142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1559 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1559  arginyl-tRNA-protein transferase  100 
 
 
254 aa  529  1e-149  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0919298  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3062  arginyl-tRNA-protein transferase  52.92 
 
 
283 aa  263  2e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2883  arginyl-tRNA-protein transferase  51.26 
 
 
241 aa  243  3e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167037 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2242  arginyl-tRNA-protein transferase  52.16 
 
 
257 aa  241  6e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.354347  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1911  arginyl-tRNA-protein transferase  50.86 
 
 
257 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.582376  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2649  arginyl-tRNA-protein transferase  51.07 
 
 
258 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.803585 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2121  arginyl-tRNA-protein transferase  50.65 
 
 
244 aa  237  1e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4292  arginyl-tRNA-protein transferase  50.41 
 
 
249 aa  237  1e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1601  arginyl-tRNA-protein transferase  51.29 
 
 
253 aa  236  3e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4657  arginyl-tRNA-protein transferase  50.64 
 
 
258 aa  235  6e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2658  arginyl-tRNA-protein transferase  50.64 
 
 
257 aa  234  7e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.458469  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2986  arginyl-tRNA-protein transferase  50.64 
 
 
258 aa  234  7e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.575869  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1111  arginyl-tRNA-protein transferase  49.79 
 
 
258 aa  235  7e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1260  arginyl-tRNA-protein transferase  49.79 
 
 
258 aa  234  8e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.340737 
 
 
-
 
NC_004310  BR0755  arginyl-tRNA-protein transferase  49.39 
 
 
249 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.576435  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0750  arginyl-tRNA-protein transferase  49.39 
 
 
249 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1204  arginyl-tRNA-protein transferase  48.39 
 
 
257 aa  232  4.0000000000000004e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2621  arginyl-tRNA-protein transferase  50.21 
 
 
257 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1127  arginyl-tRNA-protein transferase  47.15 
 
 
249 aa  231  1e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2538  arginyl-tRNA-protein transferase  48.58 
 
 
249 aa  231  1e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4611  arginyl-tRNA-protein transferase  48.36 
 
 
248 aa  229  4e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.209476  normal  0.240432 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4241  arginyl-tRNA-protein transferase  48.36 
 
 
248 aa  229  4e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0810  arginyl-tRNA-protein transferase  49.79 
 
 
259 aa  228  8e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4761  arginyl-tRNA-protein transferase  48.36 
 
 
248 aa  228  9e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.767227  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2168  arginyl-tRNA-protein transferase  49.59 
 
 
281 aa  224  9e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0971053  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5634  arginyl-tRNA-protein transferase  47.95 
 
 
251 aa  223  3e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.336417 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1101  arginyl-tRNA-protein transferase  49.78 
 
 
284 aa  219  3e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2639  arginyl-tRNA-protein transferase  46.61 
 
 
280 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.286005  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0882  arginyl-tRNA-protein transferase  49.34 
 
 
274 aa  217  1e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.883111  normal  0.212402 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1296  arginyl-tRNA-protein transferase  46.61 
 
 
280 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1082  arginyl-tRNA-protein transferase  43.35 
 
 
285 aa  214  9e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.188934  normal  0.420596 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1903  arginyl-tRNA-protein transferase  47.9 
 
 
286 aa  214  9.999999999999999e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.72885 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1175  arginyl-tRNA-protein transferase  45.42 
 
 
280 aa  210  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2393  arginyl-tRNA-protein transferase  47.62 
 
 
266 aa  209  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0342  arginyl-tRNA-protein transferase  46.69 
 
 
257 aa  202  3e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.287506  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6838  arginyl-tRNA-protein transferase  47.95 
 
 
248 aa  202  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.143277  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7576  arginyl-tRNA-protein transferase  47.95 
 
 
248 aa  201  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0237  arginyl-tRNA-protein transferase  45.11 
 
 
262 aa  197  9e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3351  arginyl-tRNA-protein transferase  42.04 
 
 
260 aa  194  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.470069  normal  0.662203 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1845  arginyl-tRNA-protein transferase  44 
 
 
246 aa  187  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2438  arginyl-tRNA-protein transferase  42.67 
 
 
247 aa  171  6.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1690  arginyl-tRNA-protein transferase  35.53 
 
 
236 aa  169  3e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.672767  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2597  arginyl-tRNA-protein transferase  38.39 
 
 
238 aa  166  4e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00148691  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0617  arginyl-tRNA-protein transferase  37.72 
 
 
281 aa  161  8.000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.224071 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0648  arginyl-tRNA-protein transferase  39.29 
 
 
238 aa  160  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2042  arginyl-tRNA-protein transferase  40.6 
 
 
240 aa  159  4e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000226368  normal  0.32871 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28250  arginyl-tRNA-protein transferase  38.77 
 
 
252 aa  158  7e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4697  arginyl-tRNA-protein transferase  36.84 
 
 
276 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.165949  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2589  arginyl-tRNA-protein transferase  37.89 
 
 
235 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.205058  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3588  arginyl-tRNA-protein transferase  37.44 
 
 
235 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30260  arginyl-tRNA-protein transferase  37.89 
 
 
235 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2470  arginyl-tRNA-protein transferase  41.55 
 
 
236 aa  156  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000771659  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2583  arginyl-tRNA-protein transferase  41.28 
 
 
236 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000870424  normal  0.0975132 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1477  arginyl-tRNA-protein transferase  36.84 
 
 
276 aa  156  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.718047  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1456  arginyl-tRNA-protein transferase  36.84 
 
 
276 aa  156  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.691361  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1881  arginyl-tRNA-protein transferase  41.28 
 
 
236 aa  156  3e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000197497  hitchhiker  0.000837728 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2463  arginyl-tRNA-protein transferase  41.28 
 
 
236 aa  156  3e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000249099  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1252  arginyl-tRNA-protein transferase  36.84 
 
 
276 aa  155  6e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1979  arginyl-tRNA-protein transferase  36.84 
 
 
276 aa  155  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1735  arginyl-tRNA-protein transferase  36.84 
 
 
276 aa  155  6e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0393  arginyl-tRNA-protein transferase  36.84 
 
 
276 aa  155  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.639576  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1810  arginyl-tRNA-protein transferase  36.84 
 
 
276 aa  155  6e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.663288  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1826  arginyl-tRNA-protein transferase  36.84 
 
 
276 aa  155  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0769  arginyl-tRNA-protein transferase  36.84 
 
 
276 aa  155  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.107158  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1677  arginyl-tRNA-protein transferase  36.44 
 
 
276 aa  155  6e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.278409 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2391  arginyl-tRNA-protein transferase  37.89 
 
 
235 aa  154  9e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0694877 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3351  hypothetical protein  37.44 
 
 
235 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.190221  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2510  arginyl-tRNA-protein transferase  36.44 
 
 
276 aa  154  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0990136  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1075  arginyl-tRNA-protein transferase  36.44 
 
 
276 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1555  arginyl-tRNA-protein transferase  36.44 
 
 
276 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1531  arginyl-tRNA-protein transferase  36.44 
 
 
276 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1755  arginyl-tRNA-protein transferase  36.68 
 
 
237 aa  152  4e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1888  arginyl-tRNA-protein transferase  36.44 
 
 
236 aa  152  4e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000499329  hitchhiker  0.000014618 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3181  arginyl-tRNA-protein transferase  37 
 
 
235 aa  151  8e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.248167  normal  0.0460167 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1731  arginyl-tRNA-protein transferase  35.89 
 
 
273 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.226677  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1650  arginyl-tRNA-protein transferase  39.91 
 
 
238 aa  150  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736484  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1725  arginyl-tRNA-protein transferase  39.91 
 
 
238 aa  149  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000702749  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2325  arginyl-tRNA-protein transferase  34.82 
 
 
254 aa  149  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.117095  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1616  arginyl-tRNA-protein transferase  36.21 
 
 
257 aa  149  5e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1724  arginyl-tRNA-protein transferase  36.33 
 
 
253 aa  148  7e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.290117  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4859  arginyl-tRNA-protein transferase  36.48 
 
 
249 aa  148  7e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2506  arginyl-tRNA-protein transferase  34.19 
 
 
279 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.60461 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1755  arginyl-tRNA-protein transferase  39.45 
 
 
238 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000858101  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1603  arginyl-tRNA-protein transferase  34.87 
 
 
254 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.117832  normal  0.3797 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4006  arginyl-tRNA-protein transferase  36.12 
 
 
235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315442 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1318  arginyl-tRNA-protein transferase  37.07 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1931  arginyl-tRNA-protein transferase  35.34 
 
 
255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14051  normal  0.0172021 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2530  arginyl-tRNA-protein transferase  36.61 
 
 
241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000125656  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3611  arginyl-tRNA-protein transferase  36.68 
 
 
235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.85938  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3410  arginyl-tRNA-protein transferase  36.56 
 
 
235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.317388 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2252  arginyl-tRNA-protein transferase  35.15 
 
 
239 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000157492  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1663  arginyl-tRNA-protein transferase  34.92 
 
 
279 aa  145  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0145011 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1827  arginyl-tRNA-protein transferase  35.68 
 
 
235 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.856379  normal  0.0364428 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2624  arginyl-tRNA-protein transferase  39.45 
 
 
238 aa  145  6e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1836  arginyl-tRNA-protein transferase  35.75 
 
 
233 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000137975  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0019  arginyl-tRNA-protein transferase  37.56 
 
 
247 aa  144  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2592  arginyl-tRNA-protein transferase  36.17 
 
 
242 aa  143  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.214767  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1109  arginyl-tRNA-protein transferase  37.1 
 
 
251 aa  143  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157369  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2348  arginyl-tRNA-protein transferase  32.76 
 
 
253 aa  143  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1195  arginyl-tRNA-protein transferase  36.05 
 
 
247 aa  142  5e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>