242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0138 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0138  hypothetical protein  100 
 
 		 293 aa  594  1e-169  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0296876 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0417  hypothetical protein  53.9 
 
 		 295 aa  308  5.9999999999999995e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0322  domain of unknown function DUF1732  51.86 
 
 		 295 aa  308  9e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.563369 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4196  hypothetical protein  46.71 
 
 		 287 aa  258  7e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0846841  normal  0.629685 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02195  hypothetical protein  45.67 
 
 		 281 aa  237  2e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0741  hypothetical protein  44.56 
 
 		 286 aa  236  3e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2167  hypothetical protein  43.69 
 
 		 284 aa  228  1e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0513  hypothetical protein  43 
 
 		 296 aa  223  3e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0201327 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0676  hypothetical protein  39.46 
 
 		 291 aa  215  5e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.106933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1631  hypothetical protein  39.06 
 
 		 292 aa  211  1e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.176002 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0011  YicC domain protein  35.57 
 
 		 292 aa  180  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.272506  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3696  hypothetical protein  37.2 
 
 		 291 aa  177  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2525  hypothetical protein  37.2 
 
 		 291 aa  176  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1271  hypothetical protein  37.76 
 
 		 291 aa  176  6e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00975001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3921  hypothetical protein  37.2 
 
 		 291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.831608  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3972  hypothetical protein  37.41 
 
 		 291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00569731  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3632  hypothetical protein  37.2 
 
 		 291 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3916  hypothetical protein  37.2 
 
 		 291 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3887  hypothetical protein  37.2 
 
 		 291 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000222822 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3724  hypothetical protein  37.2 
 
 		 291 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3614  hypothetical protein  37.2 
 
 		 291 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4011  hypothetical protein  37.2 
 
 		 291 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0890  hypothetical protein  35.15 
 
 		 292 aa  162  8.000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000147276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1912  hypothetical protein  32.99 
 
 		 294 aa  159  4e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0397702  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1774  hypothetical protein  34.58 
 
 		 295 aa  159  6e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.593354  normal  0.167904 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1056  hypothetical protein  33.78 
 
 		 291 aa  159  7e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000165495  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0305  hypothetical protein  34.58 
 
 		 295 aa  158  9e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000735483  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2287  hypothetical protein  33.11 
 
 		 291 aa  157  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0374  hypothetical protein  35.59 
 
 		 300 aa  157  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00280201  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2402  hypothetical protein  29.11 
 
 		 293 aa  155  6e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0682346  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1698  hypothetical protein  33.67 
 
 		 292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.466508  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2328  hypothetical protein  32.54 
 
 		 292 aa  153  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0372766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3896  hypothetical protein  31.83 
 
 		 289 aa  153  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000579804  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3780  hypothetical protein  33 
 
 		 296 aa  151  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.370784 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0403  hypothetical protein  32.2 
 
 		 295 aa  150  2e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0196247  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1599  hypothetical protein  32.19 
 
 		 292 aa  150  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000017463  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1317  hypothetical protein  31.29 
 
 		 294 aa  149  7e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.269981  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1239  hypothetical protein  33.33 
 
 		 292 aa  148  9e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.369152  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1946  hypothetical protein  33.78 
 
 		 291 aa  147  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0372  hypothetical protein  34.36 
 
 		 291 aa  146  4.0000000000000006e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.816164  normal  0.284607 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3163  hypothetical protein  31.53 
 
 		 292 aa  146  5e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0449219  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2239  hypothetical protein  32.09 
 
 		 292 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1457  hypothetical protein  31.88 
 
 		 295 aa  145  9e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000500736  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2607  hypothetical protein  29.35 
 
 		 291 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.034124  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2574  hypothetical protein  32.2 
 
 		 291 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0448816 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0783  domain of unknown function DUF1732  32.32 
 
 		 291 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000478658  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3632  hypothetical protein  32.21 
 
 		 293 aa  139  3.9999999999999997e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.101055 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2320  hypothetical protein  29.79 
 
 		 292 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000274769  hitchhiker  0.00243432 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2693  hypothetical protein  29.69 
 
 		 291 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1763  hypothetical protein  33.9 
 
 		 290 aa  139  6e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0407  hypothetical protein  31.53 
 
 		 295 aa  139  7e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.122152  normal  0.436876 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1033  domain of unknown function DUF1732  30.74 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1284  hypothetical protein  31.54 
 
 		 292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00734721  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2788  hypothetical protein  29.35 
 
 		 291 aa  135  8e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1316  domain of unknown function DUF1732  29.19 
 
 		 292 aa  135  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2881  hypothetical protein  31.51 
 
 		 292 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000426445  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3214  hypothetical protein  30.61 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000193402  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1488  domain of unknown function DUF1732  31.07 
 
 		 291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.283341 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1793  hypothetical protein  30.07 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1049  hypothetical protein  30.82 
 
 		 292 aa  133  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120663 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2003  hypothetical protein  30.3 
 
 		 294 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1721  hypothetical protein  29.35 
 
 		 294 aa  130  3e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0296  hypothetical protein  31.23 
 
 		 293 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0838  YicC domain protein  29.35 
 
 		 293 aa  129  8.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.422723  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2690  hypothetical protein  28.87 
 
 		 290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.886781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1327  protein of unknown function DUF1732  30.8 
 
 		 291 aa  126  4.0000000000000003e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0133754  normal  0.451646 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1140  hypothetical protein  32.09 
 
 		 293 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1086  hypothetical protein  31.62 
 
 		 288 aa  125  9e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2900  hypothetical protein  29.19 
 
 		 293 aa  124  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0250  hypothetical protein  28.76 
 
 		 295 aa  123  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000288973  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2051  YicC domain protein  29.49 
 
 		 293 aa  120  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.974794  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0562  yicC family protein  28.99 
 
 		 287 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0716  domain of unknown function DUF1732  28.99 
 
 		 287 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.637431  hitchhiker  0.00000131074 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1404  hypothetical protein  29.47 
 
 		 293 aa  118  9e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3026  hypothetical protein  27.99 
 
 		 289 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.439015  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2959  hypothetical protein  28.38 
 
 		 288 aa  116  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0956  hypothetical protein  28.86 
 
 		 288 aa  117  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.253768  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2086  hypothetical protein  31.08 
 
 		 293 aa  117  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0249545 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0098  hypothetical protein  30.3 
 
 		 294 aa  116  5e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.547485  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1469  domain of unknown function DUF1732  31.13 
 
 		 287 aa  116  5e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000162947  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1291  hypothetical protein  30.98 
 
 		 294 aa  114  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0178  hypothetical protein  28.81 
 
 		 287 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.952539  hitchhiker  0.0000731437 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5843  domain of unknown function DUF1732  26.97 
 
 		 326 aa  113  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.534035 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3135  hypothetical protein  26.69 
 
 		 310 aa  113  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.338294 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00647  hypothetical protein  29.45 
 
 		 288 aa  113  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1679  hypothetical protein  30.95 
 
 		 291 aa  113  4.0000000000000004e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.699908  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3652  hypothetical protein  28.28 
 
 		 287 aa  112  5e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0904  hypothetical protein  29.06 
 
 		 315 aa  112  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.064706  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0076  hypothetical protein  28.23 
 
 		 287 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5295  hypothetical protein  27.89 
 
 		 287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10654  normal  0.478685 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3996  hypothetical protein  26.82 
 
 		 287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2475  domain of unknown function DUF1732  30.27 
 
 		 287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2721  hypothetical protein  32.21 
 
 		 293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.151584  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001828  protein YicC  29.39 
 
 		 288 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.172185  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2445  hypothetical protein  28.96 
 
 		 288 aa  109  5e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465243 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0212  hypothetical protein  29 
 
 		 287 aa  109  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5203  hypothetical protein  28.28 
 
 		 287 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.208712 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3194  hypothetical protein  27.46 
 
 		 291 aa  109  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0395546 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0406  hypothetical protein  27.65 
 
 		 287 aa  109  7.000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.71757  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4387  hypothetical protein  27.7 
 
 		 287 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.113802 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>