41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3081 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_3081  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 190 aa  388  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6383  putative transcriptional regulator  95.26 
 
 		 190 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2947  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 170 aa  348  4e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.749062 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3036  putative transcriptional regulator  98.24 
 
 		 170 aa  343  1e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2422  putative transcriptional regulator  98.24 
 
 		 170 aa  343  1e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.435106  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3055  putative transcriptional regulator  97.65 
 
 		 170 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0246272 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3031  putative transcriptional regulator  95.88 
 
 		 170 aa  332  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.496812 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0267  hypothetical protein  91.18 
 
 		 170 aa  319  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.443675  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0255  hypothetical protein  91.18 
 
 		 170 aa  319  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2110  hypothetical protein  91.18 
 
 		 170 aa  319  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2982  hypothetical protein  91.18 
 
 		 170 aa  319  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.337432  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3366  hypothetical protein  91.18 
 
 		 170 aa  319  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3312  hypothetical protein  91.18 
 
 		 170 aa  319  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0231  hypothetical protein  91.76 
 
 		 170 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0450  hypothetical protein  90.59 
 
 		 170 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0196  hypothetical protein  88.82 
 
 		 170 aa  311  2.9999999999999996e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3740  putative transcriptional regulator  88.82 
 
 		 170 aa  311  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.584444 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2902  putative transcriptional regulator  85.88 
 
 		 170 aa  304  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.146319 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0522  putative transcriptional regulator  59.88 
 
 		 171 aa  214  4e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2482  putative transcriptional regulator  61.21 
 
 		 192 aa  208  3e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.240034  hitchhiker  0.00659194 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1378  putative transcriptional regulator  61.21 
 
 		 190 aa  209  3e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1389  hypothetical protein  55.62 
 
 		 201 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1859  putative transcriptional regulator  56.1 
 
 		 189 aa  194  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000211579 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1526  putative transcriptional regulator  56.1 
 
 		 189 aa  194  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.275422  normal  0.274021 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1871  putative transcriptional regulator  56.1 
 
 		 195 aa  193  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459421  normal  0.517037 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5798  putative transcriptional regulator  55.49 
 
 		 176 aa  176  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0102274 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1721  hypothetical protein  54.6 
 
 		 188 aa  174  8e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.16947 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0369  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 177 aa  169  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3377  putative transcriptional regulator  50.88 
 
 		 214 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.632123  normal  0.34347 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3806  putative transcriptional regulator  43.78 
 
 		 202 aa  158  4e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0679  hypothetical protein  44.44 
 
 		 199 aa  157  7e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3543  putative transcriptional regulator  42.33 
 
 		 170 aa  155  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.397492  normal  0.716751 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3813  putative transcriptional regulator  48.17 
 
 		 198 aa  153  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0334125  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1409  putative transcriptional regulator  48.17 
 
 		 178 aa  151  5.9999999999999996e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.257656  normal  0.0711921 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0636  hypothetical protein  42.22 
 
 		 202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2268  putative transcriptional regulator  41.46 
 
 		 191 aa  140  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.939343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2470  putative transcriptional regulator  32.34 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5431  hypothetical protein  23.12 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.396983  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2469  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 200 aa  67.8  0.00000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.213957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7176  hypothetical protein  32.1 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1332  hypothetical protein  28.29 
 
 		 178 aa  62  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000254563 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>