146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3181 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3181  arginyl-tRNA-protein transferase  100 
 
 		 235 aa  489  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.248167  normal  0.0460167 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3351  hypothetical protein  97.02 
 
 		 235 aa  479  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.190221  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3588  arginyl-tRNA-protein transferase  88.89 
 
 		 235 aa  440  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3410  arginyl-tRNA-protein transferase  84.62 
 
 		 235 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.317388 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4006  arginyl-tRNA-protein transferase  84.19 
 
 		 235 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315442 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1827  arginyl-tRNA-protein transferase  83.76 
 
 		 235 aa  421  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.856379  normal  0.0364428 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3611  arginyl-tRNA-protein transferase  83.33 
 
 		 235 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.85938  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28250  arginyl-tRNA-protein transferase  81.62 
 
 		 252 aa  416  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2391  arginyl-tRNA-protein transferase  81.2 
 
 		 235 aa  412  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0694877 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2589  arginyl-tRNA-protein transferase  79.49 
 
 		 235 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.205058  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30260  arginyl-tRNA-protein transferase  79.49 
 
 		 235 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1755  arginyl-tRNA-protein transferase  52.81 
 
 		 237 aa  276  1e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2438  arginyl-tRNA-protein transferase  54.63 
 
 		 247 aa  265  2.9999999999999995e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1690  arginyl-tRNA-protein transferase  48.94 
 
 		 236 aa  258  8e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.672767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0019  arginyl-tRNA-protein transferase  49.34 
 
 		 247 aa  231  6e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0648  arginyl-tRNA-protein transferase  47.81 
 
 		 238 aa  228  8e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2597  arginyl-tRNA-protein transferase  46.38 
 
 		 238 aa  221  8e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00148691  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2348  arginyl-tRNA-protein transferase  48.72 
 
 		 253 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1195  arginyl-tRNA-protein transferase  43.42 
 
 		 247 aa  209  3e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1724  arginyl-tRNA-protein transferase  45.76 
 
 		 253 aa  207  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.290117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2325  arginyl-tRNA-protein transferase  45.96 
 
 		 254 aa  206  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.117095  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1791  arginyl-tRNA-protein transferase  45.62 
 
 		 233 aa  203  1e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2592  arginyl-tRNA-protein transferase  44.93 
 
 		 242 aa  204  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.214767  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1079  arginyl-tRNA-protein transferase  43.46 
 
 		 252 aa  204  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.474847  normal  0.305047 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0617  arginyl-tRNA-protein transferase  47.44 
 
 		 281 aa  204  1e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.224071 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1616  arginyl-tRNA-protein transferase  43.59 
 
 		 257 aa  202  4e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1252  arginyl-tRNA-protein transferase  42.74 
 
 		 276 aa  202  4e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1979  arginyl-tRNA-protein transferase  42.74 
 
 		 276 aa  202  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1735  arginyl-tRNA-protein transferase  42.74 
 
 		 276 aa  202  4e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0393  arginyl-tRNA-protein transferase  42.74 
 
 		 276 aa  202  4e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.639576  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1810  arginyl-tRNA-protein transferase  42.74 
 
 		 276 aa  202  4e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.663288  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1826  arginyl-tRNA-protein transferase  42.74 
 
 		 276 aa  202  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0769  arginyl-tRNA-protein transferase  42.74 
 
 		 276 aa  202  4e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.107158  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4697  arginyl-tRNA-protein transferase  42.74 
 
 		 276 aa  201  8e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.165949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1531  arginyl-tRNA-protein transferase  43.15 
 
 		 276 aa  201  9e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1075  arginyl-tRNA-protein transferase  43.15 
 
 		 276 aa  201  9e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1555  arginyl-tRNA-protein transferase  43.15 
 
 		 276 aa  201  9e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1477  arginyl-tRNA-protein transferase  42.74 
 
 		 276 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.718047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1714  arginyl-tRNA-protein transferase  46.52 
 
 		 239 aa  200  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484439 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1456  arginyl-tRNA-protein transferase  42.74 
 
 		 276 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.691361  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2377  arginyl-tRNA-protein transferase  44.44 
 
 		 249 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1109  arginyl-tRNA-protein transferase  44.59 
 
 		 251 aa  200  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2510  arginyl-tRNA-protein transferase  42.32 
 
 		 276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0990136  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2042  arginyl-tRNA-protein transferase  43.67 
 
 		 240 aa  198  5e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000226368  normal  0.32871 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2372  arginyl-tRNA-protein transferase  45.78 
 
 		 231 aa  198  7e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0011943  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0742  arginyl-tRNA-protein transferase  41.77 
 
 		 248 aa  198  7e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1731  arginyl-tRNA-protein transferase  42.15 
 
 		 273 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.226677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0304  arginyl-tRNA-protein transferase  44.16 
 
 		 254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0181876  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1677  arginyl-tRNA-protein transferase  41.91 
 
 		 276 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.278409 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1787  arginyl-tRNA-protein transferase  45.73 
 
 		 246 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1987  arginyl-tRNA-protein transferase  45.73 
 
 		 246 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13709  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1603  arginyl-tRNA-protein transferase  42.31 
 
 		 254 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.117832  normal  0.3797 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1931  arginyl-tRNA-protein transferase  42.31 
 
 		 255 aa  196  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14051  normal  0.0172021 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04859  arginyl-tRNA-protein transferase  44.02 
 
 		 251 aa  196  3e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.791729  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1979  arginyl-tRNA-protein transferase  44.44 
 
 		 247 aa  195  6e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0083576 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1663  arginyl-tRNA-protein transferase  41.06 
 
 		 279 aa  194  7e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0145011 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0334  arginyl-tRNA-protein transferase  43.72 
 
 		 254 aa  194  7e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0236431  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0181  Arginyltransferase  42.86 
 
 		 246 aa  192  3e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1468  arginyl-tRNA-protein transferase  44.87 
 
 		 256 aa  192  3e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.874672  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3623  arginyl-tRNA-protein transferase  47.68 
 
 		 251 aa  192  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2506  arginyl-tRNA-protein transferase  40.73 
 
 		 279 aa  192  5e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.60461 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1318  arginyl-tRNA-protein transferase  41.88 
 
 		 266 aa  190  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0931  arginyl-tRNA-protein transferase  40.61 
 
 		 248 aa  191  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0193494  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1075  arginyl-tRNA-protein transferase  40.61 
 
 		 248 aa  191  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.646097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1568  arginyl-tRNA-protein transferase  45.45 
 
 		 234 aa  189  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000198847  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1398  arginyl-tRNA-protein transferase  43.23 
 
 		 236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2054  arginyl-tRNA-protein transferase  44.8 
 
 		 237 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000273717  normal  0.355745 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4859  arginyl-tRNA-protein transferase  41.88 
 
 		 249 aa  187  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3105  arginyl-tRNA-protein transferase  42.74 
 
 		 245 aa  187  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.526442  normal  0.279686 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2697  arginyl-tRNA-protein transferase  44.14 
 
 		 236 aa  186  3e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000253337  normal  0.128903 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2708  arginyl-tRNA-protein transferase  41.67 
 
 		 251 aa  186  4e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1214  arginyl-tRNA-protein transferase  40.93 
 
 		 262 aa  184  8e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0519713 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2225  arginyl-tRNA-protein transferase  45.5 
 
 		 235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000635584  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1755  arginyl-tRNA-protein transferase  44.55 
 
 		 238 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000858101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2470  arginyl-tRNA-protein transferase  43.17 
 
 		 236 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000771659  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2624  arginyl-tRNA-protein transferase  44.34 
 
 		 238 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1650  arginyl-tRNA-protein transferase  44.09 
 
 		 238 aa  179  4e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1881  arginyl-tRNA-protein transferase  42.73 
 
 		 236 aa  179  4e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000197497  hitchhiker  0.000837728 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2463  arginyl-tRNA-protein transferase  42.73 
 
 		 236 aa  179  4e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000249099  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2530  arginyl-tRNA-protein transferase  39.64 
 
 		 241 aa  178  7e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000125656  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2583  arginyl-tRNA-protein transferase  42.73 
 
 		 236 aa  178  7e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000870424  normal  0.0975132 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1888  arginyl-tRNA-protein transferase  41.36 
 
 		 236 aa  177  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000499329  hitchhiker  0.000014618 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1836  arginyl-tRNA-protein transferase  40.91 
 
 		 233 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000137975  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1725  arginyl-tRNA-protein transferase  43.64 
 
 		 238 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000702749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3351  arginyl-tRNA-protein transferase  41.74 
 
 		 260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.470069  normal  0.662203 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01569  arginyl-tRNA-protein transferase  42.24 
 
 		 233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2252  arginyl-tRNA-protein transferase  41.7 
 
 		 239 aa  172  5e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000157492  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2764  arginyl-tRNA-protein transferase  38.89 
 
 		 253 aa  170  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0812306  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1337  arginyl-tRNA-protein transferase  38.96 
 
 		 233 aa  168  7e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0223511  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1296  arginyl-tRNA-protein transferase  39.57 
 
 		 280 aa  168  8e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2883  arginyl-tRNA-protein transferase  40 
 
 		 241 aa  168  8e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167037 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2639  arginyl-tRNA-protein transferase  39.57 
 
 		 280 aa  167  9e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.286005  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1175  arginyl-tRNA-protein transferase  39.57 
 
 		 280 aa  166  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2986  arginyl-tRNA-protein transferase  37.97 
 
 		 258 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.575869  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0249  arginine-tRNA--protein transferase  38.86 
 
 		 236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0425  Arginyltransferase  38.86 
 
 		 236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557109  hitchhiker  0.00000000502727 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2621  arginyl-tRNA-protein transferase  37.97 
 
 		 257 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01638  arginyl-tRNA-protein transferase  43.88 
 
 		 214 aa  163  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000119762  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2121  arginyl-tRNA-protein transferase  38.53 
 
 		 244 aa  161  8.000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003954  arginine-tRNA-protein transferase  38.53 
 
 		 233 aa  161  9e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000149764  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>