144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1903 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1903  arginyl-tRNA-protein transferase  100 
 
 
286 aa  595  1e-169  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.72885 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1296  arginyl-tRNA-protein transferase  71.79 
 
 
280 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2639  arginyl-tRNA-protein transferase  71.06 
 
 
280 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.286005  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1175  arginyl-tRNA-protein transferase  71.79 
 
 
280 aa  413  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1082  arginyl-tRNA-protein transferase  68.48 
 
 
285 aa  407  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.188934  normal  0.420596 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0882  arginyl-tRNA-protein transferase  70.04 
 
 
274 aa  404  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.883111  normal  0.212402 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2168  arginyl-tRNA-protein transferase  70 
 
 
281 aa  403  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0971053  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2883  arginyl-tRNA-protein transferase  56.33 
 
 
241 aa  263  3e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167037 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4657  arginyl-tRNA-protein transferase  52.08 
 
 
258 aa  258  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2649  arginyl-tRNA-protein transferase  51.6 
 
 
258 aa  256  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.803585 
 
 
-
 
NC_004310  BR0755  arginyl-tRNA-protein transferase  52.24 
 
 
249 aa  256  4e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.576435  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0750  arginyl-tRNA-protein transferase  52.24 
 
 
249 aa  256  4e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4292  arginyl-tRNA-protein transferase  52.08 
 
 
249 aa  256  4e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2242  arginyl-tRNA-protein transferase  54.71 
 
 
257 aa  255  6e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.354347  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0342  arginyl-tRNA-protein transferase  55.56 
 
 
257 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.287506  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1601  arginyl-tRNA-protein transferase  52.77 
 
 
253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0810  arginyl-tRNA-protein transferase  52.1 
 
 
259 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2538  arginyl-tRNA-protein transferase  51.84 
 
 
249 aa  253  3e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2986  arginyl-tRNA-protein transferase  53.12 
 
 
258 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.575869  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2658  arginyl-tRNA-protein transferase  49.59 
 
 
257 aa  250  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.458469  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2121  arginyl-tRNA-protein transferase  52.12 
 
 
244 aa  251  1e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2621  arginyl-tRNA-protein transferase  50.84 
 
 
257 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1204  arginyl-tRNA-protein transferase  52.52 
 
 
257 aa  249  3e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1911  arginyl-tRNA-protein transferase  54.26 
 
 
257 aa  249  5e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.582376  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1260  arginyl-tRNA-protein transferase  48.21 
 
 
258 aa  247  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.340737 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4761  arginyl-tRNA-protein transferase  53.36 
 
 
248 aa  247  2e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.767227  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1101  arginyl-tRNA-protein transferase  51.63 
 
 
284 aa  246  3e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1127  arginyl-tRNA-protein transferase  50 
 
 
249 aa  246  4e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1111  arginyl-tRNA-protein transferase  47.81 
 
 
258 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4611  arginyl-tRNA-protein transferase  52.94 
 
 
248 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.209476  normal  0.240432 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4241  arginyl-tRNA-protein transferase  52.94 
 
 
248 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2393  arginyl-tRNA-protein transferase  51.26 
 
 
266 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3062  arginyl-tRNA-protein transferase  53.48 
 
 
283 aa  242  6e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5634  arginyl-tRNA-protein transferase  49.17 
 
 
251 aa  230  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.336417 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7576  arginyl-tRNA-protein transferase  52.3 
 
 
248 aa  228  7e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6838  arginyl-tRNA-protein transferase  51.44 
 
 
248 aa  228  7e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.143277  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0237  arginyl-tRNA-protein transferase  47.01 
 
 
262 aa  225  5.0000000000000005e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3351  arginyl-tRNA-protein transferase  48.75 
 
 
260 aa  225  8e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.470069  normal  0.662203 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1559  arginyl-tRNA-protein transferase  49.34 
 
 
254 aa  213  2.9999999999999995e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0919298  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1845  arginyl-tRNA-protein transferase  44.05 
 
 
246 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1616  arginyl-tRNA-protein transferase  41.15 
 
 
257 aa  178  8e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1677  arginyl-tRNA-protein transferase  39.85 
 
 
276 aa  177  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.278409 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1075  arginyl-tRNA-protein transferase  38.75 
 
 
276 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1603  arginyl-tRNA-protein transferase  41.15 
 
 
254 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.117832  normal  0.3797 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1555  arginyl-tRNA-protein transferase  38.75 
 
 
276 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1531  arginyl-tRNA-protein transferase  38.75 
 
 
276 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4697  arginyl-tRNA-protein transferase  39.48 
 
 
276 aa  177  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.165949  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0648  arginyl-tRNA-protein transferase  41.99 
 
 
238 aa  176  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1931  arginyl-tRNA-protein transferase  41.08 
 
 
255 aa  176  5e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14051  normal  0.0172021 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2597  arginyl-tRNA-protein transferase  41.99 
 
 
238 aa  175  8e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00148691  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1456  arginyl-tRNA-protein transferase  40.65 
 
 
276 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.691361  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1477  arginyl-tRNA-protein transferase  40.65 
 
 
276 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.718047  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1252  arginyl-tRNA-protein transferase  40.65 
 
 
276 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1979  arginyl-tRNA-protein transferase  40.65 
 
 
276 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2510  arginyl-tRNA-protein transferase  39.11 
 
 
276 aa  171  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0990136  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1735  arginyl-tRNA-protein transferase  40.65 
 
 
276 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0393  arginyl-tRNA-protein transferase  40.65 
 
 
276 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.639576  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1810  arginyl-tRNA-protein transferase  40.65 
 
 
276 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.663288  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1826  arginyl-tRNA-protein transferase  40.65 
 
 
276 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0769  arginyl-tRNA-protein transferase  40.65 
 
 
276 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.107158  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2042  arginyl-tRNA-protein transferase  39.57 
 
 
240 aa  169  6e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000226368  normal  0.32871 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0617  arginyl-tRNA-protein transferase  36.51 
 
 
281 aa  169  6e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.224071 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1318  arginyl-tRNA-protein transferase  39.83 
 
 
266 aa  168  7e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2348  arginyl-tRNA-protein transferase  40.93 
 
 
253 aa  167  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3588  arginyl-tRNA-protein transferase  40.97 
 
 
235 aa  166  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1731  arginyl-tRNA-protein transferase  39.04 
 
 
273 aa  166  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.226677  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1214  arginyl-tRNA-protein transferase  38.25 
 
 
262 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0519713 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1979  arginyl-tRNA-protein transferase  40.34 
 
 
247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0083576 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2506  arginyl-tRNA-protein transferase  38.13 
 
 
279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.60461 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30260  arginyl-tRNA-protein transferase  40.53 
 
 
235 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1195  arginyl-tRNA-protein transferase  38.33 
 
 
247 aa  162  7e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2592  arginyl-tRNA-protein transferase  40.08 
 
 
242 aa  162  7e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.214767  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1724  arginyl-tRNA-protein transferase  36.71 
 
 
253 aa  160  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.290117  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1663  arginyl-tRNA-protein transferase  37.25 
 
 
279 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0145011 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2438  arginyl-tRNA-protein transferase  39.13 
 
 
247 aa  160  3e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0181  Arginyltransferase  40 
 
 
246 aa  160  3e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2589  arginyl-tRNA-protein transferase  40.09 
 
 
235 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.205058  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1690  arginyl-tRNA-protein transferase  35.68 
 
 
236 aa  159  4e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.672767  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1109  arginyl-tRNA-protein transferase  38.66 
 
 
251 aa  157  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157369  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2391  arginyl-tRNA-protein transferase  38.33 
 
 
235 aa  157  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0694877 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4859  arginyl-tRNA-protein transferase  38.91 
 
 
249 aa  156  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2377  arginyl-tRNA-protein transferase  36.63 
 
 
249 aa  155  6e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1787  arginyl-tRNA-protein transferase  38.1 
 
 
246 aa  154  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1987  arginyl-tRNA-protein transferase  38.1 
 
 
246 aa  154  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13709  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0019  arginyl-tRNA-protein transferase  39.21 
 
 
247 aa  154  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1755  arginyl-tRNA-protein transferase  35.65 
 
 
237 aa  153  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3181  arginyl-tRNA-protein transferase  37.89 
 
 
235 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.248167  normal  0.0460167 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2325  arginyl-tRNA-protein transferase  35.65 
 
 
254 aa  150  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.117095  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04859  arginyl-tRNA-protein transferase  37.77 
 
 
251 aa  150  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.791729  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28250  arginyl-tRNA-protein transferase  39.21 
 
 
252 aa  150  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0742  arginyl-tRNA-protein transferase  35.15 
 
 
248 aa  150  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2764  arginyl-tRNA-protein transferase  36.17 
 
 
253 aa  150  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0812306  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3351  hypothetical protein  37.44 
 
 
235 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.190221  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2708  arginyl-tRNA-protein transferase  35.12 
 
 
251 aa  150  3e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3611  arginyl-tRNA-protein transferase  37.72 
 
 
235 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.85938  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4006  arginyl-tRNA-protein transferase  37.07 
 
 
235 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315442 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0249  arginine-tRNA--protein transferase  37.99 
 
 
236 aa  149  5e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0425  Arginyltransferase  37.99 
 
 
236 aa  149  5e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557109  hitchhiker  0.00000000502727 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1468  arginyl-tRNA-protein transferase  38.66 
 
 
256 aa  149  5e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.874672  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1827  arginyl-tRNA-protein transferase  37.07 
 
 
235 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.856379  normal  0.0364428 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>