242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1086 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1086  hypothetical protein  100 
 
 
288 aa  586  1e-166  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1033  domain of unknown function DUF1732  35.62 
 
 
293 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1049  hypothetical protein  32.53 
 
 
292 aa  160  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120663 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2003  hypothetical protein  36.15 
 
 
294 aa  156  3e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1239  hypothetical protein  36.36 
 
 
292 aa  156  4e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.369152  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2287  hypothetical protein  32.32 
 
 
291 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2607  hypothetical protein  30.69 
 
 
291 aa  155  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.034124  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1721  hypothetical protein  35.81 
 
 
294 aa  155  8e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3214  hypothetical protein  32.19 
 
 
292 aa  155  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000193402  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2320  hypothetical protein  34.01 
 
 
292 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000274769  hitchhiker  0.00243432 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3921  hypothetical protein  30.8 
 
 
291 aa  153  4e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.831608  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2525  hypothetical protein  31.49 
 
 
291 aa  153  4e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3163  hypothetical protein  32.42 
 
 
292 aa  152  5e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0449219  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3696  hypothetical protein  30.69 
 
 
291 aa  152  8e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1271  hypothetical protein  31.38 
 
 
291 aa  151  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00975001  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3916  hypothetical protein  30.8 
 
 
291 aa  151  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2402  hypothetical protein  30.82 
 
 
293 aa  151  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0682346  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3887  hypothetical protein  30.8 
 
 
291 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000222822 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3724  hypothetical protein  30.8 
 
 
291 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3614  hypothetical protein  30.8 
 
 
291 aa  151  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3632  hypothetical protein  30.8 
 
 
291 aa  151  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4011  hypothetical protein  30.8 
 
 
291 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2788  hypothetical protein  30.69 
 
 
291 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3972  hypothetical protein  31.03 
 
 
291 aa  150  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00569731  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2693  hypothetical protein  30.69 
 
 
291 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1317  hypothetical protein  32.65 
 
 
294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.269981  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3896  hypothetical protein  32.53 
 
 
289 aa  147  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000579804  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3848  hypothetical protein  32.3 
 
 
288 aa  146  5e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0838  YicC domain protein  31.99 
 
 
293 aa  145  6e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.422723  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2445  hypothetical protein  32.65 
 
 
288 aa  145  8.000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.465243 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0890  hypothetical protein  31.19 
 
 
292 aa  144  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000147276  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2574  hypothetical protein  31.03 
 
 
291 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0448816 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04050  hypothetical protein  34.13 
 
 
287 aa  142  4e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2239  hypothetical protein  32.88 
 
 
292 aa  142  5e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1793  hypothetical protein  32.19 
 
 
293 aa  142  9e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3684  hypothetical protein  31.85 
 
 
288 aa  141  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0517661 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1698  hypothetical protein  33.68 
 
 
292 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.466508  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2959  hypothetical protein  30.03 
 
 
288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1056  hypothetical protein  29.86 
 
 
291 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000165495  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0319  hypothetical protein  32.4 
 
 
309 aa  139  7e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4257  hypothetical protein  31.83 
 
 
287 aa  137  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1284  hypothetical protein  29.55 
 
 
292 aa  137  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00734721  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2328  hypothetical protein  29.9 
 
 
292 aa  137  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0372766  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3605  hypothetical protein  32.18 
 
 
287 aa  137  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2881  hypothetical protein  31.97 
 
 
292 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000426445  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1585  hypothetical protein  31.92 
 
 
307 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438079  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0380  hypothetical protein  31.49 
 
 
287 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0367  hypothetical protein  31.49 
 
 
287 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0394  hypothetical protein  31.49 
 
 
287 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000359441 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0369  hypothetical protein  31.49 
 
 
287 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2097  hypothetical protein  31.49 
 
 
307 aa  136  4e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3050  hypothetical protein  31.49 
 
 
307 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0814  hypothetical protein  31.49 
 
 
307 aa  136  4e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.506209  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2647  hypothetical protein  31.49 
 
 
307 aa  136  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2950  hypothetical protein  31.49 
 
 
307 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.2121  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3016  hypothetical protein  31.49 
 
 
307 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.2767  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1965  hypothetical protein  31.49 
 
 
307 aa  136  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.725996  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1763  hypothetical protein  34.25 
 
 
290 aa  136  5e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0455  hypothetical protein  31.14 
 
 
287 aa  135  5e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3778  hypothetical protein  31.83 
 
 
287 aa  135  5e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2055  hypothetical protein  29.79 
 
 
287 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000329302  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1316  domain of unknown function DUF1732  28.52 
 
 
292 aa  135  7.000000000000001e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1912  hypothetical protein  30.98 
 
 
294 aa  135  9e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0397702  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2402  hypothetical protein  31.82 
 
 
336 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0351  hypothetical protein  32.3 
 
 
287 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0716  domain of unknown function DUF1732  29.35 
 
 
287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.637431  hitchhiker  0.00000131074 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0958  hypothetical protein  31.49 
 
 
307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.430374  normal  0.462725 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4387  hypothetical protein  30.34 
 
 
287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.113802 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0519  hypothetical protein  31.49 
 
 
327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0998  hypothetical protein  31.49 
 
 
327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0562  yicC family protein  29.35 
 
 
287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3489  hypothetical protein  31.49 
 
 
287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4106  hypothetical protein  31.49 
 
 
307 aa  133  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0456946  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1599  hypothetical protein  30.58 
 
 
292 aa  133  3e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000017463  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3837  hypothetical protein  30.8 
 
 
287 aa  132  5e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1327  protein of unknown function DUF1732  33.67 
 
 
291 aa  132  6e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0133754  normal  0.451646 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2900  hypothetical protein  30.48 
 
 
293 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02195  hypothetical protein  32.4 
 
 
281 aa  132  6.999999999999999e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4283  hypothetical protein  32.41 
 
 
290 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3780  hypothetical protein  30.87 
 
 
296 aa  132  7.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.370784 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2474  hypothetical protein  28.66 
 
 
311 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0178  hypothetical protein  30.69 
 
 
287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.952539  hitchhiker  0.0000731437 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0870  hypothetical protein  31.49 
 
 
307 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2920  hypothetical protein  31.65 
 
 
296 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3845  hypothetical protein  30.8 
 
 
287 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5203  hypothetical protein  30.34 
 
 
287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.208712 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0858  hypothetical protein  31.49 
 
 
307 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1564  hypothetical protein  31.65 
 
 
296 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.329203  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1103  hypothetical protein  31.99 
 
 
296 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0116911 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3086  hypothetical protein  31.85 
 
 
307 aa  130  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.966658  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0377  hypothetical protein  31.49 
 
 
287 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000623436 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0318  hypothetical protein  31.03 
 
 
287 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0065  hypothetical protein  30.9 
 
 
297 aa  129  6e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1448  hypothetical protein  29.37 
 
 
302 aa  129  6e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0364721  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5295  hypothetical protein  30 
 
 
287 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10654  normal  0.478685 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0250  hypothetical protein  29.87 
 
 
295 aa  129  8.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000288973  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2277  hypothetical protein  30.99 
 
 
311 aa  128  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.268275  normal  0.722803 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2721  hypothetical protein  30.84 
 
 
293 aa  128  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.151584  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3207  hypothetical protein  29.45 
 
 
287 aa  128  9.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0904  hypothetical protein  30.94 
 
 
315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.064706  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>