41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0196 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A0196  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  347  3e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3740  putative transcriptional regulator  98.24 
 
 		 170 aa  342  1e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.584444 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2902  putative transcriptional regulator  92.94 
 
 		 170 aa  331  3e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.146319 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0231  hypothetical protein  90.59 
 
 		 170 aa  322  2e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0267  hypothetical protein  90 
 
 		 170 aa  321  4e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.443675  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3312  hypothetical protein  90 
 
 		 170 aa  321  4e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0255  hypothetical protein  90 
 
 		 170 aa  321  4e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2110  hypothetical protein  90 
 
 		 170 aa  321  4e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2982  hypothetical protein  90 
 
 		 170 aa  321  4e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.337432  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3366  hypothetical protein  90 
 
 		 170 aa  321  4e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3031  putative transcriptional regulator  89.41 
 
 		 170 aa  320  4e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.496812 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0450  hypothetical protein  89.41 
 
 		 170 aa  319  9.000000000000001e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6383  putative transcriptional regulator  88.82 
 
 		 190 aa  313  5e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2422  putative transcriptional regulator  88.24 
 
 		 170 aa  311  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.435106  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3036  putative transcriptional regulator  88.24 
 
 		 170 aa  311  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3081  putative transcriptional regulator  88.82 
 
 		 190 aa  311  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2947  putative transcriptional regulator  88.82 
 
 		 170 aa  311  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.749062 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3055  putative transcriptional regulator  88.24 
 
 		 170 aa  311  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0246272 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0522  putative transcriptional regulator  60.98 
 
 		 171 aa  216  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2482  putative transcriptional regulator  59.76 
 
 		 192 aa  212  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.240034  hitchhiker  0.00659194 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1378  putative transcriptional regulator  59.76 
 
 		 190 aa  212  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1389  hypothetical protein  56.73 
 
 		 201 aa  200  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1526  putative transcriptional regulator  57.32 
 
 		 189 aa  197  6e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.275422  normal  0.274021 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1859  putative transcriptional regulator  57.32 
 
 		 189 aa  197  6e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000211579 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1871  putative transcriptional regulator  57.32 
 
 		 195 aa  196  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459421  normal  0.517037 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5798  putative transcriptional regulator  54.27 
 
 		 176 aa  177  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0102274 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1721  hypothetical protein  56.44 
 
 		 188 aa  177  5.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.16947 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0369  putative transcriptional regulator  52.15 
 
 		 177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3377  putative transcriptional regulator  52.35 
 
 		 214 aa  167  5e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.632123  normal  0.34347 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3543  putative transcriptional regulator  45.12 
 
 		 170 aa  164  6.9999999999999995e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.397492  normal  0.716751 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3806  putative transcriptional regulator  46.95 
 
 		 202 aa  157  9e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0679  hypothetical protein  46.34 
 
 		 199 aa  155  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1409  putative transcriptional regulator  46.34 
 
 		 178 aa  151  2.9999999999999998e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.257656  normal  0.0711921 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3813  putative transcriptional regulator  46.34 
 
 		 198 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0334125  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0636  hypothetical protein  43.9 
 
 		 202 aa  144  8.000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2268  putative transcriptional regulator  41.46 
 
 		 191 aa  140  8e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.939343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2470  putative transcriptional regulator  31.14 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2469  putative transcriptional regulator  29.25 
 
 		 200 aa  71.6  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.213957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1332  hypothetical protein  31.71 
 
 		 178 aa  68.9  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000254563 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5431  hypothetical protein  23.75 
 
 		 184 aa  67.4  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.396983  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7176  hypothetical protein  31.68 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>