147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1690 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_1690  arginyl-tRNA-protein transferase  100 
 
 
236 aa  497  1e-140  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.672767  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28250  arginyl-tRNA-protein transferase  53.19 
 
 
252 aa  273  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3611  arginyl-tRNA-protein transferase  52.77 
 
 
235 aa  269  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.85938  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2391  arginyl-tRNA-protein transferase  52.16 
 
 
235 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0694877 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4006  arginyl-tRNA-protein transferase  51.91 
 
 
235 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315442 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3588  arginyl-tRNA-protein transferase  51.06 
 
 
235 aa  266  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3410  arginyl-tRNA-protein transferase  51.91 
 
 
235 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.317388 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1827  arginyl-tRNA-protein transferase  51.91 
 
 
235 aa  265  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.856379  normal  0.0364428 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2589  arginyl-tRNA-protein transferase  51.06 
 
 
235 aa  263  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.205058  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3351  hypothetical protein  49.36 
 
 
235 aa  262  3e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.190221  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30260  arginyl-tRNA-protein transferase  51.06 
 
 
235 aa  262  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1755  arginyl-tRNA-protein transferase  50.86 
 
 
237 aa  258  7e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3181  arginyl-tRNA-protein transferase  48.94 
 
 
235 aa  258  8e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.248167  normal  0.0460167 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2438  arginyl-tRNA-protein transferase  48.7 
 
 
247 aa  253  3e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1109  arginyl-tRNA-protein transferase  42.8 
 
 
251 aa  223  2e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157369  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0648  arginyl-tRNA-protein transferase  44.59 
 
 
238 aa  221  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2597  arginyl-tRNA-protein transferase  43.53 
 
 
238 aa  216  2e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00148691  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0181  Arginyltransferase  42.62 
 
 
246 aa  216  2e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0019  arginyl-tRNA-protein transferase  43.81 
 
 
247 aa  216  2e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0304  arginyl-tRNA-protein transferase  41.53 
 
 
254 aa  208  5e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0181876  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0334  arginyl-tRNA-protein transferase  41.53 
 
 
254 aa  208  6e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0236431  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0617  arginyl-tRNA-protein transferase  46.72 
 
 
281 aa  207  8e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.224071 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04859  arginyl-tRNA-protein transferase  41.63 
 
 
251 aa  207  1e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.791729  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1252  arginyl-tRNA-protein transferase  41.6 
 
 
276 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1979  arginyl-tRNA-protein transferase  41.6 
 
 
276 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1735  arginyl-tRNA-protein transferase  41.6 
 
 
276 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0393  arginyl-tRNA-protein transferase  41.6 
 
 
276 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.639576  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1810  arginyl-tRNA-protein transferase  41.6 
 
 
276 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.663288  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1826  arginyl-tRNA-protein transferase  41.6 
 
 
276 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0769  arginyl-tRNA-protein transferase  41.6 
 
 
276 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.107158  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1714  arginyl-tRNA-protein transferase  43.29 
 
 
239 aa  206  3e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.484439 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2042  arginyl-tRNA-protein transferase  42.79 
 
 
240 aa  206  4e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000226368  normal  0.32871 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2510  arginyl-tRNA-protein transferase  41.18 
 
 
276 aa  204  8e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0990136  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2225  arginyl-tRNA-protein transferase  45.16 
 
 
235 aa  201  6e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000635584  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4697  arginyl-tRNA-protein transferase  40.76 
 
 
276 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.165949  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1456  arginyl-tRNA-protein transferase  40.76 
 
 
276 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.691361  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1477  arginyl-tRNA-protein transferase  40.76 
 
 
276 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.718047  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2372  arginyl-tRNA-protein transferase  44.69 
 
 
231 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0011943  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1568  arginyl-tRNA-protein transferase  46.76 
 
 
234 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000198847  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1931  arginyl-tRNA-protein transferase  42.62 
 
 
255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14051  normal  0.0172021 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1663  arginyl-tRNA-protein transferase  40.74 
 
 
279 aa  198  5e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0145011 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1531  arginyl-tRNA-protein transferase  40.25 
 
 
276 aa  198  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1075  arginyl-tRNA-protein transferase  40.25 
 
 
276 aa  198  6e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1555  arginyl-tRNA-protein transferase  40.25 
 
 
276 aa  198  6e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1791  arginyl-tRNA-protein transferase  42.53 
 
 
233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2624  arginyl-tRNA-protein transferase  44.24 
 
 
238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1603  arginyl-tRNA-protein transferase  42.19 
 
 
254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.117832  normal  0.3797 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1677  arginyl-tRNA-protein transferase  39.92 
 
 
276 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.278409 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2583  arginyl-tRNA-protein transferase  44.7 
 
 
236 aa  196  3e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000870424  normal  0.0975132 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1881  arginyl-tRNA-protein transferase  44.7 
 
 
236 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000197497  hitchhiker  0.000837728 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2470  arginyl-tRNA-protein transferase  44.7 
 
 
236 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000771659  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2463  arginyl-tRNA-protein transferase  44.7 
 
 
236 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000249099  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2054  arginyl-tRNA-protein transferase  44.91 
 
 
237 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000273717  normal  0.355745 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2530  arginyl-tRNA-protein transferase  41.78 
 
 
241 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000125656  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1731  arginyl-tRNA-protein transferase  40.17 
 
 
273 aa  195  6e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.226677  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1616  arginyl-tRNA-protein transferase  41.77 
 
 
257 aa  194  7e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1650  arginyl-tRNA-protein transferase  43.32 
 
 
238 aa  194  8.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736484  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1725  arginyl-tRNA-protein transferase  43.32 
 
 
238 aa  194  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000702749  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1724  arginyl-tRNA-protein transferase  42.37 
 
 
253 aa  193  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.290117  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1195  arginyl-tRNA-protein transferase  40.17 
 
 
247 aa  192  3e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2697  arginyl-tRNA-protein transferase  42.59 
 
 
236 aa  191  6e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000253337  normal  0.128903 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2506  arginyl-tRNA-protein transferase  39.18 
 
 
279 aa  191  7e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.60461 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1318  arginyl-tRNA-protein transferase  40.93 
 
 
266 aa  191  8e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2592  arginyl-tRNA-protein transferase  42.36 
 
 
242 aa  191  9e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.214767  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1755  arginyl-tRNA-protein transferase  42.86 
 
 
238 aa  191  9e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000858101  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0931  arginyl-tRNA-protein transferase  40 
 
 
248 aa  190  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0193494  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1075  arginyl-tRNA-protein transferase  40 
 
 
248 aa  190  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.646097  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2377  arginyl-tRNA-protein transferase  41.45 
 
 
249 aa  189  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2325  arginyl-tRNA-protein transferase  41.45 
 
 
254 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.117095  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4859  arginyl-tRNA-protein transferase  41.45 
 
 
249 aa  189  4e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0742  arginyl-tRNA-protein transferase  39.26 
 
 
248 aa  186  3e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1079  arginyl-tRNA-protein transferase  41.32 
 
 
252 aa  186  4e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.474847  normal  0.305047 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1979  arginyl-tRNA-protein transferase  40.17 
 
 
247 aa  186  4e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0083576 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003954  arginine-tRNA-protein transferase  40.95 
 
 
233 aa  185  5e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000149764  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1787  arginyl-tRNA-protein transferase  41.32 
 
 
246 aa  185  6e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1987  arginyl-tRNA-protein transferase  41.32 
 
 
246 aa  185  6e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13709  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2348  arginyl-tRNA-protein transferase  41.45 
 
 
253 aa  184  9e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1888  arginyl-tRNA-protein transferase  41.18 
 
 
236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000499329  hitchhiker  0.000014618 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1214  arginyl-tRNA-protein transferase  39.66 
 
 
262 aa  182  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0519713 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1836  arginyl-tRNA-protein transferase  39.13 
 
 
233 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000137975  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01569  arginyl-tRNA-protein transferase  39.41 
 
 
233 aa  182  5.0000000000000004e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3105  arginyl-tRNA-protein transferase  41.74 
 
 
245 aa  181  6e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.526442  normal  0.279686 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2708  arginyl-tRNA-protein transferase  39.5 
 
 
251 aa  180  1e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3351  arginyl-tRNA-protein transferase  38.39 
 
 
260 aa  179  2.9999999999999997e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.470069  normal  0.662203 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2883  arginyl-tRNA-protein transferase  39.57 
 
 
241 aa  178  5.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167037 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2764  arginyl-tRNA-protein transferase  41.45 
 
 
253 aa  177  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0812306  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1337  arginyl-tRNA-protein transferase  39.91 
 
 
233 aa  177  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0223511  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1468  arginyl-tRNA-protein transferase  40.17 
 
 
256 aa  176  4e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.874672  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1398  arginyl-tRNA-protein transferase  39.3 
 
 
236 aa  172  3.9999999999999995e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2252  arginyl-tRNA-protein transferase  38.46 
 
 
239 aa  172  5e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000157492  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1559  arginyl-tRNA-protein transferase  35.53 
 
 
254 aa  169  3e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0919298  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2216  arginyl-tRNA-protein transferase  38.33 
 
 
230 aa  169  5e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0631637  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1082  arginyl-tRNA-protein transferase  34.47 
 
 
285 aa  167  9e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.188934  normal  0.420596 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3623  arginyl-tRNA-protein transferase  40 
 
 
251 aa  167  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2242  arginyl-tRNA-protein transferase  36.32 
 
 
257 aa  166  4e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.354347  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1911  arginyl-tRNA-protein transferase  36.32 
 
 
257 aa  165  5.9999999999999996e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.582376  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0425  Arginyltransferase  37 
 
 
236 aa  164  8e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557109  hitchhiker  0.00000000502727 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0249  arginine-tRNA--protein transferase  37 
 
 
236 aa  164  8e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0882  arginyl-tRNA-protein transferase  35.4 
 
 
274 aa  164  9e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.883111  normal  0.212402 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2121  arginyl-tRNA-protein transferase  36.8 
 
 
244 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>