43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2268 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2268  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 191 aa  393  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.939343  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1526  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 189 aa  160  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.275422  normal  0.274021 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1859  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 189 aa  160  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000211579 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2482  putative transcriptional regulator  43.01 
 
 		 192 aa  160  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.240034  hitchhiker  0.00659194 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1378  putative transcriptional regulator  43.46 
 
 		 190 aa  159  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1871  putative transcriptional regulator  48.04 
 
 		 195 aa  154  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459421  normal  0.517037 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1389  hypothetical protein  48.78 
 
 		 201 aa  154  9e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0522  putative transcriptional regulator  42.94 
 
 		 171 aa  152  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1721  hypothetical protein  49.39 
 
 		 188 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.16947 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3813  putative transcriptional regulator  45.51 
 
 		 198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0334125  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3806  putative transcriptional regulator  44.51 
 
 		 202 aa  145  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0679  hypothetical protein  43.9 
 
 		 199 aa  144  7.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0369  putative transcriptional regulator  44.97 
 
 		 177 aa  144  8.000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0231  hypothetical protein  42.68 
 
 		 170 aa  142  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3312  hypothetical protein  42.68 
 
 		 170 aa  141  6e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2982  hypothetical protein  42.68 
 
 		 170 aa  141  6e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.337432  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2110  hypothetical protein  42.68 
 
 		 170 aa  141  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0255  hypothetical protein  42.68 
 
 		 170 aa  141  6e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0267  hypothetical protein  42.68 
 
 		 170 aa  141  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.443675  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3366  hypothetical protein  42.68 
 
 		 170 aa  141  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6383  putative transcriptional regulator  41.14 
 
 		 190 aa  141  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2947  putative transcriptional regulator  41.46 
 
 		 170 aa  140  8e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.749062 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3031  putative transcriptional regulator  41.46 
 
 		 170 aa  140  9e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.496812 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3055  putative transcriptional regulator  41.46 
 
 		 170 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0246272 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3081  putative transcriptional regulator  41.46 
 
 		 190 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0196  hypothetical protein  41.46 
 
 		 170 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2902  putative transcriptional regulator  41.46 
 
 		 170 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.146319 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3740  putative transcriptional regulator  40.85 
 
 		 170 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.584444 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0450  hypothetical protein  42.07 
 
 		 170 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3036  putative transcriptional regulator  41.46 
 
 		 170 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2422  putative transcriptional regulator  41.46 
 
 		 170 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.435106  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1409  putative transcriptional regulator  43.98 
 
 		 178 aa  138  3.9999999999999997e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.257656  normal  0.0711921 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3543  putative transcriptional regulator  42.07 
 
 		 170 aa  137  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.397492  normal  0.716751 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0636  hypothetical protein  42.68 
 
 		 202 aa  135  3.0000000000000003e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5798  putative transcriptional regulator  42.6 
 
 		 176 aa  129  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0102274 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3377  putative transcriptional regulator  41.28 
 
 		 214 aa  118  7e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.632123  normal  0.34347 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5431  hypothetical protein  30.73 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.396983  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2469  putative transcriptional regulator  30.81 
 
 		 200 aa  71.6  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.213957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2470  putative transcriptional regulator  30.54 
 
 		 207 aa  71.2  0.000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7176  hypothetical protein  35.98 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1332  hypothetical protein  28.66 
 
 		 178 aa  64.3  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000254563 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1415  HxlR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 108 aa  42  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0193281 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3861  transcriptional regulator, MarR family  29.57 
 
 		 150 aa  42  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.611772  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>