28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0647 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0647  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 68 aa  143  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  45.83 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0029  Cro/CI family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 67 aa  47.8  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.735967  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  35.38 
 
 		 459 aa  47.4  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1885  transcriptional regulator, XRE family  31.34 
 
 		 68 aa  47.4  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000259455 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 115 aa  47  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  45.83 
 
 		 123 aa  46.2  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4372  helix-turn-helix domain-containing protein  38.98 
 
 		 87 aa  44.7  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0153789  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2840  transcriptional regulator, XRE family  40.38 
 
 		 176 aa  45.1  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0073  helix-turn-helix domain-containing protein  44.44 
 
 		 210 aa  45.1  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0064  XRE family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 266 aa  44.7  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0275  XRE family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 276 aa  42.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.12088  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2579  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000319411  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1339  putative prophage repressor  35.82 
 
 		 219 aa  42.7  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00520189 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0514  DNA-binding protein  34.92 
 
 		 328 aa  42  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00329657 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1254  transcriptional regulator, XRE family  30.3 
 
 		 364 aa  42.7  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 380 aa  42.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  31.67 
 
 		 227 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  34.92 
 
 		 243 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2878  transcriptional regulator, XRE family  30.77 
 
 		 322 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00252317  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1350  DNA-binding protein  37.5 
 
 		 62 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1286  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 		 197 aa  41.6  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0709374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5696  XRE family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 66 aa  41.2  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0012  Cro/CI family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 189 aa  41.2  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2168  protein of unknown function DUF955  37.5 
 
 		 386 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1409  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 75 aa  40.8  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.503834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2560  transcriptional regulator, XRE family  29.69 
 
 		 73 aa  40.8  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2412  hypothetical protein  30.51 
 
 		 66 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.364776  normal  0.166132 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>