242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2721 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2721  hypothetical protein  100 
 
 
293 aa  594  1e-169  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.151584  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2086  hypothetical protein  65.53 
 
 
293 aa  376  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0249545 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1140  hypothetical protein  64.85 
 
 
293 aa  360  1e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1404  hypothetical protein  59.39 
 
 
293 aa  353  1e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2900  hypothetical protein  44.71 
 
 
293 aa  263  2e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0296  hypothetical protein  44.37 
 
 
293 aa  261  8.999999999999999e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0011  YicC domain protein  36.73 
 
 
292 aa  162  7e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.272506  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2690  hypothetical protein  34.12 
 
 
290 aa  160  3e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.886781  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0890  hypothetical protein  38.78 
 
 
292 aa  160  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000147276  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1599  hypothetical protein  34.69 
 
 
292 aa  157  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000017463  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2402  hypothetical protein  33.9 
 
 
293 aa  154  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0682346  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2881  hypothetical protein  32.77 
 
 
292 aa  154  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000426445  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1317  hypothetical protein  33.89 
 
 
294 aa  152  5.9999999999999996e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.269981  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3632  hypothetical protein  34.23 
 
 
291 aa  151  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1271  hypothetical protein  34.11 
 
 
291 aa  150  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00975001  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3972  hypothetical protein  33.77 
 
 
291 aa  149  7e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00569731  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1239  hypothetical protein  33 
 
 
292 aa  149  8e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.369152  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3916  hypothetical protein  33.89 
 
 
291 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3887  hypothetical protein  33.89 
 
 
291 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000222822 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0406  hypothetical protein  35.47 
 
 
287 aa  147  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.71757  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3921  hypothetical protein  33.89 
 
 
291 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.831608  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3724  hypothetical protein  33.89 
 
 
291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3614  hypothetical protein  33.89 
 
 
291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4011  hypothetical protein  33.89 
 
 
291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2607  hypothetical protein  33 
 
 
291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.034124  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1763  hypothetical protein  30.39 
 
 
290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3632  hypothetical protein  34.58 
 
 
293 aa  146  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.101055 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1912  hypothetical protein  34.11 
 
 
294 aa  145  9e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0397702  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1781  hypothetical protein  35.14 
 
 
287 aa  144  2e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.843974  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2525  hypothetical protein  32.56 
 
 
291 aa  144  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0319  hypothetical protein  33.9 
 
 
309 aa  144  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2959  hypothetical protein  33.89 
 
 
288 aa  143  3e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3696  hypothetical protein  32.45 
 
 
291 aa  143  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1698  hypothetical protein  33.45 
 
 
292 aa  143  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.466508  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2328  hypothetical protein  32.66 
 
 
292 aa  143  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0372766  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0783  domain of unknown function DUF1732  33.33 
 
 
291 aa  143  4e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000478658  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0838  YicC domain protein  32.89 
 
 
293 aa  142  5e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.422723  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2239  hypothetical protein  33.67 
 
 
292 aa  142  8e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2051  YicC domain protein  32.78 
 
 
293 aa  141  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.974794  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2287  hypothetical protein  30.61 
 
 
291 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02195  hypothetical protein  32.53 
 
 
281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1033  domain of unknown function DUF1732  30.54 
 
 
293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3489  hypothetical protein  32.31 
 
 
287 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0549  hypothetical protein  33.44 
 
 
289 aa  139  4.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.829174  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3652  hypothetical protein  31.97 
 
 
287 aa  139  7.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3845  hypothetical protein  32.54 
 
 
287 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04050  hypothetical protein  32.31 
 
 
287 aa  137  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2788  hypothetical protein  33 
 
 
291 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1528  hypothetical protein  33.78 
 
 
294 aa  138  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.214783  normal  0.106302 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1284  hypothetical protein  31.76 
 
 
292 aa  137  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00734721  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3896  hypothetical protein  32.41 
 
 
289 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000579804  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3163  hypothetical protein  31.1 
 
 
292 aa  137  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0449219  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2693  hypothetical protein  33 
 
 
291 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0455  hypothetical protein  32.65 
 
 
287 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1488  domain of unknown function DUF1732  33.78 
 
 
291 aa  135  6.0000000000000005e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.283341 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0065  hypothetical protein  33.11 
 
 
297 aa  135  7.000000000000001e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0394  hypothetical protein  32.31 
 
 
287 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000359441 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1793  hypothetical protein  31.99 
 
 
293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0377  hypothetical protein  31.63 
 
 
287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000623436 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2320  hypothetical protein  32.34 
 
 
292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000274769  hitchhiker  0.00243432 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1448  hypothetical protein  32.44 
 
 
302 aa  133  3e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0364721  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0367  hypothetical protein  32.12 
 
 
287 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2475  domain of unknown function DUF1732  33.22 
 
 
287 aa  133  3e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2574  hypothetical protein  33.78 
 
 
291 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0448816 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0369  hypothetical protein  32.12 
 
 
287 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0380  hypothetical protein  32.12 
 
 
287 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3026  hypothetical protein  33.56 
 
 
289 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.439015  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1327  protein of unknown function DUF1732  29.01 
 
 
291 aa  133  3.9999999999999996e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0133754  normal  0.451646 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0351  hypothetical protein  31.4 
 
 
287 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0676  hypothetical protein  32.31 
 
 
291 aa  132  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.106933  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0318  hypothetical protein  32.23 
 
 
287 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5295  hypothetical protein  32.44 
 
 
287 aa  132  9e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10654  normal  0.478685 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1049  hypothetical protein  30.77 
 
 
292 aa  132  9e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120663 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5203  hypothetical protein  32.55 
 
 
287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.208712 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3214  hypothetical protein  30.43 
 
 
292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000193402  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1293  hypothetical protein  30.74 
 
 
287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3582  hypothetical protein  36.92 
 
 
303 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0102309  normal  0.126925 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4257  hypothetical protein  31.88 
 
 
287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0178  hypothetical protein  33.44 
 
 
287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.952539  hitchhiker  0.0000731437 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3605  hypothetical protein  31.97 
 
 
287 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3778  hypothetical protein  31.97 
 
 
287 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3848  hypothetical protein  32.32 
 
 
288 aa  130  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5548  hypothetical protein  34.2 
 
 
287 aa  130  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1056  hypothetical protein  30.25 
 
 
291 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000165495  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0562  yicC family protein  33.89 
 
 
287 aa  130  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3207  hypothetical protein  32.31 
 
 
287 aa  130  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0716  domain of unknown function DUF1732  33.89 
 
 
287 aa  130  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.637431  hitchhiker  0.00000131074 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4116  hypothetical protein  30.85 
 
 
287 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.124592  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4196  hypothetical protein  31.72 
 
 
287 aa  129  8.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0846841  normal  0.629685 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3480  hypothetical protein  31.99 
 
 
295 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1086  hypothetical protein  30.84 
 
 
288 aa  128  9.000000000000001e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4405  hypothetical protein  29.69 
 
 
287 aa  128  9.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4021  hypothetical protein  32.21 
 
 
288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0107  hypothetical protein  30.2 
 
 
287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4569  hypothetical protein  31.63 
 
 
287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000202204 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3996  hypothetical protein  31.76 
 
 
287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0095  hypothetical protein  31.19 
 
 
287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.403752  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2003  hypothetical protein  30.23 
 
 
294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0322  domain of unknown function DUF1732  32.89 
 
 
295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.563369 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4848  hypothetical protein  30.38 
 
 
287 aa  127  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0744075  hitchhiker  0.0000405788 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>