41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3377 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3377  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 214 aa  442  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.632123  normal  0.34347 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0231  hypothetical protein  55.03 
 
 		 170 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2110  hypothetical protein  54.44 
 
 		 170 aa  180  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3312  hypothetical protein  54.44 
 
 		 170 aa  180  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3740  putative transcriptional regulator  52.94 
 
 		 170 aa  180  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.584444 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2982  hypothetical protein  54.44 
 
 		 170 aa  180  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.337432  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0255  hypothetical protein  54.44 
 
 		 170 aa  180  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0267  hypothetical protein  54.44 
 
 		 170 aa  180  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.443675  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3366  hypothetical protein  54.44 
 
 		 170 aa  180  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0450  hypothetical protein  53.85 
 
 		 170 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0196  hypothetical protein  52.35 
 
 		 170 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2902  putative transcriptional regulator  52.07 
 
 		 170 aa  176  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.146319 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6383  putative transcriptional regulator  50.88 
 
 		 190 aa  176  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0522  putative transcriptional regulator  52.44 
 
 		 171 aa  175  5e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1389  hypothetical protein  46.97 
 
 		 201 aa  175  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3081  putative transcriptional regulator  50.88 
 
 		 190 aa  174  7e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2422  putative transcriptional regulator  50.89 
 
 		 170 aa  174  8e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.435106  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3036  putative transcriptional regulator  50.89 
 
 		 170 aa  174  8e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3055  putative transcriptional regulator  50.89 
 
 		 170 aa  174  8e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0246272 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3031  putative transcriptional regulator  51.48 
 
 		 170 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.496812 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2947  putative transcriptional regulator  50.89 
 
 		 170 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.749062 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1526  putative transcriptional regulator  48.13 
 
 		 189 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.275422  normal  0.274021 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2482  putative transcriptional regulator  48.69 
 
 		 192 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.240034  hitchhiker  0.00659194 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1378  putative transcriptional regulator  52.07 
 
 		 190 aa  171  5.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1859  putative transcriptional regulator  47.59 
 
 		 189 aa  171  6.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000211579 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1871  putative transcriptional regulator  53.37 
 
 		 195 aa  170  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459421  normal  0.517037 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3813  putative transcriptional regulator  51.72 
 
 		 198 aa  164  8e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0334125  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5798  putative transcriptional regulator  48.3 
 
 		 176 aa  159  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0102274 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0369  putative transcriptional regulator  46.89 
 
 		 177 aa  155  6e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440997  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0679  hypothetical protein  47.27 
 
 		 199 aa  153  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1409  putative transcriptional regulator  49.11 
 
 		 178 aa  152  2.9999999999999998e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.257656  normal  0.0711921 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3543  putative transcriptional regulator  44.38 
 
 		 170 aa  151  8e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.397492  normal  0.716751 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1721  hypothetical protein  51.52 
 
 		 188 aa  150  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.16947 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3806  putative transcriptional regulator  46.67 
 
 		 202 aa  149  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0636  hypothetical protein  46.06 
 
 		 202 aa  145  5e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2268  putative transcriptional regulator  41.28 
 
 		 191 aa  133  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.939343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7176  hypothetical protein  36.81 
 
 		 210 aa  90.1  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2469  putative transcriptional regulator  34.97 
 
 		 200 aa  85.5  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.213957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2470  putative transcriptional regulator  29.32 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1332  hypothetical protein  29.45 
 
 		 178 aa  75.9  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000254563 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5431  hypothetical protein  25.7 
 
 		 184 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.396983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>