145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0237 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0237  arginyl-tRNA-protein transferase  100 
 
 		 262 aa  539  9.999999999999999e-153  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3351  arginyl-tRNA-protein transferase  63.79 
 
 		 260 aa  311  5.999999999999999e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.470069  normal  0.662203 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1845  arginyl-tRNA-protein transferase  56.96 
 
 		 246 aa  281  1e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1082  arginyl-tRNA-protein transferase  47.88 
 
 		 285 aa  242  3.9999999999999997e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.188934  normal  0.420596 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2121  arginyl-tRNA-protein transferase  53.16 
 
 		 244 aa  239  5e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2883  arginyl-tRNA-protein transferase  55.46 
 
 		 241 aa  238  8e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167037 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0882  arginyl-tRNA-protein transferase  48.41 
 
 		 274 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.883111  normal  0.212402 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0810  arginyl-tRNA-protein transferase  45.56 
 
 		 259 aa  231  8.000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2168  arginyl-tRNA-protein transferase  46.27 
 
 		 281 aa  227  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0971053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2621  arginyl-tRNA-protein transferase  47.2 
 
 		 257 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1601  arginyl-tRNA-protein transferase  49.15 
 
 		 253 aa  227  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1903  arginyl-tRNA-protein transferase  47.01 
 
 		 286 aa  225  4e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.72885 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4761  arginyl-tRNA-protein transferase  47.77 
 
 		 248 aa  226  4e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.767227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1175  arginyl-tRNA-protein transferase  49.14 
 
 		 280 aa  226  4e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4657  arginyl-tRNA-protein transferase  45.31 
 
 		 258 aa  224  8e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1101  arginyl-tRNA-protein transferase  50 
 
 		 284 aa  224  1e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2658  arginyl-tRNA-protein transferase  47.2 
 
 		 257 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.458469  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1204  arginyl-tRNA-protein transferase  48.61 
 
 		 257 aa  224  1e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2242  arginyl-tRNA-protein transferase  47.93 
 
 		 257 aa  223  2e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.354347  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4611  arginyl-tRNA-protein transferase  47.77 
 
 		 248 aa  223  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.209476  normal  0.240432 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1111  arginyl-tRNA-protein transferase  44.83 
 
 		 258 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4241  arginyl-tRNA-protein transferase  47.77 
 
 		 248 aa  223  3e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4292  arginyl-tRNA-protein transferase  48.77 
 
 		 249 aa  222  4e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1911  arginyl-tRNA-protein transferase  47.93 
 
 		 257 aa  222  4.9999999999999996e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.582376  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2393  arginyl-tRNA-protein transferase  50 
 
 		 266 aa  221  7e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2986  arginyl-tRNA-protein transferase  44.14 
 
 		 258 aa  221  8e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.575869  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0755  arginyl-tRNA-protein transferase  47.46 
 
 		 249 aa  219  1.9999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.576435  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1260  arginyl-tRNA-protein transferase  44.06 
 
 		 258 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.340737 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1127  arginyl-tRNA-protein transferase  46.06 
 
 		 249 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1296  arginyl-tRNA-protein transferase  48.28 
 
 		 280 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0750  arginyl-tRNA-protein transferase  47.46 
 
 		 249 aa  219  1.9999999999999999e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5634  arginyl-tRNA-protein transferase  49.18 
 
 		 251 aa  219  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.336417 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2639  arginyl-tRNA-protein transferase  48.28 
 
 		 280 aa  219  5e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.286005  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0342  arginyl-tRNA-protein transferase  47.33 
 
 		 257 aa  218  6e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.287506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2649  arginyl-tRNA-protein transferase  44.92 
 
 		 258 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.803585 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2538  arginyl-tRNA-protein transferase  46.61 
 
 		 249 aa  217  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3062  arginyl-tRNA-protein transferase  49.36 
 
 		 283 aa  216  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1559  arginyl-tRNA-protein transferase  45.11 
 
 		 254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0919298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6838  arginyl-tRNA-protein transferase  47.37 
 
 		 248 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.143277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2592  arginyl-tRNA-protein transferase  44.64 
 
 		 242 aa  194  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.214767  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1663  arginyl-tRNA-protein transferase  44.12 
 
 		 279 aa  194  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0145011 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1252  arginyl-tRNA-protein transferase  44.26 
 
 		 276 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1979  arginyl-tRNA-protein transferase  44.26 
 
 		 276 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1735  arginyl-tRNA-protein transferase  44.26 
 
 		 276 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0393  arginyl-tRNA-protein transferase  44.26 
 
 		 276 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.639576  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1810  arginyl-tRNA-protein transferase  44.26 
 
 		 276 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.663288  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1826  arginyl-tRNA-protein transferase  44.26 
 
 		 276 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0769  arginyl-tRNA-protein transferase  44.26 
 
 		 276 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.107158  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4697  arginyl-tRNA-protein transferase  45.06 
 
 		 276 aa  193  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.165949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2510  arginyl-tRNA-protein transferase  43.85 
 
 		 276 aa  193  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0990136  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1731  arginyl-tRNA-protein transferase  44.08 
 
 		 273 aa  193  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.226677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7576  arginyl-tRNA-protein transferase  47.37 
 
 		 248 aa  193  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1477  arginyl-tRNA-protein transferase  45.06 
 
 		 276 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.718047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1456  arginyl-tRNA-protein transferase  44.64 
 
 		 276 aa  192  6e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.691361  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1075  arginyl-tRNA-protein transferase  44.21 
 
 		 276 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1555  arginyl-tRNA-protein transferase  44.21 
 
 		 276 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1531  arginyl-tRNA-protein transferase  44.21 
 
 		 276 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2506  arginyl-tRNA-protein transferase  42.92 
 
 		 279 aa  189  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.60461 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0648  arginyl-tRNA-protein transferase  45.81 
 
 		 238 aa  189  4e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1677  arginyl-tRNA-protein transferase  43.44 
 
 		 276 aa  189  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.278409 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2325  arginyl-tRNA-protein transferase  41.3 
 
 		 254 aa  185  7e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.117095  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1468  arginyl-tRNA-protein transferase  44.4 
 
 		 256 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.874672  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1195  arginyl-tRNA-protein transferase  41.85 
 
 		 247 aa  183  3e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1214  arginyl-tRNA-protein transferase  41.56 
 
 		 262 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0519713 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2377  arginyl-tRNA-protein transferase  40.6 
 
 		 249 aa  180  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1318  arginyl-tRNA-protein transferase  41.25 
 
 		 266 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1987  arginyl-tRNA-protein transferase  43.23 
 
 		 246 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1787  arginyl-tRNA-protein transferase  43.23 
 
 		 246 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2597  arginyl-tRNA-protein transferase  41.3 
 
 		 238 aa  179  4e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00148691  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1979  arginyl-tRNA-protein transferase  42.79 
 
 		 247 aa  176  5e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0083576 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1931  arginyl-tRNA-protein transferase  40.08 
 
 		 255 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14051  normal  0.0172021 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0742  arginyl-tRNA-protein transferase  38.66 
 
 		 248 aa  174  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1603  arginyl-tRNA-protein transferase  39.66 
 
 		 254 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.117832  normal  0.3797 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1724  arginyl-tRNA-protein transferase  37.45 
 
 		 253 aa  172  5e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.290117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4859  arginyl-tRNA-protein transferase  40.09 
 
 		 249 aa  172  5.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2042  arginyl-tRNA-protein transferase  40.09 
 
 		 240 aa  171  1e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000226368  normal  0.32871 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1616  arginyl-tRNA-protein transferase  39.92 
 
 		 257 aa  170  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0249  arginine-tRNA--protein transferase  40.95 
 
 		 236 aa  168  8e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2348  arginyl-tRNA-protein transferase  37.99 
 
 		 253 aa  168  8e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0425  Arginyltransferase  40.95 
 
 		 236 aa  168  8e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557109  hitchhiker  0.00000000502727 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2708  arginyl-tRNA-protein transferase  39.22 
 
 		 251 aa  167  2e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1714  arginyl-tRNA-protein transferase  43.05 
 
 		 239 aa  165  9e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484439 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3105  arginyl-tRNA-protein transferase  39.74 
 
 		 245 aa  165  9e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.526442  normal  0.279686 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1755  arginyl-tRNA-protein transferase  36.68 
 
 		 237 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1079  arginyl-tRNA-protein transferase  37.45 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.474847  normal  0.305047 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0617  arginyl-tRNA-protein transferase  40.51 
 
 		 281 aa  163  3e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.224071 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1690  arginyl-tRNA-protein transferase  33.93 
 
 		 236 aa  157  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.672767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3623  arginyl-tRNA-protein transferase  40.95 
 
 		 251 aa  156  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3588  arginyl-tRNA-protein transferase  37.83 
 
 		 235 aa  154  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28250  arginyl-tRNA-protein transferase  39.3 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2391  arginyl-tRNA-protein transferase  39.3 
 
 		 235 aa  153  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0694877 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2438  arginyl-tRNA-protein transferase  38.05 
 
 		 247 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3410  arginyl-tRNA-protein transferase  37.99 
 
 		 235 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.317388 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4006  arginyl-tRNA-protein transferase  37.55 
 
 		 235 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315442 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3611  arginyl-tRNA-protein transferase  37.55 
 
 		 235 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.85938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30260  arginyl-tRNA-protein transferase  38.43 
 
 		 235 aa  152  7e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1827  arginyl-tRNA-protein transferase  37.55 
 
 		 235 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.856379  normal  0.0364428 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0181  Arginyltransferase  37.5 
 
 		 246 aa  151  1e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3351  hypothetical protein  37.72 
 
 		 235 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.190221  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2589  arginyl-tRNA-protein transferase  38.43 
 
 		 235 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.205058  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>