144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2377 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2377  arginyl-tRNA-protein transferase  100 
 
 		 249 aa  521  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2325  arginyl-tRNA-protein transferase  81.71 
 
 		 254 aa  427  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.117095  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1724  arginyl-tRNA-protein transferase  81.22 
 
 		 253 aa  422  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.290117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1787  arginyl-tRNA-protein transferase  78.93 
 
 		 246 aa  408  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1987  arginyl-tRNA-protein transferase  78.93 
 
 		 246 aa  408  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1468  arginyl-tRNA-protein transferase  78.71 
 
 		 256 aa  408  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.874672  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3105  arginyl-tRNA-protein transferase  77.27 
 
 		 245 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.526442  normal  0.279686 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1979  arginyl-tRNA-protein transferase  76.45 
 
 		 247 aa  390  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0083576 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3623  arginyl-tRNA-protein transferase  75.41 
 
 		 251 aa  372  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4859  arginyl-tRNA-protein transferase  71.9 
 
 		 249 aa  372  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2348  arginyl-tRNA-protein transferase  70.95 
 
 		 253 aa  364  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1677  arginyl-tRNA-protein transferase  66.4 
 
 		 276 aa  338  5e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.278409 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4697  arginyl-tRNA-protein transferase  66.4 
 
 		 276 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.165949  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1616  arginyl-tRNA-protein transferase  66.4 
 
 		 257 aa  337  7e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1931  arginyl-tRNA-protein transferase  65.46 
 
 		 255 aa  336  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14051  normal  0.0172021 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1603  arginyl-tRNA-protein transferase  65.99 
 
 		 254 aa  336  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.117832  normal  0.3797 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2510  arginyl-tRNA-protein transferase  65.99 
 
 		 276 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0990136  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1456  arginyl-tRNA-protein transferase  65.99 
 
 		 276 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.691361  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1531  arginyl-tRNA-protein transferase  65.73 
 
 		 276 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1075  arginyl-tRNA-protein transferase  65.73 
 
 		 276 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1555  arginyl-tRNA-protein transferase  65.73 
 
 		 276 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1477  arginyl-tRNA-protein transferase  65.99 
 
 		 276 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.718047  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1252  arginyl-tRNA-protein transferase  65.18 
 
 		 276 aa  333  1e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1318  arginyl-tRNA-protein transferase  65.99 
 
 		 266 aa  333  1e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1979  arginyl-tRNA-protein transferase  65.18 
 
 		 276 aa  333  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1735  arginyl-tRNA-protein transferase  65.18 
 
 		 276 aa  333  1e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0393  arginyl-tRNA-protein transferase  65.18 
 
 		 276 aa  333  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.639576  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1810  arginyl-tRNA-protein transferase  65.18 
 
 		 276 aa  333  1e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.663288  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1826  arginyl-tRNA-protein transferase  65.18 
 
 		 276 aa  333  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0769  arginyl-tRNA-protein transferase  65.18 
 
 		 276 aa  333  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.107158  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1214  arginyl-tRNA-protein transferase  65.6 
 
 		 262 aa  332  4e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0519713 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1663  arginyl-tRNA-protein transferase  64.03 
 
 		 279 aa  329  2e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0145011 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1731  arginyl-tRNA-protein transferase  65.18 
 
 		 273 aa  329  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.226677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0742  arginyl-tRNA-protein transferase  62.3 
 
 		 248 aa  328  6e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1079  arginyl-tRNA-protein transferase  64.2 
 
 		 252 aa  325  4.0000000000000003e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.474847  normal  0.305047 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2506  arginyl-tRNA-protein transferase  62.89 
 
 		 279 aa  322  3e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.60461 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1195  arginyl-tRNA-protein transferase  60.5 
 
 		 247 aa  308  6.999999999999999e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2592  arginyl-tRNA-protein transferase  62.04 
 
 		 242 aa  301  6.000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.214767  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2708  arginyl-tRNA-protein transferase  59.26 
 
 		 251 aa  293  1e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2042  arginyl-tRNA-protein transferase  54.96 
 
 		 240 aa  268  5e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000226368  normal  0.32871 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0931  arginyl-tRNA-protein transferase  53.5 
 
 		 248 aa  265  5e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0193494  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1075  arginyl-tRNA-protein transferase  53.5 
 
 		 248 aa  265  5e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.646097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3588  arginyl-tRNA-protein transferase  46.15 
 
 		 235 aa  210  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28250  arginyl-tRNA-protein transferase  46.58 
 
 		 252 aa  209  3e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0648  arginyl-tRNA-protein transferase  48.28 
 
 		 238 aa  207  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2121  arginyl-tRNA-protein transferase  46.69 
 
 		 244 aa  207  1e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1755  arginyl-tRNA-protein transferase  42.44 
 
 		 237 aa  206  4e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2391  arginyl-tRNA-protein transferase  44.02 
 
 		 235 aa  202  5e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0694877 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3181  arginyl-tRNA-protein transferase  44.44 
 
 		 235 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.248167  normal  0.0460167 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3351  hypothetical protein  44.44 
 
 		 235 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.190221  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3611  arginyl-tRNA-protein transferase  44.02 
 
 		 235 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.85938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3410  arginyl-tRNA-protein transferase  44.44 
 
 		 235 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.317388 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2438  arginyl-tRNA-protein transferase  45.96 
 
 		 247 aa  198  6e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4006  arginyl-tRNA-protein transferase  43.59 
 
 		 235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315442 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1827  arginyl-tRNA-protein transferase  43.59 
 
 		 235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.856379  normal  0.0364428 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30260  arginyl-tRNA-protein transferase  44.07 
 
 		 235 aa  196  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2597  arginyl-tRNA-protein transferase  44.4 
 
 		 238 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00148691  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2589  arginyl-tRNA-protein transferase  44.07 
 
 		 235 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.205058  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1204  arginyl-tRNA-protein transferase  43.95 
 
 		 257 aa  195  6e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2986  arginyl-tRNA-protein transferase  41.7 
 
 		 258 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.575869  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4292  arginyl-tRNA-protein transferase  41.13 
 
 		 249 aa  193  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1109  arginyl-tRNA-protein transferase  42.8 
 
 		 251 aa  191  6e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2621  arginyl-tRNA-protein transferase  40.89 
 
 		 257 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1690  arginyl-tRNA-protein transferase  41.45 
 
 		 236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.672767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2649  arginyl-tRNA-protein transferase  40.89 
 
 		 258 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.803585 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2658  arginyl-tRNA-protein transferase  40.89 
 
 		 257 aa  188  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.458469  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4657  arginyl-tRNA-protein transferase  40.08 
 
 		 258 aa  187  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2242  arginyl-tRNA-protein transferase  40.65 
 
 		 257 aa  186  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.354347  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04859  arginyl-tRNA-protein transferase  42.61 
 
 		 251 aa  187  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.791729  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0755  arginyl-tRNA-protein transferase  41.43 
 
 		 249 aa  185  7e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.576435  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0750  arginyl-tRNA-protein transferase  41.43 
 
 		 249 aa  185  7e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0304  arginyl-tRNA-protein transferase  41.1 
 
 		 254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0181876  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1911  arginyl-tRNA-protein transferase  40.65 
 
 		 257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.582376  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4611  arginyl-tRNA-protein transferase  41.98 
 
 		 248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.209476  normal  0.240432 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4761  arginyl-tRNA-protein transferase  41.56 
 
 		 248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.767227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4241  arginyl-tRNA-protein transferase  41.98 
 
 		 248 aa  182  3e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0334  arginyl-tRNA-protein transferase  41.48 
 
 		 254 aa  182  4.0000000000000006e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0236431  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5634  arginyl-tRNA-protein transferase  40.4 
 
 		 251 aa  181  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.336417 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0237  arginyl-tRNA-protein transferase  40.6 
 
 		 262 aa  180  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2393  arginyl-tRNA-protein transferase  40.85 
 
 		 266 aa  180  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1101  arginyl-tRNA-protein transferase  38.66 
 
 		 284 aa  177  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0181  Arginyltransferase  39.92 
 
 		 246 aa  177  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2538  arginyl-tRNA-protein transferase  39.84 
 
 		 249 aa  176  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2883  arginyl-tRNA-protein transferase  42.55 
 
 		 241 aa  176  4e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167037 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0019  arginyl-tRNA-protein transferase  40 
 
 		 247 aa  176  5e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1175  arginyl-tRNA-protein transferase  40.65 
 
 		 280 aa  176  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3351  arginyl-tRNA-protein transferase  39.74 
 
 		 260 aa  174  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.470069  normal  0.662203 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0425  Arginyltransferase  39.48 
 
 		 236 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557109  hitchhiker  0.00000000502727 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0249  arginine-tRNA--protein transferase  39.48 
 
 		 236 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1111  arginyl-tRNA-protein transferase  37.24 
 
 		 258 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1082  arginyl-tRNA-protein transferase  40.08 
 
 		 285 aa  174  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.188934  normal  0.420596 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0810  arginyl-tRNA-protein transferase  37.66 
 
 		 259 aa  171  9e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1791  arginyl-tRNA-protein transferase  40.62 
 
 		 233 aa  171  1e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1127  arginyl-tRNA-protein transferase  37.3 
 
 		 249 aa  171  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2639  arginyl-tRNA-protein transferase  39.43 
 
 		 280 aa  170  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.286005  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0882  arginyl-tRNA-protein transferase  39.27 
 
 		 274 aa  170  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.883111  normal  0.212402 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1260  arginyl-tRNA-protein transferase  35.98 
 
 		 258 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.340737 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2168  arginyl-tRNA-protein transferase  38.37 
 
 		 281 aa  170  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0971053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0617  arginyl-tRNA-protein transferase  39.66 
 
 		 281 aa  170  2e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.224071 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6838  arginyl-tRNA-protein transferase  42.17 
 
 		 248 aa  169  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.143277  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>