242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1284 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1284  hypothetical protein  100 
 
 
292 aa  598  1e-170  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00734721  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2328  hypothetical protein  48.63 
 
 
292 aa  265  5.999999999999999e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0372766  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2287  hypothetical protein  46.23 
 
 
291 aa  260  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3163  hypothetical protein  45.21 
 
 
292 aa  254  9e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0449219  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2239  hypothetical protein  46.92 
 
 
292 aa  249  4e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2402  hypothetical protein  44.71 
 
 
293 aa  248  7e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0682346  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3214  hypothetical protein  46.42 
 
 
292 aa  246  3e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000193402  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1049  hypothetical protein  46.08 
 
 
292 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120663 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1317  hypothetical protein  41.5 
 
 
294 aa  239  5e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.269981  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1793  hypothetical protein  39.25 
 
 
293 aa  235  6e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3972  hypothetical protein  40.75 
 
 
291 aa  229  4e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00569731  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1271  hypothetical protein  40.75 
 
 
291 aa  228  7e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00975001  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3916  hypothetical protein  40.75 
 
 
291 aa  228  9e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3887  hypothetical protein  40.75 
 
 
291 aa  228  9e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000222822 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3724  hypothetical protein  40.75 
 
 
291 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3614  hypothetical protein  40.75 
 
 
291 aa  228  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3632  hypothetical protein  40.75 
 
 
291 aa  228  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4011  hypothetical protein  40.75 
 
 
291 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2607  hypothetical protein  42.12 
 
 
291 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.034124  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3921  hypothetical protein  40.75 
 
 
291 aa  226  3e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.831608  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3696  hypothetical protein  40.41 
 
 
291 aa  224  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2003  hypothetical protein  40.82 
 
 
294 aa  223  2e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1721  hypothetical protein  40.48 
 
 
294 aa  222  4.9999999999999996e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2693  hypothetical protein  42.47 
 
 
291 aa  219  5e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0890  hypothetical protein  40.07 
 
 
292 aa  216  4e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000147276  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2320  hypothetical protein  38.7 
 
 
292 aa  215  5.9999999999999996e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000274769  hitchhiker  0.00243432 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2788  hypothetical protein  42.12 
 
 
291 aa  215  7e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2525  hypothetical protein  38.7 
 
 
291 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2574  hypothetical protein  42.81 
 
 
291 aa  212  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0448816 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1698  hypothetical protein  41.64 
 
 
292 aa  211  7.999999999999999e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.466508  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1599  hypothetical protein  38.36 
 
 
292 aa  206  3e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000017463  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2881  hypothetical protein  36.99 
 
 
292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000426445  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1056  hypothetical protein  38.01 
 
 
291 aa  194  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000165495  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3896  hypothetical protein  38.01 
 
 
289 aa  194  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000579804  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3632  hypothetical protein  40.33 
 
 
293 aa  193  3e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.101055 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0011  YicC domain protein  35.96 
 
 
292 aa  192  5e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.272506  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1033  domain of unknown function DUF1732  34.81 
 
 
293 aa  192  5e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1763  hypothetical protein  34.93 
 
 
290 aa  192  8e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1239  hypothetical protein  35.62 
 
 
292 aa  186  5e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.369152  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0838  YicC domain protein  36.43 
 
 
293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.422723  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1327  protein of unknown function DUF1732  33.22 
 
 
291 aa  181  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0133754  normal  0.451646 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2051  YicC domain protein  36.73 
 
 
293 aa  175  8e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.974794  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1946  hypothetical protein  37.33 
 
 
291 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1316  domain of unknown function DUF1732  37.29 
 
 
292 aa  172  5e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1912  hypothetical protein  35.25 
 
 
294 aa  171  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0397702  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2690  hypothetical protein  35.03 
 
 
290 aa  169  5e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.886781  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3026  hypothetical protein  34.69 
 
 
289 aa  167  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.439015  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2959  hypothetical protein  35.62 
 
 
288 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1488  domain of unknown function DUF1732  34.78 
 
 
291 aa  161  1e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.283341 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0296  hypothetical protein  35.35 
 
 
293 aa  160  2e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5843  domain of unknown function DUF1732  33.74 
 
 
326 aa  160  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.534035 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2900  hypothetical protein  33.33 
 
 
293 aa  159  6e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0956  hypothetical protein  33.78 
 
 
288 aa  157  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.253768  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0305  hypothetical protein  35.45 
 
 
295 aa  156  3e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000735483  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1774  hypothetical protein  36.03 
 
 
295 aa  155  1e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.593354  normal  0.167904 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2475  domain of unknown function DUF1732  34.11 
 
 
287 aa  153  4e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3780  hypothetical protein  30.87 
 
 
296 aa  152  5.9999999999999996e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.370784 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0783  domain of unknown function DUF1732  35.22 
 
 
291 aa  151  1e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000478658  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0319  hypothetical protein  33.11 
 
 
309 aa  151  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1457  hypothetical protein  34.34 
 
 
295 aa  149  5e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000500736  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2445  hypothetical protein  34.8 
 
 
288 aa  149  7e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.465243 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1993  hypothetical protein  30.03 
 
 
288 aa  147  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1988  hypothetical protein  30.14 
 
 
288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0549  hypothetical protein  30.72 
 
 
289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.829174  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0407  hypothetical protein  31.19 
 
 
295 aa  146  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.122152  normal  0.436876 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1404  hypothetical protein  34.8 
 
 
293 aa  145  6e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4021  hypothetical protein  32.33 
 
 
288 aa  145  9e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0322  domain of unknown function DUF1732  32 
 
 
295 aa  144  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.563369 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1469  domain of unknown function DUF1732  33.22 
 
 
287 aa  144  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000162947  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4196  hypothetical protein  32.66 
 
 
287 aa  143  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0846841  normal  0.629685 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3480  hypothetical protein  34.58 
 
 
295 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0046  hypothetical protein  30.38 
 
 
288 aa  143  4e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0855  hypothetical protein  30.99 
 
 
311 aa  142  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0417  hypothetical protein  31.46 
 
 
295 aa  142  9e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0380  hypothetical protein  32.19 
 
 
287 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0367  hypothetical protein  32.19 
 
 
287 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3996  hypothetical protein  31.77 
 
 
287 aa  141  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0403  hypothetical protein  34.54 
 
 
295 aa  141  9.999999999999999e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0196247  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3684  hypothetical protein  30.82 
 
 
288 aa  141  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0517661 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0369  hypothetical protein  32.19 
 
 
287 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2167  hypothetical protein  31.29 
 
 
284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0455  hypothetical protein  32.19 
 
 
287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0394  hypothetical protein  32.19 
 
 
287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000359441 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0212  hypothetical protein  32.23 
 
 
287 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70430  hypothetical protein  31.19 
 
 
287 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0676  hypothetical protein  32.54 
 
 
291 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.106933  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2304  hypothetical protein  34.12 
 
 
295 aa  139  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00318843  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1631  hypothetical protein  30.64 
 
 
292 aa  139  6e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.176002 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0076  hypothetical protein  32.01 
 
 
287 aa  139  7e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3269  hypothetical protein  33.78 
 
 
286 aa  139  7e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2474  hypothetical protein  30.99 
 
 
311 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0048  hypothetical protein  30.85 
 
 
287 aa  138  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6111  hypothetical protein  30.85 
 
 
287 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4387  hypothetical protein  29.79 
 
 
287 aa  137  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.113802 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3778  hypothetical protein  31.51 
 
 
287 aa  137  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0055  hypothetical protein  30.85 
 
 
287 aa  138  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.926553  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4848  hypothetical protein  31.1 
 
 
287 aa  137  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0744075  hitchhiker  0.0000405788 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0095  hypothetical protein  30.17 
 
 
287 aa  137  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.403752  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1086  hypothetical protein  29.55 
 
 
288 aa  137  2e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0716  domain of unknown function DUF1732  29.79 
 
 
287 aa  137  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.637431  hitchhiker  0.00000131074 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>