41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0369 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0369  putative transcriptional regulator  100 
 
 
177 aa  359  1e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440997  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5798  putative transcriptional regulator  59.89 
 
 
176 aa  197  9e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0102274 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1859  putative transcriptional regulator  54.6 
 
 
189 aa  189  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211579 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1526  putative transcriptional regulator  55.88 
 
 
189 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.275422  normal  0.274021 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1389  hypothetical protein  54.24 
 
 
201 aa  186  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1409  putative transcriptional regulator  56.17 
 
 
178 aa  187  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.257656  normal  0.0711921 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3806  putative transcriptional regulator  52.15 
 
 
202 aa  186  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1871  putative transcriptional regulator  58.28 
 
 
195 aa  184  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459421  normal  0.517037 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0679  hypothetical protein  51.53 
 
 
199 aa  183  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1721  hypothetical protein  55.93 
 
 
188 aa  180  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.16947 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1378  putative transcriptional regulator  52.54 
 
 
190 aa  178  4e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2482  putative transcriptional regulator  52.54 
 
 
192 aa  177  5.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.240034  hitchhiker  0.00659194 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2902  putative transcriptional regulator  53.99 
 
 
170 aa  176  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.146319 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0522  putative transcriptional regulator  51.85 
 
 
171 aa  175  3e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6383  putative transcriptional regulator  50.6 
 
 
190 aa  174  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3055  putative transcriptional regulator  50.6 
 
 
170 aa  174  8e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0246272 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0636  hypothetical protein  49.69 
 
 
202 aa  174  8e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2422  putative transcriptional regulator  50.6 
 
 
170 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.435106  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3740  putative transcriptional regulator  52.76 
 
 
170 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.584444 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3036  putative transcriptional regulator  50.6 
 
 
170 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0196  hypothetical protein  52.15 
 
 
170 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2947  putative transcriptional regulator  50 
 
 
170 aa  170  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.749062 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3081  putative transcriptional regulator  50 
 
 
190 aa  169  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0255  hypothetical protein  52.15 
 
 
170 aa  168  4e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0267  hypothetical protein  52.15 
 
 
170 aa  168  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.443675  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3366  hypothetical protein  52.15 
 
 
170 aa  168  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2110  hypothetical protein  52.15 
 
 
170 aa  168  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3312  hypothetical protein  52.15 
 
 
170 aa  168  4e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2982  hypothetical protein  52.15 
 
 
170 aa  168  4e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.337432  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3031  putative transcriptional regulator  50.92 
 
 
170 aa  167  7e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.496812 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0450  hypothetical protein  51.53 
 
 
170 aa  167  8e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0231  hypothetical protein  51.53 
 
 
170 aa  167  9e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3543  putative transcriptional regulator  47.85 
 
 
170 aa  158  5e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.397492  normal  0.716751 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2268  putative transcriptional regulator  44.97 
 
 
191 aa  144  7.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.939343  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3377  putative transcriptional regulator  46.89 
 
 
214 aa  143  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.632123  normal  0.34347 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3813  putative transcriptional regulator  44.51 
 
 
198 aa  137  7e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0334125  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7176  hypothetical protein  33.71 
 
 
210 aa  67.8  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2469  putative transcriptional regulator  26.11 
 
 
200 aa  65.9  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.213957  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1332  hypothetical protein  25.66 
 
 
178 aa  63.5  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000254563 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2470  putative transcriptional regulator  28.4 
 
 
207 aa  59.3  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5431  hypothetical protein  27.61 
 
 
184 aa  57  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.396983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>