242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1239 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1239  hypothetical protein  100 
 
 		 292 aa  582  1.0000000000000001e-165  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.369152  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1698  hypothetical protein  46.92 
 
 		 292 aa  265  8e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.466508  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1317  hypothetical protein  45.24 
 
 		 294 aa  259  3e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.269981  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0890  hypothetical protein  46.58 
 
 		 292 aa  256  3e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000147276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2320  hypothetical protein  44.18 
 
 		 292 aa  256  4e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000274769  hitchhiker  0.00243432 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3896  hypothetical protein  46.02 
 
 		 289 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000579804  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1793  hypothetical protein  43 
 
 		 293 aa  241  7e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1599  hypothetical protein  39.38 
 
 		 292 aa  226  4e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000017463  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1721  hypothetical protein  42.37 
 
 		 294 aa  222  4.9999999999999996e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3921  hypothetical protein  43.49 
 
 		 291 aa  221  9e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.831608  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3696  hypothetical protein  43.49 
 
 		 291 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2003  hypothetical protein  42.03 
 
 		 294 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1271  hypothetical protein  43.15 
 
 		 291 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00975001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2881  hypothetical protein  39.38 
 
 		 292 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000426445  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3972  hypothetical protein  43.15 
 
 		 291 aa  220  3e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00569731  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2525  hypothetical protein  42.81 
 
 		 291 aa  219  3e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3916  hypothetical protein  43.15 
 
 		 291 aa  219  6e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3887  hypothetical protein  43.15 
 
 		 291 aa  219  6e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000222822 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1327  protein of unknown function DUF1732  39.79 
 
 		 291 aa  218  7e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0133754  normal  0.451646 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3724  hypothetical protein  43.15 
 
 		 291 aa  218  7e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3614  hypothetical protein  43.15 
 
 		 291 aa  218  7e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3632  hypothetical protein  43.15 
 
 		 291 aa  218  7e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4011  hypothetical protein  43.15 
 
 		 291 aa  218  7e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1763  hypothetical protein  42.47 
 
 		 290 aa  215  7e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2239  hypothetical protein  39.12 
 
 		 292 aa  207  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1056  hypothetical protein  42.47 
 
 		 291 aa  207  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000165495  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0011  YicC domain protein  38.7 
 
 		 292 aa  203  3e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.272506  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2328  hypothetical protein  35.96 
 
 		 292 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0372766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2607  hypothetical protein  36.64 
 
 		 291 aa  200  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.034124  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3632  hypothetical protein  38.91 
 
 		 293 aa  199  5e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.101055 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3163  hypothetical protein  36.3 
 
 		 292 aa  199  6e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0449219  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1049  hypothetical protein  37.71 
 
 		 292 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120663 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1946  hypothetical protein  39.73 
 
 		 291 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2287  hypothetical protein  36.64 
 
 		 291 aa  194  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3214  hypothetical protein  37.16 
 
 		 292 aa  192  6e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000193402  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2788  hypothetical protein  36.99 
 
 		 291 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2693  hypothetical protein  36.99 
 
 		 291 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2402  hypothetical protein  34.47 
 
 		 293 aa  189  4e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0682346  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1033  domain of unknown function DUF1732  37 
 
 		 293 aa  188  8e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1284  hypothetical protein  35.62 
 
 		 292 aa  186  5e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00734721  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2574  hypothetical protein  38.01 
 
 		 291 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0448816 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0838  YicC domain protein  36.64 
 
 		 293 aa  181  1e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.422723  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1488  domain of unknown function DUF1732  35.76 
 
 		 291 aa  178  9e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.283341 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1316  domain of unknown function DUF1732  36.52 
 
 		 292 aa  177  3e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2690  hypothetical protein  34.87 
 
 		 290 aa  176  4e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.886781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1912  hypothetical protein  34.47 
 
 		 294 aa  171  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0397702  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4196  hypothetical protein  34.84 
 
 		 287 aa  165  8e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0846841  normal  0.629685 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0407  hypothetical protein  34.33 
 
 		 295 aa  165  9e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.122152  normal  0.436876 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0417  hypothetical protein  32.33 
 
 		 295 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3780  hypothetical protein  33.44 
 
 		 296 aa  160  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.370784 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0676  hypothetical protein  33.9 
 
 		 291 aa  159  7e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.106933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2900  hypothetical protein  33.78 
 
 		 293 aa  158  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2086  hypothetical protein  34.44 
 
 		 293 aa  157  2e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0249545 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1086  hypothetical protein  36.36 
 
 		 288 aa  156  4e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1774  hypothetical protein  34.11 
 
 		 295 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.593354  normal  0.167904 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0549  hypothetical protein  33.45 
 
 		 289 aa  156  5.0000000000000005e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.829174  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1404  hypothetical protein  34.8 
 
 		 293 aa  155  8e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2445  hypothetical protein  32.88 
 
 		 288 aa  155  9e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465243 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2959  hypothetical protein  32.2 
 
 		 288 aa  154  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5843  domain of unknown function DUF1732  30.58 
 
 		 326 aa  154  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.534035 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0322  domain of unknown function DUF1732  33.22 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.563369 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0987  hypothetical protein  32.42 
 
 		 292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00101858  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0305  hypothetical protein  34.65 
 
 		 295 aa  153  4e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000735483  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0372  hypothetical protein  35.43 
 
 		 291 aa  150  2e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.816164  normal  0.284607 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0296  hypothetical protein  31.29 
 
 		 293 aa  150  3e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2051  YicC domain protein  32.2 
 
 		 293 aa  150  3e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.974794  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3837  hypothetical protein  31.53 
 
 		 287 aa  149  4e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1457  hypothetical protein  32.44 
 
 		 295 aa  149  7e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000500736  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0403  hypothetical protein  33 
 
 		 295 aa  149  7e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0196247  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2721  hypothetical protein  33 
 
 		 293 aa  149  8e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.151584  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0138  hypothetical protein  33.33 
 
 		 293 aa  148  9e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0296876 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3684  hypothetical protein  32.53 
 
 		 288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0517661 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0956  hypothetical protein  32.19 
 
 		 288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.253768  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70430  hypothetical protein  31.85 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6111  hypothetical protein  31.85 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1291  hypothetical protein  32.66 
 
 		 294 aa  147  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0178  hypothetical protein  32.43 
 
 		 287 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.952539  hitchhiker  0.0000731437 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1143  hypothetical protein  31.74 
 
 		 292 aa  145  6e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.37182  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0374  hypothetical protein  32.78 
 
 		 300 aa  145  6e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00280201  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0318  hypothetical protein  31.19 
 
 		 287 aa  145  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4848  hypothetical protein  32.21 
 
 		 287 aa  145  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0744075  hitchhiker  0.0000405788 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04050  hypothetical protein  32.19 
 
 		 287 aa  144  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0377  hypothetical protein  32.54 
 
 		 287 aa  144  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000623436 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4387  hypothetical protein  30.95 
 
 		 287 aa  143  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.113802 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1679  hypothetical protein  33.33 
 
 		 291 aa  143  4e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.699908  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3778  hypothetical protein  31.86 
 
 		 287 aa  142  5e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3605  hypothetical protein  31.86 
 
 		 287 aa  142  6e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001828  protein YicC  32.19 
 
 		 288 aa  142  7e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.172185  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0101  hypothetical protein  32.88 
 
 		 290 aa  142  7e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0157028  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3026  hypothetical protein  32.66 
 
 		 289 aa  142  8e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.439015  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0351  hypothetical protein  31.86 
 
 		 287 aa  142  8e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5295  hypothetical protein  32.09 
 
 		 287 aa  142  9e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10654  normal  0.478685 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4362  hypothetical protein  31.74 
 
 		 288 aa  141  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.637906  normal  0.0170975 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0076  hypothetical protein  31.31 
 
 		 287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0048  hypothetical protein  31.88 
 
 		 287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5203  hypothetical protein  32.09 
 
 		 287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.208712 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2167  hypothetical protein  33.56 
 
 		 284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0380  hypothetical protein  31.19 
 
 		 287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0367  hypothetical protein  31.19 
 
 		 287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0369  hypothetical protein  31.19 
 
 		 287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>