146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0304 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0304  arginyl-tRNA-protein transferase  100 
 
 		 254 aa  533  1e-150  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0181876  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0334  arginyl-tRNA-protein transferase  99.21 
 
 		 254 aa  528  1e-149  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0236431  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04859  arginyl-tRNA-protein transferase  70.95 
 
 		 251 aa  361  7.0000000000000005e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.791729  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1109  arginyl-tRNA-protein transferase  61.22 
 
 		 251 aa  317  1e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1690  arginyl-tRNA-protein transferase  41.53 
 
 		 236 aa  208  6e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.672767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2438  arginyl-tRNA-protein transferase  46.38 
 
 		 247 aa  203  2e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3351  hypothetical protein  45.02 
 
 		 235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.190221  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3181  arginyl-tRNA-protein transferase  44.16 
 
 		 235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.248167  normal  0.0460167 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3588  arginyl-tRNA-protein transferase  45.89 
 
 		 235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2348  arginyl-tRNA-protein transferase  41.27 
 
 		 253 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1755  arginyl-tRNA-protein transferase  44.07 
 
 		 237 aa  194  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3410  arginyl-tRNA-protein transferase  45.02 
 
 		 235 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.317388 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3611  arginyl-tRNA-protein transferase  44.59 
 
 		 235 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.85938  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4006  arginyl-tRNA-protein transferase  44.16 
 
 		 235 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315442 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28250  arginyl-tRNA-protein transferase  45.02 
 
 		 252 aa  192  6e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2589  arginyl-tRNA-protein transferase  45.26 
 
 		 235 aa  192  6e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.205058  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1827  arginyl-tRNA-protein transferase  44.16 
 
 		 235 aa  191  7e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.856379  normal  0.0364428 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30260  arginyl-tRNA-protein transferase  45.26 
 
 		 235 aa  191  8e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2597  arginyl-tRNA-protein transferase  44.54 
 
 		 238 aa  191  1e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00148691  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2391  arginyl-tRNA-protein transferase  42.42 
 
 		 235 aa  186  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0694877 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4859  arginyl-tRNA-protein transferase  42.8 
 
 		 249 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2377  arginyl-tRNA-protein transferase  41.1 
 
 		 249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1987  arginyl-tRNA-protein transferase  41.25 
 
 		 246 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1787  arginyl-tRNA-protein transferase  41.25 
 
 		 246 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4697  arginyl-tRNA-protein transferase  42.02 
 
 		 276 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.165949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1677  arginyl-tRNA-protein transferase  41.6 
 
 		 276 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.278409 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2042  arginyl-tRNA-protein transferase  42.49 
 
 		 240 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000226368  normal  0.32871 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0019  arginyl-tRNA-protein transferase  41.77 
 
 		 247 aa  179  2.9999999999999997e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1979  arginyl-tRNA-protein transferase  41.95 
 
 		 247 aa  179  4.999999999999999e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0083576 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1456  arginyl-tRNA-protein transferase  42.26 
 
 		 276 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.691361  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1616  arginyl-tRNA-protein transferase  39.18 
 
 		 257 aa  178  7e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1477  arginyl-tRNA-protein transferase  42.44 
 
 		 276 aa  178  8e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.718047  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1252  arginyl-tRNA-protein transferase  41.22 
 
 		 276 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1979  arginyl-tRNA-protein transferase  41.22 
 
 		 276 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1075  arginyl-tRNA-protein transferase  41.18 
 
 		 276 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1555  arginyl-tRNA-protein transferase  41.18 
 
 		 276 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1735  arginyl-tRNA-protein transferase  41.22 
 
 		 276 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1531  arginyl-tRNA-protein transferase  41.18 
 
 		 276 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0393  arginyl-tRNA-protein transferase  41.22 
 
 		 276 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.639576  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1810  arginyl-tRNA-protein transferase  41.22 
 
 		 276 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.663288  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1826  arginyl-tRNA-protein transferase  41.22 
 
 		 276 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0769  arginyl-tRNA-protein transferase  41.22 
 
 		 276 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.107158  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0181  Arginyltransferase  42.98 
 
 		 246 aa  175  5e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2325  arginyl-tRNA-protein transferase  40.08 
 
 		 254 aa  174  9e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.117095  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1663  arginyl-tRNA-protein transferase  39.58 
 
 		 279 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0145011 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2510  arginyl-tRNA-protein transferase  40.57 
 
 		 276 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0990136  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1724  arginyl-tRNA-protein transferase  39.43 
 
 		 253 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.290117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0742  arginyl-tRNA-protein transferase  39.47 
 
 		 248 aa  174  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1931  arginyl-tRNA-protein transferase  38.78 
 
 		 255 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14051  normal  0.0172021 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1603  arginyl-tRNA-protein transferase  38.68 
 
 		 254 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.117832  normal  0.3797 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1731  arginyl-tRNA-protein transferase  39.83 
 
 		 273 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.226677  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1791  arginyl-tRNA-protein transferase  43.22 
 
 		 233 aa  170  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3105  arginyl-tRNA-protein transferase  39.48 
 
 		 245 aa  170  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.526442  normal  0.279686 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2506  arginyl-tRNA-protein transferase  38 
 
 		 279 aa  169  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.60461 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1214  arginyl-tRNA-protein transferase  38.75 
 
 		 262 aa  169  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0519713 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1318  arginyl-tRNA-protein transferase  39.08 
 
 		 266 aa  168  7e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1079  arginyl-tRNA-protein transferase  37.72 
 
 		 252 aa  167  1e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.474847  normal  0.305047 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1195  arginyl-tRNA-protein transferase  41.03 
 
 		 247 aa  166  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1175  arginyl-tRNA-protein transferase  39 
 
 		 280 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0249  arginine-tRNA--protein transferase  38.66 
 
 		 236 aa  166  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0425  Arginyltransferase  38.66 
 
 		 236 aa  166  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557109  hitchhiker  0.00000000502727 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0648  arginyl-tRNA-protein transferase  42.79 
 
 		 238 aa  166  4e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1468  arginyl-tRNA-protein transferase  41.18 
 
 		 256 aa  166  4e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.874672  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2242  arginyl-tRNA-protein transferase  39.56 
 
 		 257 aa  163  3e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.354347  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1398  arginyl-tRNA-protein transferase  45.34 
 
 		 236 aa  163  3e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2393  arginyl-tRNA-protein transferase  38.72 
 
 		 266 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3623  arginyl-tRNA-protein transferase  40.5 
 
 		 251 aa  162  5.0000000000000005e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2372  arginyl-tRNA-protein transferase  39.82 
 
 		 231 aa  162  6e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0011943  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3351  arginyl-tRNA-protein transferase  39.74 
 
 		 260 aa  162  7e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.470069  normal  0.662203 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1082  arginyl-tRNA-protein transferase  36.03 
 
 		 285 aa  160  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.188934  normal  0.420596 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2592  arginyl-tRNA-protein transferase  39.92 
 
 		 242 aa  160  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.214767  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2986  arginyl-tRNA-protein transferase  40.27 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.575869  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4292  arginyl-tRNA-protein transferase  37.3 
 
 		 249 aa  160  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01569  arginyl-tRNA-protein transferase  39.21 
 
 		 233 aa  159  3e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003954  arginine-tRNA-protein transferase  40.09 
 
 		 233 aa  159  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000149764  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2121  arginyl-tRNA-protein transferase  39.38 
 
 		 244 aa  159  4e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2225  arginyl-tRNA-protein transferase  39.47 
 
 		 235 aa  159  6e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000635584  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1296  arginyl-tRNA-protein transferase  36.93 
 
 		 280 aa  158  8e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4657  arginyl-tRNA-protein transferase  38.94 
 
 		 258 aa  158  8e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2639  arginyl-tRNA-protein transferase  36.93 
 
 		 280 aa  158  9e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.286005  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2649  arginyl-tRNA-protein transferase  38.94 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.803585 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0882  arginyl-tRNA-protein transferase  37.77 
 
 		 274 aa  158  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.883111  normal  0.212402 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1204  arginyl-tRNA-protein transferase  38.33 
 
 		 257 aa  156  3e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2168  arginyl-tRNA-protein transferase  37.75 
 
 		 281 aa  155  4e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0971053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2883  arginyl-tRNA-protein transferase  39.39 
 
 		 241 aa  155  6e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167037 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2530  arginyl-tRNA-protein transferase  35.68 
 
 		 241 aa  155  6e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000125656  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2658  arginyl-tRNA-protein transferase  38.94 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.458469  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5634  arginyl-tRNA-protein transferase  38.96 
 
 		 251 aa  154  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.336417 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0617  arginyl-tRNA-protein transferase  39.17 
 
 		 281 aa  154  1e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.224071 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2621  arginyl-tRNA-protein transferase  38.94 
 
 		 257 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2583  arginyl-tRNA-protein transferase  38.86 
 
 		 236 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000870424  normal  0.0975132 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1601  arginyl-tRNA-protein transferase  37.33 
 
 		 253 aa  154  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1911  arginyl-tRNA-protein transferase  37.78 
 
 		 257 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.582376  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1881  arginyl-tRNA-protein transferase  38.86 
 
 		 236 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000197497  hitchhiker  0.000837728 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2708  arginyl-tRNA-protein transferase  36.82 
 
 		 251 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2463  arginyl-tRNA-protein transferase  38.86 
 
 		 236 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000249099  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0931  arginyl-tRNA-protein transferase  37.13 
 
 		 248 aa  152  5e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0193494  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1075  arginyl-tRNA-protein transferase  37.13 
 
 		 248 aa  152  5e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.646097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2470  arginyl-tRNA-protein transferase  37.99 
 
 		 236 aa  152  5e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000771659  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0810  arginyl-tRNA-protein transferase  35.22 
 
 		 259 aa  150  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.603033 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>