241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1102 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1102  YicC domain protein  100 
 
 
297 aa  590  1e-167  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00452876  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1469  domain of unknown function DUF1732  31.82 
 
 
287 aa  137  2e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000162947  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3632  hypothetical protein  26.01 
 
 
293 aa  112  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.101055 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2690  hypothetical protein  25.68 
 
 
290 aa  112  6e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.886781  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0741  hypothetical protein  28.37 
 
 
286 aa  111  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1317  hypothetical protein  30.98 
 
 
294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.269981  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3135  hypothetical protein  27.7 
 
 
310 aa  110  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.338294 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2445  hypothetical protein  25.43 
 
 
288 aa  110  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.465243 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1316  domain of unknown function DUF1732  25.68 
 
 
292 aa  110  4.0000000000000004e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0322  domain of unknown function DUF1732  27.42 
 
 
295 aa  109  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.563369 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3822  hypothetical protein  28.91 
 
 
295 aa  106  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.169927 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0138  hypothetical protein  29.59 
 
 
293 aa  106  6e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0296876 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1404  hypothetical protein  26.91 
 
 
293 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0011  YicC domain protein  27.81 
 
 
292 aa  104  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.272506  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0890  hypothetical protein  27.36 
 
 
292 aa  103  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000147276  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2607  hypothetical protein  25.74 
 
 
291 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.034124  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1528  hypothetical protein  24.5 
 
 
294 aa  103  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.214783  normal  0.106302 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2959  hypothetical protein  25 
 
 
288 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1684  hypothetical protein  27.03 
 
 
295 aa  103  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0296  hypothetical protein  25.17 
 
 
293 aa  102  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4021  hypothetical protein  26.9 
 
 
288 aa  101  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0474  hypothetical protein  26.19 
 
 
288 aa  101  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0463  hypothetical protein  25.84 
 
 
299 aa  100  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0468  hypothetical protein  25.84 
 
 
299 aa  100  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.306988  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0676  hypothetical protein  28.81 
 
 
291 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.106933  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0838  YicC domain protein  27.95 
 
 
293 aa  99.8  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.422723  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2475  domain of unknown function DUF1732  25.26 
 
 
287 aa  99.8  5e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0250  hypothetical protein  26.44 
 
 
295 aa  99.8  5e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000288973  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2920  hypothetical protein  26.6 
 
 
296 aa  99.4  6e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3480  hypothetical protein  25.6 
 
 
295 aa  99.4  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1564  hypothetical protein  26.6 
 
 
296 aa  99.4  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.329203  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2320  hypothetical protein  27.51 
 
 
292 aa  99  8e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000274769  hitchhiker  0.00243432 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2304  hypothetical protein  25.85 
 
 
295 aa  99  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00318843  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1698  hypothetical protein  28.33 
 
 
292 aa  99  9e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.466508  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3026  hypothetical protein  22.37 
 
 
289 aa  98.2  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.439015  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2721  hypothetical protein  26.26 
 
 
293 aa  98.6  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.151584  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3207  hypothetical protein  25.08 
 
 
287 aa  98.6  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1488  domain of unknown function DUF1732  25.5 
 
 
291 aa  98.6  1e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.283341 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0055  hypothetical protein  23.61 
 
 
287 aa  97.4  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.926553  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0048  hypothetical protein  23.61 
 
 
287 aa  97.4  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2693  hypothetical protein  25.74 
 
 
291 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0180  hypothetical protein  27.12 
 
 
288 aa  97.8  2e-19  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2788  hypothetical protein  25.74 
 
 
291 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4161  hypothetical protein  23.61 
 
 
287 aa  97.4  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.226862  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0513  hypothetical protein  29.24 
 
 
296 aa  97.1  4e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0201327 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001828  protein YicC  24.14 
 
 
288 aa  97.1  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.172185  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1239  hypothetical protein  30.3 
 
 
292 aa  96.7  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.369152  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2349  hypothetical protein  26.53 
 
 
295 aa  96.7  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0095  hypothetical protein  22.92 
 
 
287 aa  96.3  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.403752  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4848  hypothetical protein  24.57 
 
 
287 aa  96.3  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0744075  hitchhiker  0.0000405788 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2471  hypothetical protein  27.03 
 
 
295 aa  95.9  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3684  hypothetical protein  23.71 
 
 
288 aa  94.7  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0517661 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0417  hypothetical protein  27.55 
 
 
295 aa  95.5  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0107  hypothetical protein  24.65 
 
 
287 aa  94.4  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3724  hypothetical protein  29.8 
 
 
291 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3614  hypothetical protein  29.8 
 
 
291 aa  94.4  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4011  hypothetical protein  29.8 
 
 
291 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2975  hypothetical protein  26.53 
 
 
295 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3896  hypothetical protein  28.43 
 
 
289 aa  94  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000579804  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1448  hypothetical protein  22.74 
 
 
302 aa  93.6  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0364721  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3916  hypothetical protein  29.19 
 
 
291 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3632  hypothetical protein  28.72 
 
 
291 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00647  hypothetical protein  23.45 
 
 
288 aa  93.6  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0131  hypothetical protein  23.71 
 
 
287 aa  93.6  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2574  hypothetical protein  24.73 
 
 
291 aa  93.2  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0448816 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3887  hypothetical protein  29.19 
 
 
291 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000222822 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3921  hypothetical protein  29.19 
 
 
291 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.831608  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1993  hypothetical protein  24.91 
 
 
288 aa  93.2  5e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1988  hypothetical protein  25.77 
 
 
288 aa  92.8  6e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0956  hypothetical protein  22.92 
 
 
288 aa  92.8  7e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.253768  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1284  hypothetical protein  27.52 
 
 
292 aa  92.8  7e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00734721  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4116  hypothetical protein  23.88 
 
 
287 aa  92.8  7e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.124592  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4069  hypothetical protein  24.22 
 
 
287 aa  92.4  8e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.105197  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0549  hypothetical protein  24.66 
 
 
289 aa  92.4  8e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.829174  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2881  hypothetical protein  28.05 
 
 
292 aa  92.4  8e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000426445  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03501  hypothetical protein  23.88 
 
 
287 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.137526  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0061  YicC domain protein  23.88 
 
 
287 aa  92  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1271  hypothetical protein  29.14 
 
 
291 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00975001  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0067  hypothetical protein  23.88 
 
 
287 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0211389  hitchhiker  0.00000185241 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2086  hypothetical protein  26.25 
 
 
293 aa  92  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0249545 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4145  hypothetical protein  23.88 
 
 
287 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0120633  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5014  hypothetical protein  23.88 
 
 
287 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3853  hypothetical protein  23.88 
 
 
287 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.349633  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3214  hypothetical protein  27.8 
 
 
292 aa  91.3  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000193402  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1056  hypothetical protein  27.46 
 
 
291 aa  91.3  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000165495  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0372  hypothetical protein  27.61 
 
 
291 aa  91.3  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.816164  normal  0.284607 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2588  hypothetical protein  22.76 
 
 
288 aa  90.9  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3972  hypothetical protein  29.14 
 
 
291 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00569731  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0319  hypothetical protein  25.17 
 
 
309 aa  90.9  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4405  hypothetical protein  23.53 
 
 
287 aa  90.5  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2525  hypothetical protein  27.91 
 
 
291 aa  90.5  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3979  hypothetical protein  23.88 
 
 
287 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.200033  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0208  hypothetical protein  22.65 
 
 
287 aa  90.5  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3996  hypothetical protein  24.23 
 
 
287 aa  89.7  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03453  hypothetical protein  23.69 
 
 
285 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.123292  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3269  hypothetical protein  24.91 
 
 
286 aa  89.4  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0374  hypothetical protein  27.81 
 
 
300 aa  89.4  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00280201  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02195  hypothetical protein  28.18 
 
 
281 aa  89.7  6e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0575  hypothetical protein  24.33 
 
 
299 aa  89.4  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3780  hypothetical protein  24.66 
 
 
296 aa  89.4  8e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.370784 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>