143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0810 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0810  arginyl-tRNA-protein transferase  100 
 
 		 259 aa  545  1e-154  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1260  arginyl-tRNA-protein transferase  76.52 
 
 		 258 aa  417  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.340737 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1111  arginyl-tRNA-protein transferase  76.52 
 
 		 258 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1601  arginyl-tRNA-protein transferase  72.58 
 
 		 253 aa  388  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1127  arginyl-tRNA-protein transferase  71.14 
 
 		 249 aa  373  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2538  arginyl-tRNA-protein transferase  70.04 
 
 		 249 aa  367  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0755  arginyl-tRNA-protein transferase  69.64 
 
 		 249 aa  366  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.576435  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0750  arginyl-tRNA-protein transferase  69.64 
 
 		 249 aa  366  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4657  arginyl-tRNA-protein transferase  65.04 
 
 		 258 aa  350  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2242  arginyl-tRNA-protein transferase  62.55 
 
 		 257 aa  345  3e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.354347  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1911  arginyl-tRNA-protein transferase  62.16 
 
 		 257 aa  342  2.9999999999999997e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.582376  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4292  arginyl-tRNA-protein transferase  63.41 
 
 		 249 aa  338  4e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5634  arginyl-tRNA-protein transferase  66.11 
 
 		 251 aa  338  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.336417 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2986  arginyl-tRNA-protein transferase  63.01 
 
 		 258 aa  335  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.575869  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4611  arginyl-tRNA-protein transferase  63.41 
 
 		 248 aa  335  5e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.209476  normal  0.240432 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4241  arginyl-tRNA-protein transferase  63.41 
 
 		 248 aa  335  5.999999999999999e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2621  arginyl-tRNA-protein transferase  60.55 
 
 		 257 aa  334  7.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4761  arginyl-tRNA-protein transferase  63.01 
 
 		 248 aa  333  1e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.767227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2658  arginyl-tRNA-protein transferase  60.16 
 
 		 257 aa  333  2e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.458469  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2649  arginyl-tRNA-protein transferase  60.87 
 
 		 258 aa  330  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.803585 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1204  arginyl-tRNA-protein transferase  62.45 
 
 		 257 aa  328  6e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7576  arginyl-tRNA-protein transferase  65.04 
 
 		 248 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6838  arginyl-tRNA-protein transferase  64.63 
 
 		 248 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.143277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2121  arginyl-tRNA-protein transferase  60.24 
 
 		 244 aa  315  5e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2883  arginyl-tRNA-protein transferase  57.2 
 
 		 241 aa  289  3e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167037 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3062  arginyl-tRNA-protein transferase  53.12 
 
 		 283 aa  263  1e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2639  arginyl-tRNA-protein transferase  52.1 
 
 		 280 aa  259  3e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.286005  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1296  arginyl-tRNA-protein transferase  52.1 
 
 		 280 aa  259  3e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1175  arginyl-tRNA-protein transferase  52.1 
 
 		 280 aa  259  3e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0342  arginyl-tRNA-protein transferase  52.92 
 
 		 257 aa  256  2e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.287506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1082  arginyl-tRNA-protein transferase  51.77 
 
 		 285 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.188934  normal  0.420596 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1903  arginyl-tRNA-protein transferase  52.1 
 
 		 286 aa  253  2.0000000000000002e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.72885 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1101  arginyl-tRNA-protein transferase  50.81 
 
 		 284 aa  252  4.0000000000000004e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2168  arginyl-tRNA-protein transferase  51.45 
 
 		 281 aa  251  1e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0971053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0882  arginyl-tRNA-protein transferase  51.05 
 
 		 274 aa  250  2e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.883111  normal  0.212402 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2393  arginyl-tRNA-protein transferase  51.25 
 
 		 266 aa  249  3e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0237  arginyl-tRNA-protein transferase  45.56 
 
 		 262 aa  231  8.000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1559  arginyl-tRNA-protein transferase  49.79 
 
 		 254 aa  228  9e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0919298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3351  arginyl-tRNA-protein transferase  45.49 
 
 		 260 aa  218  8.999999999999998e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.470069  normal  0.662203 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1845  arginyl-tRNA-protein transferase  45.11 
 
 		 246 aa  207  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2597  arginyl-tRNA-protein transferase  42.31 
 
 		 238 aa  182  3e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00148691  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2438  arginyl-tRNA-protein transferase  41 
 
 		 247 aa  180  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0648  arginyl-tRNA-protein transferase  40.85 
 
 		 238 aa  178  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2592  arginyl-tRNA-protein transferase  39.34 
 
 		 242 aa  177  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.214767  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2042  arginyl-tRNA-protein transferase  38.49 
 
 		 240 aa  172  5e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000226368  normal  0.32871 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1731  arginyl-tRNA-protein transferase  37.92 
 
 		 273 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.226677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2377  arginyl-tRNA-protein transferase  37.66 
 
 		 249 aa  171  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1318  arginyl-tRNA-protein transferase  37.75 
 
 		 266 aa  170  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2348  arginyl-tRNA-protein transferase  39.5 
 
 		 253 aa  169  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0742  arginyl-tRNA-protein transferase  37.66 
 
 		 248 aa  168  9e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1214  arginyl-tRNA-protein transferase  37.45 
 
 		 262 aa  167  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0519713 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1075  arginyl-tRNA-protein transferase  37.05 
 
 		 276 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1555  arginyl-tRNA-protein transferase  37.05 
 
 		 276 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1663  arginyl-tRNA-protein transferase  37.5 
 
 		 279 aa  167  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0145011 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1531  arginyl-tRNA-protein transferase  37.05 
 
 		 276 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4859  arginyl-tRNA-protein transferase  38.59 
 
 		 249 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2510  arginyl-tRNA-protein transferase  38.49 
 
 		 276 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0990136  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2506  arginyl-tRNA-protein transferase  36.51 
 
 		 279 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.60461 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1677  arginyl-tRNA-protein transferase  37.66 
 
 		 276 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.278409 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4697  arginyl-tRNA-protein transferase  37.66 
 
 		 276 aa  165  8e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.165949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0181  Arginyltransferase  39.76 
 
 		 246 aa  165  8e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1755  arginyl-tRNA-protein transferase  39.09 
 
 		 237 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1456  arginyl-tRNA-protein transferase  36.25 
 
 		 276 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.691361  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1477  arginyl-tRNA-protein transferase  36.25 
 
 		 276 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.718047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1109  arginyl-tRNA-protein transferase  36.48 
 
 		 251 aa  162  7e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1979  arginyl-tRNA-protein transferase  37.08 
 
 		 247 aa  160  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0083576 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0425  Arginyltransferase  40.34 
 
 		 236 aa  160  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557109  hitchhiker  0.00000000502727 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0249  arginine-tRNA--protein transferase  40.34 
 
 		 236 aa  160  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1252  arginyl-tRNA-protein transferase  37.66 
 
 		 276 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1195  arginyl-tRNA-protein transferase  37.45 
 
 		 247 aa  160  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1979  arginyl-tRNA-protein transferase  37.66 
 
 		 276 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1735  arginyl-tRNA-protein transferase  37.66 
 
 		 276 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0393  arginyl-tRNA-protein transferase  37.66 
 
 		 276 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.639576  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1810  arginyl-tRNA-protein transferase  37.66 
 
 		 276 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.663288  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1826  arginyl-tRNA-protein transferase  37.66 
 
 		 276 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0769  arginyl-tRNA-protein transferase  37.66 
 
 		 276 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.107158  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0019  arginyl-tRNA-protein transferase  38.33 
 
 		 247 aa  159  6e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0617  arginyl-tRNA-protein transferase  36.67 
 
 		 281 aa  158  8e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.224071 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1616  arginyl-tRNA-protein transferase  35.71 
 
 		 257 aa  158  9e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1079  arginyl-tRNA-protein transferase  36.67 
 
 		 252 aa  157  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.474847  normal  0.305047 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1603  arginyl-tRNA-protein transferase  35.68 
 
 		 254 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.117832  normal  0.3797 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1931  arginyl-tRNA-protein transferase  35.68 
 
 		 255 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14051  normal  0.0172021 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2708  arginyl-tRNA-protein transferase  35.89 
 
 		 251 aa  157  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30260  arginyl-tRNA-protein transferase  37.02 
 
 		 235 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2589  arginyl-tRNA-protein transferase  37.02 
 
 		 235 aa  155  6e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.205058  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3105  arginyl-tRNA-protein transferase  36.67 
 
 		 245 aa  154  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.526442  normal  0.279686 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1724  arginyl-tRNA-protein transferase  35.29 
 
 		 253 aa  154  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.290117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1787  arginyl-tRNA-protein transferase  34.94 
 
 		 246 aa  153  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1987  arginyl-tRNA-protein transferase  34.94 
 
 		 246 aa  153  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2391  arginyl-tRNA-protein transferase  37.13 
 
 		 235 aa  152  5e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0694877 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28250  arginyl-tRNA-protein transferase  38.49 
 
 		 252 aa  152  7e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0334  arginyl-tRNA-protein transferase  35.22 
 
 		 254 aa  151  8e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0236431  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3588  arginyl-tRNA-protein transferase  34.89 
 
 		 235 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04859  arginyl-tRNA-protein transferase  35.63 
 
 		 251 aa  151  8.999999999999999e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.791729  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1791  arginyl-tRNA-protein transferase  37.93 
 
 		 233 aa  150  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1690  arginyl-tRNA-protein transferase  34.47 
 
 		 236 aa  150  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.672767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1468  arginyl-tRNA-protein transferase  35.68 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.874672  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0304  arginyl-tRNA-protein transferase  35.22 
 
 		 254 aa  150  2e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0181876  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3410  arginyl-tRNA-protein transferase  36.44 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.317388 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3611  arginyl-tRNA-protein transferase  36.44 
 
 		 235 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.85938  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>