41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1409 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1409  putative transcriptional regulator  100 
 
 
178 aa  364  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.257656  normal  0.0711921 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0369  putative transcriptional regulator  56.17 
 
 
177 aa  193  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440997  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5798  putative transcriptional regulator  52.07 
 
 
176 aa  184  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0102274 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0679  hypothetical protein  49.14 
 
 
199 aa  179  1e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1389  hypothetical protein  50.57 
 
 
201 aa  180  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3806  putative transcriptional regulator  49.14 
 
 
202 aa  180  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1871  putative transcriptional regulator  52.76 
 
 
195 aa  173  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459421  normal  0.517037 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0522  putative transcriptional regulator  50.61 
 
 
171 aa  171  5e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1526  putative transcriptional regulator  51.85 
 
 
189 aa  171  6.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.275422  normal  0.274021 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1859  putative transcriptional regulator  51.85 
 
 
189 aa  170  7.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211579 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0636  hypothetical protein  47.43 
 
 
202 aa  169  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1378  putative transcriptional regulator  52.15 
 
 
190 aa  168  3e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2482  putative transcriptional regulator  52.15 
 
 
192 aa  168  4e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.240034  hitchhiker  0.00659194 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3031  putative transcriptional regulator  47.56 
 
 
170 aa  160  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.496812 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0196  hypothetical protein  46.34 
 
 
170 aa  159  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2422  putative transcriptional regulator  47.56 
 
 
170 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.435106  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2947  putative transcriptional regulator  48.17 
 
 
170 aa  159  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.749062 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2902  putative transcriptional regulator  46.34 
 
 
170 aa  159  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.146319 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3036  putative transcriptional regulator  47.56 
 
 
170 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3055  putative transcriptional regulator  47.56 
 
 
170 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0246272 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3740  putative transcriptional regulator  46.34 
 
 
170 aa  159  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.584444 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3081  putative transcriptional regulator  48.17 
 
 
190 aa  159  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6383  putative transcriptional regulator  47.56 
 
 
190 aa  159  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2110  hypothetical protein  47.56 
 
 
170 aa  157  9e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0255  hypothetical protein  47.56 
 
 
170 aa  157  9e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0267  hypothetical protein  47.56 
 
 
170 aa  157  9e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.443675  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3366  hypothetical protein  47.56 
 
 
170 aa  157  9e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2982  hypothetical protein  47.56 
 
 
170 aa  157  9e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.337432  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3312  hypothetical protein  47.56 
 
 
170 aa  157  9e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0450  hypothetical protein  46.95 
 
 
170 aa  155  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0231  hypothetical protein  46.95 
 
 
170 aa  155  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1721  hypothetical protein  52.47 
 
 
188 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.16947 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3543  putative transcriptional regulator  44.31 
 
 
170 aa  150  7e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.397492  normal  0.716751 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3377  putative transcriptional regulator  49.11 
 
 
214 aa  148  5e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.632123  normal  0.34347 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2268  putative transcriptional regulator  43.98 
 
 
191 aa  145  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.939343  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3813  putative transcriptional regulator  45.09 
 
 
198 aa  142  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0334125  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1332  hypothetical protein  30.06 
 
 
178 aa  87  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000254563 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2469  putative transcriptional regulator  34.9 
 
 
200 aa  82  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.213957  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2470  putative transcriptional regulator  31.9 
 
 
207 aa  79.3  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7176  hypothetical protein  31.64 
 
 
210 aa  70.1  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5431  hypothetical protein  26.54 
 
 
184 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.396983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>