242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2277 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2277  hypothetical protein  100 
 
 		 311 aa  622  1e-177  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.268275  normal  0.722803 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1957  hypothetical protein  98.39 
 
 		 311 aa  611  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.330049 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2156  hypothetical protein  90.03 
 
 		 311 aa  560  1e-158  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00239599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2474  hypothetical protein  77.17 
 
 		 311 aa  488  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0855  hypothetical protein  76.53 
 
 		 311 aa  485  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2402  hypothetical protein  65.06 
 
 		 336 aa  391  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0958  hypothetical protein  65.06 
 
 		 307 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.430374  normal  0.462725 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0870  hypothetical protein  65.06 
 
 		 307 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0668  hypothetical protein  63.78 
 
 		 319 aa  390  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4106  hypothetical protein  64.42 
 
 		 307 aa  389  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0456946  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0519  hypothetical protein  65.06 
 
 		 327 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0858  hypothetical protein  65.06 
 
 		 307 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0998  hypothetical protein  65.06 
 
 		 327 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2097  hypothetical protein  64.74 
 
 		 307 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3050  hypothetical protein  64.74 
 
 		 307 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1585  hypothetical protein  64.74 
 
 		 307 aa  385  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438079  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0814  hypothetical protein  64.74 
 
 		 307 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.506209  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2647  hypothetical protein  64.74 
 
 		 307 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2950  hypothetical protein  64.74 
 
 		 307 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.2121  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3016  hypothetical protein  64.74 
 
 		 307 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.2767  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1965  hypothetical protein  64.74 
 
 		 307 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.725996  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0904  hypothetical protein  61.86 
 
 		 315 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.064706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3086  hypothetical protein  61.22 
 
 		 307 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.966658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0065  hypothetical protein  45.48 
 
 		 297 aa  259  4e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3848  hypothetical protein  45.66 
 
 		 288 aa  251  1e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4021  hypothetical protein  45.02 
 
 		 288 aa  249  5e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1079  hypothetical protein  48.59 
 
 		 309 aa  248  8e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0046  hypothetical protein  42.77 
 
 		 288 aa  242  6e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0474  hypothetical protein  44.69 
 
 		 288 aa  241  1e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0812  hypothetical protein  42.77 
 
 		 305 aa  235  7e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2029  hypothetical protein  43.93 
 
 		 302 aa  231  9e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.978666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1336  hypothetical protein  44.55 
 
 		 323 aa  226  3e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.560202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1626  hypothetical protein  41.59 
 
 		 305 aa  225  6e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.117242  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0708  hypothetical protein  44.37 
 
 		 302 aa  224  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.736832 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3582  hypothetical protein  42.9 
 
 		 303 aa  223  3e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0102309  normal  0.126925 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0861  hypothetical protein  42.9 
 
 		 302 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4328  hypothetical protein  43.13 
 
 		 304 aa  221  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4159  hypothetical protein  42.99 
 
 		 305 aa  220  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.401286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0926  hypothetical protein  42.58 
 
 		 302 aa  220  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171761 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2708  hypothetical protein  44.79 
 
 		 307 aa  220  3e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3837  hypothetical protein  40.19 
 
 		 287 aa  216  5e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04050  hypothetical protein  39.62 
 
 		 287 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0318  hypothetical protein  40.84 
 
 		 287 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3845  hypothetical protein  39.87 
 
 		 287 aa  210  2e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0319  hypothetical protein  41.59 
 
 		 309 aa  211  2e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0455  hypothetical protein  41.03 
 
 		 287 aa  209  3e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3489  hypothetical protein  39.87 
 
 		 287 aa  209  5e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0380  hypothetical protein  40.19 
 
 		 287 aa  209  6e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0367  hypothetical protein  40.19 
 
 		 287 aa  209  6e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0369  hypothetical protein  40.19 
 
 		 287 aa  209  6e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0394  hypothetical protein  40.19 
 
 		 287 aa  209  7e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000359441 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4257  hypothetical protein  39.87 
 
 		 287 aa  207  2e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001828  protein YicC  37.62 
 
 		 288 aa  207  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.172185  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0377  hypothetical protein  39.55 
 
 		 287 aa  207  3e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000623436 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3605  hypothetical protein  41.08 
 
 		 287 aa  206  4e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3778  hypothetical protein  39.87 
 
 		 287 aa  205  8e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00647  hypothetical protein  36.98 
 
 		 288 aa  205  9e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0351  hypothetical protein  39.55 
 
 		 287 aa  203  3e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4283  hypothetical protein  37.5 
 
 		 290 aa  202  9e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3684  hypothetical protein  39.55 
 
 		 288 aa  201  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0517661 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2588  hypothetical protein  35.9 
 
 		 288 aa  200  1.9999999999999998e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4569  hypothetical protein  40.19 
 
 		 287 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000202204 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1293  hypothetical protein  38.29 
 
 		 287 aa  199  3e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0107  hypothetical protein  37.3 
 
 		 287 aa  199  3.9999999999999996e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4848  hypothetical protein  37.94 
 
 		 287 aa  199  5e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0744075  hitchhiker  0.0000405788 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0208  hypothetical protein  35.58 
 
 		 287 aa  197  1.0000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0095  hypothetical protein  38.26 
 
 		 287 aa  198  1.0000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.403752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0048  hypothetical protein  37.94 
 
 		 287 aa  196  4.0000000000000005e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0055  hypothetical protein  37.94 
 
 		 287 aa  196  4.0000000000000005e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.926553  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4161  hypothetical protein  37.94 
 
 		 287 aa  196  5.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.226862  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3996  hypothetical protein  37.94 
 
 		 287 aa  191  9e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6111  hypothetical protein  39.55 
 
 		 287 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70430  hypothetical protein  39.55 
 
 		 287 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0061  YicC domain protein  37.62 
 
 		 287 aa  189  7e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03501  hypothetical protein  37.62 
 
 		 287 aa  189  8e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.137526  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3853  hypothetical protein  37.62 
 
 		 287 aa  189  8e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.349633  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0067  hypothetical protein  37.62 
 
 		 287 aa  189  8e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0211389  hitchhiker  0.00000185241 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5014  hypothetical protein  37.62 
 
 		 287 aa  189  8e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4145  hypothetical protein  37.62 
 
 		 287 aa  189  8e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0120633  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4405  hypothetical protein  36.33 
 
 		 287 aa  187  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4069  hypothetical protein  37.62 
 
 		 287 aa  188  1e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.105197  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4122  hypothetical protein  37.3 
 
 		 287 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.970694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3652  hypothetical protein  34.29 
 
 		 287 aa  187  1e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4061  hypothetical protein  37.3 
 
 		 287 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.879365 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3934  hypothetical protein  37.3 
 
 		 287 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.818058  hitchhiker  0.00001038 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4015  hypothetical protein  37.3 
 
 		 287 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3952  hypothetical protein  37.3 
 
 		 287 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0844  hypothetical protein  36.66 
 
 		 300 aa  187  3e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0757  hypothetical protein  36.98 
 
 		 300 aa  186  4e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03453  hypothetical protein  37.42 
 
 		 285 aa  186  4e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.123292  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3979  hypothetical protein  37.3 
 
 		 287 aa  186  4e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.200033  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4116  hypothetical protein  36.33 
 
 		 287 aa  186  5e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.124592  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0956  hypothetical protein  38.02 
 
 		 288 aa  186  6e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.253768  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0131  hypothetical protein  36.54 
 
 		 287 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4362  hypothetical protein  36.01 
 
 		 288 aa  179  4.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.637906  normal  0.0170975 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4387  hypothetical protein  38.26 
 
 		 287 aa  178  8e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.113802 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0212  hypothetical protein  37.62 
 
 		 287 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5203  hypothetical protein  37.94 
 
 		 287 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.208712 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0975  hypothetical protein  38.61 
 
 		 293 aa  178  1e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.538355  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5548  hypothetical protein  38.26 
 
 		 287 aa  177  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.395212 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>