More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3099 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3099  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 
187 aa  373  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3787  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  37.84 
 
 
199 aa  120  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1741  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.1 
 
 
197 aa  117  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.417007  normal  0.368998 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0568  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  38.38 
 
 
192 aa  114  6.9999999999999995e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.842156  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3111  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.51 
 
 
193 aa  107  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.684125  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2000  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.65 
 
 
200 aa  103  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0357  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.95 
 
 
185 aa  97.4  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.712618  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0272  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.2 
 
 
256 aa  91.7  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0889  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.16 
 
 
248 aa  90.5  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2481  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  36.02 
 
 
245 aa  89  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.57969  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0260  Thioredoxin-disulfide reductase  41.8 
 
 
318 aa  88.6  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0215312 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1622  thioredoxin-disulfide reductase  36.91 
 
 
309 aa  87  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.987193  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0542  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.9 
 
 
302 aa  85.9  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1573  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.66 
 
 
243 aa  85.5  5e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.129306  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0912  Thioredoxin-disulfide reductase  36.67 
 
 
305 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2151  thioredoxin reductase, putative  35.62 
 
 
297 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1945  thioredoxin-disulfide reductase  33.76 
 
 
297 aa  82.4  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000367983  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  41.41 
 
 
326 aa  81.6  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1252  Thioredoxin-disulfide reductase  50.46 
 
 
327 aa  80.9  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0393  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.24 
 
 
242 aa  79.7  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.19159  normal  0.171369 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1191  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.15 
 
 
205 aa  79.3  0.00000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.015621  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0626  thioredoxin-disulfide reductase  42.99 
 
 
320 aa  79.3  0.00000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0781  Thioredoxin reductase-like protein  31 
 
 
333 aa  78.6  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0360  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.34 
 
 
291 aa  78.2  0.00000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000662719  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0723  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.12 
 
 
321 aa  78.2  0.00000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2879  thioredoxin reductase  42.34 
 
 
312 aa  76.3  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1150  thioredoxin-disulfide reductase  36.72 
 
 
299 aa  75.9  0.0000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3951  thioredoxin reductase  39.81 
 
 
314 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  40.54 
 
 
332 aa  73.2  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18300  thioredoxin reductase  36.7 
 
 
303 aa  73.6  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  39.81 
 
 
314 aa  73.2  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0901  Thioredoxin-disulfide reductase  41.07 
 
 
313 aa  73.6  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  34.65 
 
 
306 aa  72.8  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl064  thioredoxin reductase NADPH  38.98 
 
 
311 aa  72.8  0.000000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  39.81 
 
 
314 aa  72.8  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2148  thioredoxin reductase  40.19 
 
 
327 aa  72.4  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2891  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.75 
 
 
307 aa  72  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.703183  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  41.07 
 
 
348 aa  72  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4536  thioredoxin reductase  36.61 
 
 
348 aa  72  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0776  thioredoxin-disulfide reductase  40.19 
 
 
321 aa  71.2  0.000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.624753  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0477  alkyl hydroperoxide reductase F subunit  39.81 
 
 
555 aa  70.9  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000501172  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4637  thioredoxin reductase  35.2 
 
 
456 aa  70.9  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000231293  normal  0.140967 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0623  thioredoxin reductase  37.84 
 
 
459 aa  70.9  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.66148  normal  0.453769 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  41.67 
 
 
325 aa  70.5  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  40.74 
 
 
319 aa  70.5  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0473  thioredoxin reductase  40.74 
 
 
314 aa  70.5  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.499551 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3578  thioredoxin reductase  39.81 
 
 
309 aa  70.9  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166603  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  40.74 
 
 
310 aa  69.7  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3812  thioredoxin reductase  36.8 
 
 
460 aa  69.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  37.96 
 
 
310 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  38.74 
 
 
304 aa  69.7  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2414  thioredoxin reductase  42.2 
 
 
348 aa  70.1  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.301949 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1892  thioredoxin reductase  40.16 
 
 
324 aa  69.7  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0767369  hitchhiker  0.00000000000000724203 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  33.86 
 
 
306 aa  70.1  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0756  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.12 
 
 
202 aa  69.3  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0600  thioredoxin reductase  37.61 
 
 
317 aa  69.3  0.00000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00298127  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1704  thioredoxin-disulfide reductase  38.32 
 
 
321 aa  69.3  0.00000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.473306  normal  0.0188738 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2471  thioredoxin-disulfide reductase  37.27 
 
 
302 aa  68.9  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1325  thioredoxin reductase  37.38 
 
 
311 aa  68.9  0.00000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000005061  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1278  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  39.62 
 
 
316 aa  68.2  0.00000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0294  thioredoxin reductase  39.82 
 
 
304 aa  68.2  0.00000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1247  thioredoxin reductase  35.04 
 
 
458 aa  68.2  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  39.29 
 
 
319 aa  68.2  0.00000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2606  Thioredoxin-disulfide reductase  36.11 
 
 
309 aa  67.8  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000234008  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  33.94 
 
 
306 aa  67.8  0.00000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13401  putative thioredoxin reductase  34.78 
 
 
458 aa  67.8  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.327116  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4965  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.74 
 
 
466 aa  67  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0772589 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  36.11 
 
 
304 aa  67.4  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13251  putative thioredoxin reductase  34.78 
 
 
458 aa  67.4  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3654  thioredoxin reductase  35.25 
 
 
458 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24215  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0553  thioredoxin reductase  37.3 
 
 
316 aa  66.6  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.860182  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1057  thioredoxin reductase  34.92 
 
 
322 aa  66.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00951777  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2014  thioredoxin reductase  33.07 
 
 
317 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000856982  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0963  thioredoxin reductase  34.92 
 
 
322 aa  66.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000679645  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1959  thioredoxin reductase  33.86 
 
 
317 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000155114  normal  0.552411 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2017  thioredoxin reductase  33.86 
 
 
317 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000213161  normal  0.0579886 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1023  thioredoxin reductase  34.92 
 
 
322 aa  66.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00170984  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6387  response regulator receiver modulated FAD- dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.84 
 
 
565 aa  66.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.0107564 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2303  thioredoxin reductase  33.86 
 
 
317 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2218  thioredoxin reductase  33.07 
 
 
317 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123307  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2008  thioredoxin reductase  29.74 
 
 
306 aa  65.9  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.141519 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2188  thioredoxin reductase  33.07 
 
 
317 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000784195  normal  0.0220787 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7026  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.06 
 
 
423 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.32621 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1469  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.06 
 
 
556 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0649357  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6359  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.06 
 
 
556 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.120399  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2047  thioredoxin reductase  33.86 
 
 
317 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000827938  hitchhiker  0.00204856 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1047  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  35.09 
 
 
348 aa  66.2  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.333323  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2152  thioredoxin reductase  33.07 
 
 
317 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485942  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4276  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.7 
 
 
330 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  37.61 
 
 
311 aa  65.5  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0214  thioredoxin reductase  41.82 
 
 
329 aa  65.5  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4061  thioredoxin reductase  33.6 
 
 
453 aa  65.9  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3686  thioredoxin reductase  32.79 
 
 
316 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000489943  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1503  thioredoxin-disulfide reductase  34.15 
 
 
292 aa  65.1  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.60655  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1139  thioredoxin-disulfide reductase  37.84 
 
 
293 aa  65.5  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.234557  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2943  thioredoxin reductase  30.7 
 
 
333 aa  65.1  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1713  thioredoxin reductase  34.75 
 
 
317 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000742143  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2772  thioredoxin reductase  37.93 
 
 
321 aa  65.1  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13151  putative thioredoxin reductase  34.78 
 
 
458 aa  65.1  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3781  thioredoxin reductase  32.79 
 
 
316 aa  65.1  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>