41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1871 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1871  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 195 aa  397  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459421  normal  0.517037 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1389  hypothetical protein  83.58 
 
 		 201 aa  337  5.9999999999999996e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1859  putative transcriptional regulator  77.49 
 
 		 189 aa  289  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000211579 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1526  putative transcriptional regulator  78.69 
 
 		 189 aa  287  5.0000000000000004e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.275422  normal  0.274021 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1721  hypothetical protein  79.66 
 
 		 188 aa  260  6.999999999999999e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.16947 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1378  putative transcriptional regulator  62.09 
 
 		 190 aa  224  8e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2482  putative transcriptional regulator  61.41 
 
 		 192 aa  222  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.240034  hitchhiker  0.00659194 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0522  putative transcriptional regulator  61.11 
 
 		 171 aa  216  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2902  putative transcriptional regulator  57.32 
 
 		 170 aa  201  8e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.146319 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0196  hypothetical protein  57.32 
 
 		 170 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3031  putative transcriptional regulator  56.71 
 
 		 170 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.496812 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3036  putative transcriptional regulator  56.71 
 
 		 170 aa  195  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2422  putative transcriptional regulator  56.71 
 
 		 170 aa  195  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.435106  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3055  putative transcriptional regulator  56.71 
 
 		 170 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0246272 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6383  putative transcriptional regulator  56.71 
 
 		 190 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3740  putative transcriptional regulator  57.32 
 
 		 170 aa  194  6e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.584444 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2947  putative transcriptional regulator  56.1 
 
 		 170 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.749062 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3081  putative transcriptional regulator  56.1 
 
 		 190 aa  193  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2982  hypothetical protein  56.1 
 
 		 170 aa  191  5e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.337432  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3366  hypothetical protein  56.1 
 
 		 170 aa  191  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0267  hypothetical protein  56.1 
 
 		 170 aa  191  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.443675  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0255  hypothetical protein  56.1 
 
 		 170 aa  191  5e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3312  hypothetical protein  56.1 
 
 		 170 aa  191  5e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2110  hypothetical protein  56.1 
 
 		 170 aa  191  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0450  hypothetical protein  55.49 
 
 		 170 aa  190  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0231  hypothetical protein  55.49 
 
 		 170 aa  190  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0369  putative transcriptional regulator  58.28 
 
 		 177 aa  184  5e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1409  putative transcriptional regulator  52.76 
 
 		 178 aa  170  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.257656  normal  0.0711921 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3806  putative transcriptional regulator  45.7 
 
 		 202 aa  165  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0679  hypothetical protein  45.03 
 
 		 199 aa  164  5.9999999999999996e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3813  putative transcriptional regulator  51.53 
 
 		 198 aa  160  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0334125  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0636  hypothetical protein  43.98 
 
 		 202 aa  156  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3377  putative transcriptional regulator  53.37 
 
 		 214 aa  154  6e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.632123  normal  0.34347 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2268  putative transcriptional regulator  48.04 
 
 		 191 aa  154  6e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.939343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5798  putative transcriptional regulator  50.92 
 
 		 176 aa  150  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0102274 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3543  putative transcriptional regulator  44.79 
 
 		 170 aa  147  7e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.397492  normal  0.716751 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1332  hypothetical protein  30.97 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000254563 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2470  putative transcriptional regulator  29.19 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2469  putative transcriptional regulator  34 
 
 		 200 aa  64.7  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.213957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7176  hypothetical protein  34 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5431  hypothetical protein  24.84 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.396983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>