242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0407 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0407  hypothetical protein  100 
 
 
295 aa  597  1e-170  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.122152  normal  0.436876 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0372  hypothetical protein  69.07 
 
 
291 aa  410  1e-114  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.816164  normal  0.284607 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0305  hypothetical protein  64.41 
 
 
295 aa  389  1e-107  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000735483  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0403  hypothetical protein  61.69 
 
 
295 aa  374  1e-102  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0196247  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1457  hypothetical protein  61.69 
 
 
295 aa  371  1e-102  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000500736  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0374  hypothetical protein  62.37 
 
 
300 aa  370  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00280201  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1774  hypothetical protein  60.68 
 
 
295 aa  352  5e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.593354  normal  0.167904 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0011  YicC domain protein  37.97 
 
 
292 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.272506  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2287  hypothetical protein  37.62 
 
 
291 aa  171  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0890  hypothetical protein  37.12 
 
 
292 aa  169  4e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000147276  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2328  hypothetical protein  37.12 
 
 
292 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0372766  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1239  hypothetical protein  34.33 
 
 
292 aa  165  9e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.369152  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2239  hypothetical protein  37.67 
 
 
292 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1033  domain of unknown function DUF1732  34.21 
 
 
293 aa  160  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2402  hypothetical protein  32.54 
 
 
293 aa  157  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0682346  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3896  hypothetical protein  32.99 
 
 
289 aa  155  7e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000579804  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2320  hypothetical protein  33.56 
 
 
292 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000274769  hitchhiker  0.00243432 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1317  hypothetical protein  32.09 
 
 
294 aa  155  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.269981  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1763  hypothetical protein  33.11 
 
 
290 aa  154  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0838  YicC domain protein  34.01 
 
 
293 aa  154  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.422723  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2881  hypothetical protein  33.89 
 
 
292 aa  154  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000426445  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3163  hypothetical protein  35.45 
 
 
292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0449219  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0676  hypothetical protein  32.31 
 
 
291 aa  153  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.106933  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3214  hypothetical protein  34.68 
 
 
292 aa  151  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000193402  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1049  hypothetical protein  33.67 
 
 
292 aa  151  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120663 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4196  hypothetical protein  32.76 
 
 
287 aa  149  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0846841  normal  0.629685 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2607  hypothetical protein  31.53 
 
 
291 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.034124  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1284  hypothetical protein  31.19 
 
 
292 aa  146  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00734721  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1721  hypothetical protein  32.33 
 
 
294 aa  147  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1912  hypothetical protein  33.11 
 
 
294 aa  146  5e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0397702  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2003  hypothetical protein  32 
 
 
294 aa  145  7.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1143  hypothetical protein  33.45 
 
 
292 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.37182  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0987  hypothetical protein  33.78 
 
 
292 aa  145  9e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00101858  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1056  hypothetical protein  31.19 
 
 
291 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000165495  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2574  hypothetical protein  34.66 
 
 
291 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0448816 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3632  hypothetical protein  32.47 
 
 
293 aa  144  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.101055 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1599  hypothetical protein  32.09 
 
 
292 aa  144  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000017463  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0417  hypothetical protein  32.89 
 
 
295 aa  144  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1631  hypothetical protein  32.76 
 
 
292 aa  142  7e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.176002 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2900  hypothetical protein  32.21 
 
 
293 aa  140  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2788  hypothetical protein  30.51 
 
 
291 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2693  hypothetical protein  30.51 
 
 
291 aa  139  6e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0138  hypothetical protein  31.53 
 
 
293 aa  139  7e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0296876 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1793  hypothetical protein  29.83 
 
 
293 aa  138  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1488  domain of unknown function DUF1732  31.65 
 
 
291 aa  137  2e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.283341 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3696  hypothetical protein  29.97 
 
 
291 aa  137  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2525  hypothetical protein  30.51 
 
 
291 aa  137  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3921  hypothetical protein  29.97 
 
 
291 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.831608  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3632  hypothetical protein  29.97 
 
 
291 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3916  hypothetical protein  29.97 
 
 
291 aa  136  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3724  hypothetical protein  29.97 
 
 
291 aa  136  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3614  hypothetical protein  29.97 
 
 
291 aa  136  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3972  hypothetical protein  29.97 
 
 
291 aa  136  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00569731  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4011  hypothetical protein  29.97 
 
 
291 aa  136  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3887  hypothetical protein  29.97 
 
 
291 aa  136  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000222822 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1946  hypothetical protein  32.2 
 
 
291 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1271  hypothetical protein  29.63 
 
 
291 aa  135  9e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00975001  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1316  domain of unknown function DUF1732  31.86 
 
 
292 aa  134  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02195  hypothetical protein  33.22 
 
 
281 aa  134  9.999999999999999e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2167  hypothetical protein  32.21 
 
 
284 aa  133  3e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4405  hypothetical protein  33.44 
 
 
287 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1698  hypothetical protein  30.07 
 
 
292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.466508  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1469  domain of unknown function DUF1732  32.89 
 
 
287 aa  132  7.999999999999999e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000162947  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4116  hypothetical protein  33.55 
 
 
287 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.124592  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0322  domain of unknown function DUF1732  30.91 
 
 
295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.563369 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1293  hypothetical protein  32.43 
 
 
287 aa  129  5.0000000000000004e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0956  hypothetical protein  33.78 
 
 
288 aa  129  7.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.253768  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3996  hypothetical protein  33.77 
 
 
287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0513  hypothetical protein  29.7 
 
 
296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0201327 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5843  domain of unknown function DUF1732  31.4 
 
 
326 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.534035 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0741  hypothetical protein  28.91 
 
 
286 aa  126  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04050  hypothetical protein  32.56 
 
 
287 aa  125  6e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4362  hypothetical protein  31.44 
 
 
288 aa  125  7e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.637906  normal  0.0170975 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2690  hypothetical protein  31.86 
 
 
290 aa  125  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.886781  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5548  hypothetical protein  33.33 
 
 
287 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2051  YicC domain protein  32.33 
 
 
293 aa  124  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.974794  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1679  hypothetical protein  29.63 
 
 
291 aa  124  2e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.699908  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0783  domain of unknown function DUF1732  29.59 
 
 
291 aa  124  2e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000478658  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0076  hypothetical protein  33.99 
 
 
287 aa  123  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0296  hypothetical protein  29.55 
 
 
293 aa  123  4e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1086  hypothetical protein  29.53 
 
 
288 aa  123  5e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4387  hypothetical protein  32.21 
 
 
287 aa  123  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.113802 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0046  hypothetical protein  32.25 
 
 
288 aa  122  7e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2721  hypothetical protein  30.77 
 
 
293 aa  122  8e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.151584  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0208  hypothetical protein  31.37 
 
 
287 aa  122  8e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0098  hypothetical protein  28.76 
 
 
294 aa  121  9.999999999999999e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.547485  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3684  hypothetical protein  31.89 
 
 
288 aa  121  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0517661 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3837  hypothetical protein  31.1 
 
 
287 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0095  hypothetical protein  31.88 
 
 
287 aa  121  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.403752  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0212  hypothetical protein  33.44 
 
 
287 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70430  hypothetical protein  32.33 
 
 
287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0319  hypothetical protein  30.64 
 
 
309 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4848  hypothetical protein  32.23 
 
 
287 aa  120  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0744075  hitchhiker  0.0000405788 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0131  hypothetical protein  33.44 
 
 
287 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4015  hypothetical protein  31.65 
 
 
287 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4061  hypothetical protein  31.65 
 
 
287 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.879365 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3934  hypothetical protein  31.65 
 
 
287 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.818058  hitchhiker  0.00001038 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3952  hypothetical protein  31.65 
 
 
287 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4122  hypothetical protein  31.65 
 
 
287 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.970694  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0048  hypothetical protein  32.32 
 
 
287 aa  119  6e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>