146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4761 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_4761  arginyl-tRNA-protein transferase  100 
 
 
248 aa  513  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.767227  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4611  arginyl-tRNA-protein transferase  98.39 
 
 
248 aa  504  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.209476  normal  0.240432 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4241  arginyl-tRNA-protein transferase  97.98 
 
 
248 aa  502  1e-141  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5634  arginyl-tRNA-protein transferase  84.68 
 
 
251 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.336417 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6838  arginyl-tRNA-protein transferase  87.45 
 
 
248 aa  434  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.143277  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7576  arginyl-tRNA-protein transferase  86.69 
 
 
248 aa  436  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4292  arginyl-tRNA-protein transferase  70.56 
 
 
249 aa  369  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2649  arginyl-tRNA-protein transferase  68.55 
 
 
258 aa  360  1e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.803585 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1127  arginyl-tRNA-protein transferase  68.16 
 
 
249 aa  360  1e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0755  arginyl-tRNA-protein transferase  66.13 
 
 
249 aa  358  4e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.576435  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2986  arginyl-tRNA-protein transferase  66.53 
 
 
258 aa  358  4e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.575869  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0750  arginyl-tRNA-protein transferase  66.13 
 
 
249 aa  358  4e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2621  arginyl-tRNA-protein transferase  66.53 
 
 
257 aa  357  7e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2658  arginyl-tRNA-protein transferase  66.94 
 
 
257 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.458469  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2538  arginyl-tRNA-protein transferase  66.13 
 
 
249 aa  356  1.9999999999999998e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1911  arginyl-tRNA-protein transferase  66.13 
 
 
257 aa  354  6.999999999999999e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.582376  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2242  arginyl-tRNA-protein transferase  66.53 
 
 
257 aa  354  7.999999999999999e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.354347  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4657  arginyl-tRNA-protein transferase  64.92 
 
 
258 aa  349  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1204  arginyl-tRNA-protein transferase  68.55 
 
 
257 aa  347  1e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2121  arginyl-tRNA-protein transferase  68.25 
 
 
244 aa  345  3e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1111  arginyl-tRNA-protein transferase  61.69 
 
 
258 aa  335  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0810  arginyl-tRNA-protein transferase  63.01 
 
 
259 aa  333  1e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1260  arginyl-tRNA-protein transferase  60.89 
 
 
258 aa  333  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.340737 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1601  arginyl-tRNA-protein transferase  58.47 
 
 
253 aa  310  2e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2883  arginyl-tRNA-protein transferase  61.86 
 
 
241 aa  295  7e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167037 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3062  arginyl-tRNA-protein transferase  56.5 
 
 
283 aa  268  5e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0342  arginyl-tRNA-protein transferase  52.23 
 
 
257 aa  260  1e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.287506  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2168  arginyl-tRNA-protein transferase  55.08 
 
 
281 aa  256  2e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0971053  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1175  arginyl-tRNA-protein transferase  54.55 
 
 
280 aa  254  8e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1101  arginyl-tRNA-protein transferase  52.65 
 
 
284 aa  253  2.0000000000000002e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2639  arginyl-tRNA-protein transferase  53.91 
 
 
280 aa  253  3e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.286005  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1296  arginyl-tRNA-protein transferase  53.91 
 
 
280 aa  253  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1082  arginyl-tRNA-protein transferase  53.33 
 
 
285 aa  250  2e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.188934  normal  0.420596 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2393  arginyl-tRNA-protein transferase  53.53 
 
 
266 aa  248  5e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1903  arginyl-tRNA-protein transferase  53.36 
 
 
286 aa  247  1e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.72885 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0882  arginyl-tRNA-protein transferase  53.16 
 
 
274 aa  246  2e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.883111  normal  0.212402 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1559  arginyl-tRNA-protein transferase  48.36 
 
 
254 aa  228  8e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0919298  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0237  arginyl-tRNA-protein transferase  47.77 
 
 
262 aa  226  4e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3351  arginyl-tRNA-protein transferase  47.56 
 
 
260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.470069  normal  0.662203 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1845  arginyl-tRNA-protein transferase  44.53 
 
 
246 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1663  arginyl-tRNA-protein transferase  43.08 
 
 
279 aa  188  8e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0145011 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1075  arginyl-tRNA-protein transferase  42.46 
 
 
276 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1555  arginyl-tRNA-protein transferase  42.46 
 
 
276 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2377  arginyl-tRNA-protein transferase  41.56 
 
 
249 aa  183  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1531  arginyl-tRNA-protein transferase  42.46 
 
 
276 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1787  arginyl-tRNA-protein transferase  43.27 
 
 
246 aa  183  3e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1987  arginyl-tRNA-protein transferase  43.27 
 
 
246 aa  183  3e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13709  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4697  arginyl-tRNA-protein transferase  42.06 
 
 
276 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.165949  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2510  arginyl-tRNA-protein transferase  42.06 
 
 
276 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0990136  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1252  arginyl-tRNA-protein transferase  41.27 
 
 
276 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1979  arginyl-tRNA-protein transferase  41.27 
 
 
276 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1731  arginyl-tRNA-protein transferase  41.27 
 
 
273 aa  181  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.226677  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1735  arginyl-tRNA-protein transferase  41.27 
 
 
276 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0393  arginyl-tRNA-protein transferase  41.27 
 
 
276 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.639576  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1810  arginyl-tRNA-protein transferase  41.27 
 
 
276 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.663288  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1826  arginyl-tRNA-protein transferase  41.27 
 
 
276 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0769  arginyl-tRNA-protein transferase  41.27 
 
 
276 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.107158  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4859  arginyl-tRNA-protein transferase  41.11 
 
 
249 aa  180  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1477  arginyl-tRNA-protein transferase  41.67 
 
 
276 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.718047  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1677  arginyl-tRNA-protein transferase  41.5 
 
 
276 aa  179  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.278409 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1979  arginyl-tRNA-protein transferase  42.63 
 
 
247 aa  179  4.999999999999999e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0083576 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1456  arginyl-tRNA-protein transferase  40.87 
 
 
276 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.691361  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2506  arginyl-tRNA-protein transferase  40.39 
 
 
279 aa  178  8e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.60461 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2325  arginyl-tRNA-protein transferase  42.21 
 
 
254 aa  178  9e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.117095  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0648  arginyl-tRNA-protein transferase  43.33 
 
 
238 aa  177  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1724  arginyl-tRNA-protein transferase  41.39 
 
 
253 aa  177  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.290117  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2597  arginyl-tRNA-protein transferase  42.31 
 
 
238 aa  176  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00148691  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1195  arginyl-tRNA-protein transferase  43.22 
 
 
247 aa  176  4e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2042  arginyl-tRNA-protein transferase  42.46 
 
 
240 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000226368  normal  0.32871 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1931  arginyl-tRNA-protein transferase  42.51 
 
 
255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14051  normal  0.0172021 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1616  arginyl-tRNA-protein transferase  42.91 
 
 
257 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2708  arginyl-tRNA-protein transferase  41.53 
 
 
251 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2592  arginyl-tRNA-protein transferase  41.87 
 
 
242 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.214767  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1468  arginyl-tRNA-protein transferase  40.56 
 
 
256 aa  172  5e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.874672  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0742  arginyl-tRNA-protein transferase  39.92 
 
 
248 aa  171  6.999999999999999e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1603  arginyl-tRNA-protein transferase  41.7 
 
 
254 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.117832  normal  0.3797 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2348  arginyl-tRNA-protein transferase  41.39 
 
 
253 aa  170  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1214  arginyl-tRNA-protein transferase  42.8 
 
 
262 aa  169  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0519713 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1318  arginyl-tRNA-protein transferase  41.7 
 
 
266 aa  167  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2438  arginyl-tRNA-protein transferase  40.17 
 
 
247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30260  arginyl-tRNA-protein transferase  39.41 
 
 
235 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0425  Arginyltransferase  41.6 
 
 
236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557109  hitchhiker  0.00000000502727 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0249  arginine-tRNA--protein transferase  41.6 
 
 
236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2589  arginyl-tRNA-protein transferase  38.98 
 
 
235 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.205058  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1079  arginyl-tRNA-protein transferase  37.8 
 
 
252 aa  160  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.474847  normal  0.305047 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3105  arginyl-tRNA-protein transferase  39.18 
 
 
245 aa  160  3e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.526442  normal  0.279686 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0181  Arginyltransferase  40.86 
 
 
246 aa  156  2e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0617  arginyl-tRNA-protein transferase  38.59 
 
 
281 aa  157  2e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.224071 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3623  arginyl-tRNA-protein transferase  41.3 
 
 
251 aa  154  9e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3588  arginyl-tRNA-protein transferase  37.29 
 
 
235 aa  152  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1109  arginyl-tRNA-protein transferase  37.76 
 
 
251 aa  152  4e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157369  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2372  arginyl-tRNA-protein transferase  36.21 
 
 
231 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0011943  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28250  arginyl-tRNA-protein transferase  38.98 
 
 
252 aa  152  7e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0334  arginyl-tRNA-protein transferase  38.4 
 
 
254 aa  151  8e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0236431  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0304  arginyl-tRNA-protein transferase  38.4 
 
 
254 aa  150  2e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0181876  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1755  arginyl-tRNA-protein transferase  36.32 
 
 
237 aa  150  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1690  arginyl-tRNA-protein transferase  34.32 
 
 
236 aa  149  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.672767  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2391  arginyl-tRNA-protein transferase  38.24 
 
 
235 aa  149  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0694877 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1791  arginyl-tRNA-protein transferase  37.66 
 
 
233 aa  148  8e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2764  arginyl-tRNA-protein transferase  35.17 
 
 
253 aa  148  8e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0812306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>