147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0019 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0019  arginyl-tRNA-protein transferase  100 
 
 		 247 aa  516  1e-146  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4006  arginyl-tRNA-protein transferase  52.81 
 
 		 235 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315442 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1827  arginyl-tRNA-protein transferase  52.81 
 
 		 235 aa  238  5e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.856379  normal  0.0364428 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3410  arginyl-tRNA-protein transferase  52.38 
 
 		 235 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.317388 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3611  arginyl-tRNA-protein transferase  52.38 
 
 		 235 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.85938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3588  arginyl-tRNA-protein transferase  50.88 
 
 		 235 aa  238  9e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28250  arginyl-tRNA-protein transferase  50.43 
 
 		 252 aa  238  9e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0648  arginyl-tRNA-protein transferase  49.14 
 
 		 238 aa  237  1e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30260  arginyl-tRNA-protein transferase  50 
 
 		 235 aa  236  3e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2589  arginyl-tRNA-protein transferase  50 
 
 		 235 aa  236  3e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.205058  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2391  arginyl-tRNA-protein transferase  49.57 
 
 		 235 aa  232  3e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0694877 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3351  hypothetical protein  49.34 
 
 		 235 aa  232  5e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.190221  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3181  arginyl-tRNA-protein transferase  49.34 
 
 		 235 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.248167  normal  0.0460167 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2597  arginyl-tRNA-protein transferase  49.13 
 
 		 238 aa  226  3e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00148691  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1109  arginyl-tRNA-protein transferase  50.85 
 
 		 251 aa  224  1e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1690  arginyl-tRNA-protein transferase  43.81 
 
 		 236 aa  216  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.672767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4697  arginyl-tRNA-protein transferase  47.72 
 
 		 276 aa  216  4e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.165949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1531  arginyl-tRNA-protein transferase  47.3 
 
 		 276 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1075  arginyl-tRNA-protein transferase  47.3 
 
 		 276 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1456  arginyl-tRNA-protein transferase  47.72 
 
 		 276 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.691361  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1555  arginyl-tRNA-protein transferase  47.3 
 
 		 276 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1477  arginyl-tRNA-protein transferase  47.72 
 
 		 276 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.718047  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1252  arginyl-tRNA-protein transferase  47.48 
 
 		 276 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1979  arginyl-tRNA-protein transferase  47.48 
 
 		 276 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1735  arginyl-tRNA-protein transferase  47.48 
 
 		 276 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0393  arginyl-tRNA-protein transferase  47.48 
 
 		 276 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.639576  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1810  arginyl-tRNA-protein transferase  47.48 
 
 		 276 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.663288  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1826  arginyl-tRNA-protein transferase  47.48 
 
 		 276 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0769  arginyl-tRNA-protein transferase  47.48 
 
 		 276 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.107158  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1677  arginyl-tRNA-protein transferase  46.89 
 
 		 276 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.278409 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1791  arginyl-tRNA-protein transferase  46.72 
 
 		 233 aa  210  1e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2510  arginyl-tRNA-protein transferase  47.7 
 
 		 276 aa  210  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0990136  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1755  arginyl-tRNA-protein transferase  44.54 
 
 		 237 aa  210  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1663  arginyl-tRNA-protein transferase  45.9 
 
 		 279 aa  209  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0145011 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2438  arginyl-tRNA-protein transferase  46.98 
 
 		 247 aa  208  7e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2592  arginyl-tRNA-protein transferase  45.73 
 
 		 242 aa  207  9e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.214767  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0742  arginyl-tRNA-protein transferase  41.6 
 
 		 248 aa  205  5e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04859  arginyl-tRNA-protein transferase  45.8 
 
 		 251 aa  203  2e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.791729  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2506  arginyl-tRNA-protein transferase  44.35 
 
 		 279 aa  203  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.60461 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1731  arginyl-tRNA-protein transferase  44.21 
 
 		 273 aa  201  8e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.226677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1079  arginyl-tRNA-protein transferase  42.51 
 
 		 252 aa  200  9.999999999999999e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.474847  normal  0.305047 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2042  arginyl-tRNA-protein transferase  44.35 
 
 		 240 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000226368  normal  0.32871 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0181  Arginyltransferase  42.98 
 
 		 246 aa  192  4e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1987  arginyl-tRNA-protein transferase  43.7 
 
 		 246 aa  191  8e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1787  arginyl-tRNA-protein transferase  43.7 
 
 		 246 aa  191  8e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1724  arginyl-tRNA-protein transferase  42.62 
 
 		 253 aa  191  9e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.290117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1714  arginyl-tRNA-protein transferase  45.76 
 
 		 239 aa  190  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484439 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2325  arginyl-tRNA-protein transferase  41.87 
 
 		 254 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.117095  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1318  arginyl-tRNA-protein transferase  42.67 
 
 		 266 aa  186  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0931  arginyl-tRNA-protein transferase  42.61 
 
 		 248 aa  186  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0193494  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1075  arginyl-tRNA-protein transferase  42.61 
 
 		 248 aa  186  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.646097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2708  arginyl-tRNA-protein transferase  40.17 
 
 		 251 aa  185  6e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1931  arginyl-tRNA-protein transferase  42.26 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14051  normal  0.0172021 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2348  arginyl-tRNA-protein transferase  41.77 
 
 		 253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1603  arginyl-tRNA-protein transferase  42.26 
 
 		 254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.117832  normal  0.3797 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1616  arginyl-tRNA-protein transferase  42.5 
 
 		 257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1468  arginyl-tRNA-protein transferase  43.97 
 
 		 256 aa  182  3e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.874672  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4859  arginyl-tRNA-protein transferase  42.86 
 
 		 249 aa  183  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1214  arginyl-tRNA-protein transferase  41.56 
 
 		 262 aa  180  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0519713 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0304  arginyl-tRNA-protein transferase  41.77 
 
 		 254 aa  179  2.9999999999999997e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0181876  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1195  arginyl-tRNA-protein transferase  40.35 
 
 		 247 aa  178  5.999999999999999e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1398  arginyl-tRNA-protein transferase  42.79 
 
 		 236 aa  176  3e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2372  arginyl-tRNA-protein transferase  39.01 
 
 		 231 aa  176  4e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0011943  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0334  arginyl-tRNA-protein transferase  41.35 
 
 		 254 aa  176  4e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0236431  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2377  arginyl-tRNA-protein transferase  40 
 
 		 249 aa  176  5e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0249  arginine-tRNA--protein transferase  39.38 
 
 		 236 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0425  Arginyltransferase  39.38 
 
 		 236 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557109  hitchhiker  0.00000000502727 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3105  arginyl-tRNA-protein transferase  40.87 
 
 		 245 aa  171  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.526442  normal  0.279686 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1979  arginyl-tRNA-protein transferase  40.77 
 
 		 247 aa  170  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0083576 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1175  arginyl-tRNA-protein transferase  40 
 
 		 280 aa  170  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2530  arginyl-tRNA-protein transferase  38.86 
 
 		 241 aa  169  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000125656  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0755  arginyl-tRNA-protein transferase  39.66 
 
 		 249 aa  168  6e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.576435  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0750  arginyl-tRNA-protein transferase  39.66 
 
 		 249 aa  168  6e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1296  arginyl-tRNA-protein transferase  39.13 
 
 		 280 aa  168  7e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2252  arginyl-tRNA-protein transferase  38.12 
 
 		 239 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000157492  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2054  arginyl-tRNA-protein transferase  39.29 
 
 		 237 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000273717  normal  0.355745 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2538  arginyl-tRNA-protein transferase  39.66 
 
 		 249 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1836  arginyl-tRNA-protein transferase  35.98 
 
 		 233 aa  166  5e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000137975  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2639  arginyl-tRNA-protein transferase  38.7 
 
 		 280 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.286005  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0617  arginyl-tRNA-protein transferase  38.91 
 
 		 281 aa  165  5.9999999999999996e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.224071 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1337  arginyl-tRNA-protein transferase  36.75 
 
 		 233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0223511  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1911  arginyl-tRNA-protein transferase  40.81 
 
 		 257 aa  163  3e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.582376  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2697  arginyl-tRNA-protein transferase  38.39 
 
 		 236 aa  163  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000253337  normal  0.128903 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1204  arginyl-tRNA-protein transferase  40.54 
 
 		 257 aa  162  4.0000000000000004e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3623  arginyl-tRNA-protein transferase  40 
 
 		 251 aa  162  5.0000000000000005e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1888  arginyl-tRNA-protein transferase  37.45 
 
 		 236 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000499329  hitchhiker  0.000014618 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1082  arginyl-tRNA-protein transferase  36.82 
 
 		 285 aa  162  6e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.188934  normal  0.420596 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2624  arginyl-tRNA-protein transferase  38.14 
 
 		 238 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1650  arginyl-tRNA-protein transferase  38.6 
 
 		 238 aa  161  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1101  arginyl-tRNA-protein transferase  37.66 
 
 		 284 aa  160  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2225  arginyl-tRNA-protein transferase  39.07 
 
 		 235 aa  160  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000635584  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1127  arginyl-tRNA-protein transferase  38.08 
 
 		 249 aa  159  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1755  arginyl-tRNA-protein transferase  38.6 
 
 		 238 aa  159  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000858101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4657  arginyl-tRNA-protein transferase  41.07 
 
 		 258 aa  160  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1111  arginyl-tRNA-protein transferase  37.08 
 
 		 258 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2242  arginyl-tRNA-protein transferase  40.81 
 
 		 257 aa  159  4e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.354347  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0810  arginyl-tRNA-protein transferase  38.33 
 
 		 259 aa  159  6e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2393  arginyl-tRNA-protein transferase  38.57 
 
 		 266 aa  158  7e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1568  arginyl-tRNA-protein transferase  39.66 
 
 		 234 aa  158  8e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000198847  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0342  arginyl-tRNA-protein transferase  38.91 
 
 		 257 aa  157  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.287506  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>