31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2374 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2374  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0158703  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2481  hypothetical protein  72.55 
 
 		 244 aa  306  1.0000000000000001e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.03219e-17  normal  1 
 
 
 
NC_009483  Gura_3287  hypothetical protein  64.32 
 
 		 215 aa  254  5e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000737257  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1240  hypothetical protein  62.03 
 
 		 227 aa  208  4e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.170908  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1165  hypothetical protein  54.5 
 
 		 215 aa  205  4e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0926  hypothetical protein  56.98 
 
 		 229 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  7.084000000000001e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3320  hypothetical protein  63.45 
 
 		 229 aa  186  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000562665  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  42.68 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2218  Lytic transglycosylase catalytic  39.19 
 
 		 618 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.70593 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2611  lytic transglycosylase catalytic  43.75 
 
 		 251 aa  49.7  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.59616 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0026  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase  32.56 
 
 		 495 aa  46.2  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.250795  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0798  lytic transglycosylase catalytic  38.54 
 
 		 351 aa  45.8  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.44501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2920  lytic transglycosylase, catalytic  33.78 
 
 		 587 aa  44.7  0.0009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.654046 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3580  peptidoglycan-binding LysM  38.82 
 
 		 544 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0139  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  29.47 
 
 		 451 aa  43.5  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.518176 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  35.35 
 
 		 197 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2149  Slt family transglycosylase  36 
 
 		 442 aa  43.5  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.20197  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1015  lytic transglycosylase, catalytic  31.03 
 
 		 292 aa  42.4  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0929  Lytic transglycosylase catalytic  31.03 
 
 		 300 aa  42.4  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.316405  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1200  lytic transglycosylase, catalytic  50 
 
 		 279 aa  42.4  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2042  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  31.75 
 
 		 617 aa  42.4  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130746  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1666  peptidoglycan-binding protein LysM  31.46 
 
 		 501 aa  42.4  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  41.38 
 
 		 206 aa  42  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0033  Lytic transglycosylase catalytic  39.19 
 
 		 365 aa  42  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  39.19 
 
 		 261 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000281259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1727  transglycosylase, SLT family  39.19 
 
 		 261 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000265036  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1836  transglycosylase, SLT family  39.73 
 
 		 259 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000572163  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1584  lytic transglycosylase catalytic  39.19 
 
 		 261 aa  41.6  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166498  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1758  transglycosylase, SLT family  39.19 
 
 		 261 aa  41.6  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000744  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  33.73 
 
 		 248 aa  41.6  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2728  Lytic transglycosylase catalytic  36.49 
 
 		 547 aa  41.2  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>