146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1616 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1616  arginyl-tRNA-protein transferase  100 
 
 		 257 aa  529  1e-149  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1603  arginyl-tRNA-protein transferase  94.47 
 
 		 254 aa  496  1e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.117832  normal  0.3797 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1931  arginyl-tRNA-protein transferase  94.8 
 
 		 255 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14051  normal  0.0172021 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1318  arginyl-tRNA-protein transferase  80.08 
 
 		 266 aa  429  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1214  arginyl-tRNA-protein transferase  79.69 
 
 		 262 aa  423  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0519713 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1663  arginyl-tRNA-protein transferase  69.02 
 
 		 279 aa  364  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0145011 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2510  arginyl-tRNA-protein transferase  68.73 
 
 		 276 aa  364  1e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0990136  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1677  arginyl-tRNA-protein transferase  67.44 
 
 		 276 aa  363  2e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.278409 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1252  arginyl-tRNA-protein transferase  68.09 
 
 		 276 aa  361  6e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1979  arginyl-tRNA-protein transferase  68.09 
 
 		 276 aa  361  6e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1735  arginyl-tRNA-protein transferase  68.09 
 
 		 276 aa  361  6e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0393  arginyl-tRNA-protein transferase  68.09 
 
 		 276 aa  361  6e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.639576  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1810  arginyl-tRNA-protein transferase  68.09 
 
 		 276 aa  361  6e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.663288  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1826  arginyl-tRNA-protein transferase  68.09 
 
 		 276 aa  361  6e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0769  arginyl-tRNA-protein transferase  68.09 
 
 		 276 aa  361  6e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.107158  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1075  arginyl-tRNA-protein transferase  67.05 
 
 		 276 aa  360  1e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1555  arginyl-tRNA-protein transferase  67.05 
 
 		 276 aa  360  1e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1531  arginyl-tRNA-protein transferase  67.05 
 
 		 276 aa  360  1e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1456  arginyl-tRNA-protein transferase  68.83 
 
 		 276 aa  358  5e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.691361  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4697  arginyl-tRNA-protein transferase  67.05 
 
 		 276 aa  358  7e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.165949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1477  arginyl-tRNA-protein transferase  68.83 
 
 		 276 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.718047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2506  arginyl-tRNA-protein transferase  67.6 
 
 		 279 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.60461 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1731  arginyl-tRNA-protein transferase  68.72 
 
 		 273 aa  351  5e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.226677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1787  arginyl-tRNA-protein transferase  70.08 
 
 		 246 aa  348  5e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1987  arginyl-tRNA-protein transferase  70.08 
 
 		 246 aa  348  5e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2325  arginyl-tRNA-protein transferase  68.6 
 
 		 254 aa  344  1e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.117095  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1468  arginyl-tRNA-protein transferase  69.14 
 
 		 256 aa  342  2e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.874672  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1079  arginyl-tRNA-protein transferase  63.67 
 
 		 252 aa  342  2.9999999999999997e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.474847  normal  0.305047 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1979  arginyl-tRNA-protein transferase  68.44 
 
 		 247 aa  342  5e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0083576 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2377  arginyl-tRNA-protein transferase  66.4 
 
 		 249 aa  337  7e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2348  arginyl-tRNA-protein transferase  64 
 
 		 253 aa  333  1e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4859  arginyl-tRNA-protein transferase  64.92 
 
 		 249 aa  333  1e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3105  arginyl-tRNA-protein transferase  66.39 
 
 		 245 aa  333  2e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.526442  normal  0.279686 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1724  arginyl-tRNA-protein transferase  66.53 
 
 		 253 aa  333  2e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.290117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0742  arginyl-tRNA-protein transferase  62.14 
 
 		 248 aa  332  3e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1195  arginyl-tRNA-protein transferase  65.25 
 
 		 247 aa  321  6e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3623  arginyl-tRNA-protein transferase  65.86 
 
 		 251 aa  320  1.9999999999999998e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2592  arginyl-tRNA-protein transferase  63.07 
 
 		 242 aa  311  7.999999999999999e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.214767  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2708  arginyl-tRNA-protein transferase  60.31 
 
 		 251 aa  307  1.0000000000000001e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2042  arginyl-tRNA-protein transferase  57.26 
 
 		 240 aa  282  5.000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000226368  normal  0.32871 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0931  arginyl-tRNA-protein transferase  52.67 
 
 		 248 aa  270  1e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0193494  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1075  arginyl-tRNA-protein transferase  52.67 
 
 		 248 aa  270  1e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.646097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3588  arginyl-tRNA-protein transferase  46.15 
 
 		 235 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2597  arginyl-tRNA-protein transferase  45.02 
 
 		 238 aa  210  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00148691  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2391  arginyl-tRNA-protein transferase  45.73 
 
 		 235 aa  210  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0694877 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3410  arginyl-tRNA-protein transferase  44.44 
 
 		 235 aa  206  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.317388 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28250  arginyl-tRNA-protein transferase  46.58 
 
 		 252 aa  207  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0648  arginyl-tRNA-protein transferase  48.07 
 
 		 238 aa  205  6e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4006  arginyl-tRNA-protein transferase  44.02 
 
 		 235 aa  205  7e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315442 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3611  arginyl-tRNA-protein transferase  43.59 
 
 		 235 aa  205  8e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.85938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1827  arginyl-tRNA-protein transferase  44.02 
 
 		 235 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.856379  normal  0.0364428 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3351  hypothetical protein  44.02 
 
 		 235 aa  203  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.190221  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30260  arginyl-tRNA-protein transferase  45.3 
 
 		 235 aa  203  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2589  arginyl-tRNA-protein transferase  45.3 
 
 		 235 aa  202  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.205058  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3181  arginyl-tRNA-protein transferase  43.59 
 
 		 235 aa  202  5e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.248167  normal  0.0460167 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1755  arginyl-tRNA-protein transferase  42.55 
 
 		 237 aa  200  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1690  arginyl-tRNA-protein transferase  41.77 
 
 		 236 aa  194  8.000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.672767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3351  arginyl-tRNA-protein transferase  42.79 
 
 		 260 aa  192  6e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.470069  normal  0.662203 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2438  arginyl-tRNA-protein transferase  44.92 
 
 		 247 aa  191  7e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2883  arginyl-tRNA-protein transferase  44.87 
 
 		 241 aa  189  5e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167037 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1109  arginyl-tRNA-protein transferase  40.68 
 
 		 251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0181  Arginyltransferase  40.33 
 
 		 246 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0019  arginyl-tRNA-protein transferase  42.5 
 
 		 247 aa  183  3e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1101  arginyl-tRNA-protein transferase  40.73 
 
 		 284 aa  180  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1082  arginyl-tRNA-protein transferase  41.06 
 
 		 285 aa  180  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.188934  normal  0.420596 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1903  arginyl-tRNA-protein transferase  41.15 
 
 		 286 aa  178  5.999999999999999e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.72885 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0304  arginyl-tRNA-protein transferase  39.18 
 
 		 254 aa  178  7e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0181876  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0334  arginyl-tRNA-protein transferase  39.18 
 
 		 254 aa  178  8e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0236431  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04859  arginyl-tRNA-protein transferase  41.56 
 
 		 251 aa  177  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.791729  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2168  arginyl-tRNA-protein transferase  41.06 
 
 		 281 aa  177  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0971053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0882  arginyl-tRNA-protein transferase  41.08 
 
 		 274 aa  176  5e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.883111  normal  0.212402 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4292  arginyl-tRNA-protein transferase  41.04 
 
 		 249 aa  176  5e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1175  arginyl-tRNA-protein transferase  40.93 
 
 		 280 aa  174  9e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4611  arginyl-tRNA-protein transferase  43.32 
 
 		 248 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.209476  normal  0.240432 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3062  arginyl-tRNA-protein transferase  41.91 
 
 		 283 aa  174  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1296  arginyl-tRNA-protein transferase  40.08 
 
 		 280 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2639  arginyl-tRNA-protein transferase  40.08 
 
 		 280 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.286005  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1204  arginyl-tRNA-protein transferase  41.15 
 
 		 257 aa  172  2.9999999999999996e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4241  arginyl-tRNA-protein transferase  43.32 
 
 		 248 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4761  arginyl-tRNA-protein transferase  42.91 
 
 		 248 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.767227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4657  arginyl-tRNA-protein transferase  40.48 
 
 		 258 aa  172  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2393  arginyl-tRNA-protein transferase  39.15 
 
 		 266 aa  171  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0237  arginyl-tRNA-protein transferase  39.92 
 
 		 262 aa  170  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0617  arginyl-tRNA-protein transferase  40.85 
 
 		 281 aa  170  2e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.224071 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2649  arginyl-tRNA-protein transferase  39.68 
 
 		 258 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.803585 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2121  arginyl-tRNA-protein transferase  43.03 
 
 		 244 aa  169  3e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1601  arginyl-tRNA-protein transferase  39.58 
 
 		 253 aa  168  6e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5634  arginyl-tRNA-protein transferase  40.55 
 
 		 251 aa  168  8e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.336417 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1911  arginyl-tRNA-protein transferase  40.42 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.582376  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2242  arginyl-tRNA-protein transferase  40 
 
 		 257 aa  168  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.354347  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0342  arginyl-tRNA-protein transferase  39.92 
 
 		 257 aa  168  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.287506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2986  arginyl-tRNA-protein transferase  40.66 
 
 		 258 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.575869  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2538  arginyl-tRNA-protein transferase  39.27 
 
 		 249 aa  166  5e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1714  arginyl-tRNA-protein transferase  41.13 
 
 		 239 aa  165  5.9999999999999996e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484439 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1791  arginyl-tRNA-protein transferase  40.09 
 
 		 233 aa  165  8e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2621  arginyl-tRNA-protein transferase  40.25 
 
 		 257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_004310  BR0755  arginyl-tRNA-protein transferase  38.87 
 
 		 249 aa  163  3e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.576435  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0750  arginyl-tRNA-protein transferase  38.87 
 
 		 249 aa  163  3e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0249  arginine-tRNA--protein transferase  36.91 
 
 		 236 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0425  Arginyltransferase  36.91 
 
 		 236 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557109  hitchhiker  0.00000000502727 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>