  arginyl-tRNA-protein transferase  37.24 
 
 
249 aa  160  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>