146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2372 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2372  arginyl-tRNA-protein transferase  100 
 
 		 231 aa  488  1e-137  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0011943  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2530  arginyl-tRNA-protein transferase  50 
 
 		 241 aa  240  1e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000125656  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2764  arginyl-tRNA-protein transferase  50.21 
 
 		 253 aa  239  2e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0812306  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2697  arginyl-tRNA-protein transferase  48.66 
 
 		 236 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000253337  normal  0.128903 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2225  arginyl-tRNA-protein transferase  49.11 
 
 		 235 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000635584  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1888  arginyl-tRNA-protein transferase  47.77 
 
 		 236 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000499329  hitchhiker  0.000014618 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2054  arginyl-tRNA-protein transferase  47.56 
 
 		 237 aa  227  1e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000273717  normal  0.355745 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2583  arginyl-tRNA-protein transferase  46.88 
 
 		 236 aa  226  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000870424  normal  0.0975132 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2624  arginyl-tRNA-protein transferase  48.66 
 
 		 238 aa  226  3e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1881  arginyl-tRNA-protein transferase  46.88 
 
 		 236 aa  226  3e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000197497  hitchhiker  0.000837728 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2470  arginyl-tRNA-protein transferase  46.88 
 
 		 236 aa  226  3e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000771659  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2463  arginyl-tRNA-protein transferase  46.88 
 
 		 236 aa  226  3e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000249099  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1725  arginyl-tRNA-protein transferase  47.32 
 
 		 238 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000702749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1755  arginyl-tRNA-protein transferase  47.32 
 
 		 238 aa  224  6e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000858101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1650  arginyl-tRNA-protein transferase  46.88 
 
 		 238 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2252  arginyl-tRNA-protein transferase  45.5 
 
 		 239 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000157492  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30260  arginyl-tRNA-protein transferase  48.89 
 
 		 235 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2589  arginyl-tRNA-protein transferase  48.44 
 
 		 235 aa  219  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.205058  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1568  arginyl-tRNA-protein transferase  48 
 
 		 234 aa  216  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000198847  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2391  arginyl-tRNA-protein transferase  47.16 
 
 		 235 aa  211  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0694877 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01638  arginyl-tRNA-protein transferase  50.26 
 
 		 214 aa  210  1e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000119762  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1337  arginyl-tRNA-protein transferase  46.02 
 
 		 233 aa  210  1e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0223511  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3410  arginyl-tRNA-protein transferase  47.11 
 
 		 235 aa  209  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.317388 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2216  arginyl-tRNA-protein transferase  44 
 
 		 230 aa  209  3e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0631637  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4006  arginyl-tRNA-protein transferase  47.11 
 
 		 235 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315442 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1827  arginyl-tRNA-protein transferase  47.11 
 
 		 235 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.856379  normal  0.0364428 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3611  arginyl-tRNA-protein transferase  47.35 
 
 		 235 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.85938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2438  arginyl-tRNA-protein transferase  45.18 
 
 		 247 aa  207  1e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1836  arginyl-tRNA-protein transferase  45.25 
 
 		 233 aa  206  2e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000137975  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3588  arginyl-tRNA-protein transferase  45.41 
 
 		 235 aa  206  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1755  arginyl-tRNA-protein transferase  47.03 
 
 		 237 aa  201  7e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28250  arginyl-tRNA-protein transferase  44.98 
 
 		 252 aa  201  8e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1690  arginyl-tRNA-protein transferase  44.69 
 
 		 236 aa  200  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.672767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01569  arginyl-tRNA-protein transferase  42.04 
 
 		 233 aa  199  3e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3351  hypothetical protein  45.78 
 
 		 235 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.190221  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3181  arginyl-tRNA-protein transferase  45.78 
 
 		 235 aa  198  7e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.248167  normal  0.0460167 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003954  arginine-tRNA-protein transferase  42.11 
 
 		 233 aa  192  4e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000149764  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1109  arginyl-tRNA-protein transferase  41.7 
 
 		 251 aa  186  3e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2597  arginyl-tRNA-protein transferase  41.92 
 
 		 238 aa  184  8e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00148691  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0019  arginyl-tRNA-protein transferase  39.01 
 
 		 247 aa  176  3e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1791  arginyl-tRNA-protein transferase  41.28 
 
 		 233 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2042  arginyl-tRNA-protein transferase  38.43 
 
 		 240 aa  171  1e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000226368  normal  0.32871 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2242  arginyl-tRNA-protein transferase  38.27 
 
 		 257 aa  170  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.354347  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0617  arginyl-tRNA-protein transferase  41.44 
 
 		 281 aa  168  7e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.224071 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0648  arginyl-tRNA-protein transferase  39.11 
 
 		 238 aa  167  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04859  arginyl-tRNA-protein transferase  40.72 
 
 		 251 aa  167  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.791729  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0181  Arginyltransferase  40.09 
 
 		 246 aa  166  4e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1911  arginyl-tRNA-protein transferase  38.56 
 
 		 257 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.582376  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0304  arginyl-tRNA-protein transferase  39.82 
 
 		 254 aa  162  5.0000000000000005e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0181876  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0334  arginyl-tRNA-protein transferase  39.82 
 
 		 254 aa  161  9e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0236431  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2348  arginyl-tRNA-protein transferase  39.22 
 
 		 253 aa  156  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1714  arginyl-tRNA-protein transferase  40 
 
 		 239 aa  157  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484439 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4657  arginyl-tRNA-protein transferase  37.19 
 
 		 258 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2649  arginyl-tRNA-protein transferase  37.13 
 
 		 258 aa  155  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.803585 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1204  arginyl-tRNA-protein transferase  35.54 
 
 		 257 aa  155  7e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0249  arginine-tRNA--protein transferase  37.18 
 
 		 236 aa  154  8e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0425  Arginyltransferase  37.18 
 
 		 236 aa  154  8e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557109  hitchhiker  0.00000000502727 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2377  arginyl-tRNA-protein transferase  36.64 
 
 		 249 aa  154  9e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0931  arginyl-tRNA-protein transferase  36.4 
 
 		 248 aa  154  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0193494  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1075  arginyl-tRNA-protein transferase  36.4 
 
 		 248 aa  154  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.646097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4859  arginyl-tRNA-protein transferase  35.98 
 
 		 249 aa  154  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2986  arginyl-tRNA-protein transferase  37.14 
 
 		 258 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.575869  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1601  arginyl-tRNA-protein transferase  36.02 
 
 		 253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1111  arginyl-tRNA-protein transferase  35.56 
 
 		 258 aa  152  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1195  arginyl-tRNA-protein transferase  35.65 
 
 		 247 aa  152  4e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4611  arginyl-tRNA-protein transferase  37.82 
 
 		 248 aa  152  4e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.209476  normal  0.240432 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1787  arginyl-tRNA-protein transferase  37.5 
 
 		 246 aa  152  5e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5634  arginyl-tRNA-protein transferase  36.51 
 
 		 251 aa  152  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.336417 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1987  arginyl-tRNA-protein transferase  37.5 
 
 		 246 aa  152  5e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4761  arginyl-tRNA-protein transferase  36.21 
 
 		 248 aa  152  5e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.767227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1260  arginyl-tRNA-protein transferase  35.56 
 
 		 258 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.340737 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1398  arginyl-tRNA-protein transferase  39.64 
 
 		 236 aa  151  8.999999999999999e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1677  arginyl-tRNA-protein transferase  36.86 
 
 		 276 aa  151  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.278409 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4697  arginyl-tRNA-protein transferase  35.98 
 
 		 276 aa  149  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.165949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2658  arginyl-tRNA-protein transferase  36.78 
 
 		 257 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.458469  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2121  arginyl-tRNA-protein transferase  35.86 
 
 		 244 aa  149  3e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4241  arginyl-tRNA-protein transferase  37.39 
 
 		 248 aa  149  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2621  arginyl-tRNA-protein transferase  36.33 
 
 		 257 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0810  arginyl-tRNA-protein transferase  34.71 
 
 		 259 aa  149  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1531  arginyl-tRNA-protein transferase  35.56 
 
 		 276 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1075  arginyl-tRNA-protein transferase  35.56 
 
 		 276 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1555  arginyl-tRNA-protein transferase  35.56 
 
 		 276 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2325  arginyl-tRNA-protein transferase  36.8 
 
 		 254 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.117095  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0742  arginyl-tRNA-protein transferase  34.47 
 
 		 248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1175  arginyl-tRNA-protein transferase  35.29 
 
 		 280 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1979  arginyl-tRNA-protein transferase  38.36 
 
 		 247 aa  147  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0083576 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1127  arginyl-tRNA-protein transferase  35.27 
 
 		 249 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1477  arginyl-tRNA-protein transferase  35.59 
 
 		 276 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.718047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1456  arginyl-tRNA-protein transferase  35.59 
 
 		 276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.691361  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4292  arginyl-tRNA-protein transferase  32.92 
 
 		 249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1731  arginyl-tRNA-protein transferase  35.86 
 
 		 273 aa  145  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.226677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3105  arginyl-tRNA-protein transferase  37.07 
 
 		 245 aa  145  5e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.526442  normal  0.279686 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6838  arginyl-tRNA-protein transferase  37.25 
 
 		 248 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.143277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1468  arginyl-tRNA-protein transferase  37.07 
 
 		 256 aa  144  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.874672  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_004310  BR0755  arginyl-tRNA-protein transferase  33.05 
 
 		 249 aa  143  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.576435  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2510  arginyl-tRNA-protein transferase  34.75 
 
 		 276 aa  143  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0990136  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1663  arginyl-tRNA-protein transferase  34.02 
 
 		 279 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0145011 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1724  arginyl-tRNA-protein transferase  36.36 
 
 		 253 aa  143  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.290117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1735  arginyl-tRNA-protein transferase  35.17 
 
 		 276 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0750  arginyl-tRNA-protein transferase  33.05 
 
 		 249 aa  143  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>